拉氏構象圖

拉氏構象圖

拉氏構象圖,根據蛋白質中非鍵合原子間的最小接觸距離,確定了哪些成對二面角(Φ、Ψ)所規定的兩個相鄰肽單位的構象是允許的,哪些是不允許的,並且以Φ為橫坐標,以Ψ為縱坐標,在坐標圖上標出,該坐標圖稱拉氏構象圖(The Ramachandran Diagram)。可用來鑑定蛋白質構象是否合理。

⑴實線封閉區域

一般允許區,非鍵合原子間的距離大於一般允許距離,此區域內任何二面角確定的構象都是允許的,且構象穩定。

⑵虛線封閉區域

是最大允許區,非鍵合原子間的距離介於最小允許距離和一般允許距離之間,立體化學允許,但構象不夠穩定。

拉氏構象圖 拉氏構象圖

⑶虛線外區域

是不允許區,該區域內任何二面角確定的肽鏈構象,都是不允許的,此構象中非鍵合原子間距離小於最小允許距離,斥力大,構象極不穩定。

Gly的Φ、Ψ角允許範圍很大。

總之,由於原子基因之間不利的空間相互作用,肽鏈構象的範圍是很有限的,對非Gly胺基酸殘基一般允許區占全平面的7.7%,最大允許區占全平面22.5%。

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