組織政見
組織一直堅持分離主義武裝鬥爭，主張在棉蘭老島建立一個獨立、嚴格的伊斯蘭國家。
組織發展
摩洛伊斯蘭解放陣線1978年從摩洛民族解放陣線分離後建立。初期力量極小，90年代後逐步壯大，1996年9月摩洛民族解放陣線與政府簽署和平協定後，部分不願接受政府軍警整編的人員陸續加入，其力量大增。現有成員15400人，各式武器11300餘件。
組織活動
政治和談
拉莫斯總統任內，與政府共進行了六輪低級別談判，但因雙方立場迥異而無實質進展。埃斯特拉達就任後，雙方於1998年8月簽署《關於推動棉蘭老和平進程協定》，9月，又簽署將各自前沿陣地部隊後撤5公里並實行停火的協定。但上述協定並未得到執行，武裝衝突時有發生。1999年，政府軍警部隊與摩伊游擊隊之間不斷發生衝突與交火，和談因菲參議院批准《菲美訪問部隊協定》等因素一再延遲至10月才開始。雙方和談小組於12月就談判規則與程式達成一致，決定2000年1月開始正式談判。
2010年摩伊方面的新任首席談判代表默哈格爾？伊克巴爾日前宣布，摩伊將努力爭取在菲南部棉蘭老地區建立一個亞國家，並以此與菲政府方面達成一項全面的和平協定。伊克巴爾說，亞國家的概念不意味著獨立，它仍將隸屬中央或國家政府，是菲律賓的一部分。亞國家建立後，摩伊將變為這個亞國家的一個過渡性機構，最終由摩洛人建立一個自己的政府。菲律賓政府23日對分離組織“摩洛伊斯蘭解放陣線”（摩伊）宣布不再尋求建立一個獨立國家表示歡迎，認為此舉有利於結束菲南部棉蘭老地區衝突。
區域自治
2012年4月25日，菲律賓“摩洛伊斯蘭解放陣線”（簡稱“摩伊解”）宣布，菲律賓政府同意在棉蘭老地區建立一個伊斯蘭“次國家”。
菲政府首席談判代表表示，菲政府已與“摩伊解”達成10項原則性共識，包括在棉蘭老地區建立新的自治政治實體，以取代棉蘭老穆斯林自治區。他解釋說，該政治實體並非獨立國家，而是屬於在菲律賓領土和主權範圍內的“次國家”。當地將建立一個內閣式的政府，但其國防、外交、外貿和貨幣政策等權力仍歸中央政府。
菲律賓總統阿基諾2012年10月7日宣布，菲最大反政府武裝“摩洛伊斯蘭解放陣線”已與政府達成協定，結束在南部棉蘭老地區的反政府活動。
軍事衝突
2005年
菲律賓武裝部隊2005年1月8日宣布，政府軍在27日對南部“摩洛伊斯蘭解放陣線”基地進行的空襲中至少打死40名反政府武裝人員和恐怖分子。
2008年
2008年8月，反政府武裝“摩洛伊斯蘭解放陣線”與政府軍在棉蘭老島南部再次爆發衝突，造成約30萬人流離失所。
2012年
菲律賓軍方2012年8月6日說，南部反政府武裝“摩洛伊斯蘭自由運動”5日夜間偷襲政府軍多達10處軍事設施，雙方發生激烈交火，導致1名政府軍士兵、5名反政府武裝分子和1名平民被打死，另有5人受傷，數千當地居民被迫逃離家園。6日清晨，反政府武裝又對駐守在安帕圖安鎮的政府軍士兵發動襲擊，雙方均無人員傷亡。菲政府軍一名指揮官說，武裝分子在偏遠的安帕圖安村扣留了約500名村民作為人質。一些村民說，武裝分子還破壞了電力供應設施，使他們自5日晚起一直斷電。
2015年
2015年1月25日上午菲律賓警方在馬京達瑙省馬馬薩帕諾鎮追捕犯罪嫌疑人—馬來西亞爆炸嫌犯本希爾（ZulkiflibinHir）時，遭“摩洛伊斯蘭自由運動”武裝人員攻擊，雙方隨後爆發交火。造成菲律賓警方突擊隊方面死亡人數43人，1人下落不明，另有11人受傷。
求和跡象
摩洛伊斯蘭解放陣線反政府武裝（MILF）在菲律賓交出第一批武器，這是和平進程的一部份。
菲律賓總統阿基諾出席在馬京達瑙的活動時，讚揚這是向前邁進的重要一步。
MILF將會停用75件武器，以顯示他們的和平承諾。
在2012年，政府和MILF簽署停火框架協定。
有145名MILF的武裝派別成員將被重新納入主流社會。
