密宗的本尊分寂靜本尊和憤怒本尊兩種。對於寂靜本尊，大家都可以接受；而對於憤怒本尊，不懂的人就自以為是地認為那是外道的神靈，不應該是佛教所供奉的對象。事實上，無論是寂靜本尊還是憤怒本尊，其本質都是佛的智慧顯現，二者之間沒有任何差別。譬如說，以純金塑造的一座佛像，大家都會以歡喜心頂禮膜拜，而同樣以純金打造的魔鬼形象，很多人都會怖畏反感。其實，二者用的材料都是純金，只是外形不同而已，本質是相同的。同樣，寂靜本尊和憤怒本尊也是相同本質的不同外觀，實際上都是如來藏的智慧顯現。
顯宗也承認如來藏，認為它是光明的、空性的，卻沒有提到如來藏可以有形形色色的顯現。而從密宗經典中卻可以了解到，如來藏是一切萬事萬物的本性，在凡夫的境界中，顯現為不清淨的世界；對證悟者來說，如來藏的顯現就是佛的壇城——寂靜本尊和憤怒本尊。
那為什麼本尊的外表不一——有寂靜、有憤怒的呢？這是為了度化一些特殊的眾生。本來魔鬼也可以用菩提心來調伏，釋尊成佛的時候，就是以慈悲菩提心調伏魔軍的，不過，只有具備佛陀那樣的能力之後，菩提心才可以起到應有的作用。針對有些很厲害的，前世福報非常大的大力魔鬼，利用菩提心就很難調伏。因為他的福報因緣，有些是嗔恨心所致，有些是惡願成熟才變成現在的樣子，故而與出離心和慈悲心的關係不大，要調伏這些魔鬼，一定要顯現憤怒金剛的形象才行。
按照正宗的密宗生起次第的修法，如果要修十天的話，則前七、八天修寂靜本尊，到最後兩、三天還需要將所有的寂靜本尊轉為憤怒本尊來修，有些人甚至一開始就修憤怒本尊，因為憤怒本尊的修法歷來障礙很少，而在修寂靜本尊時，處理不好就時常會遇到魔障，因此，修憤怒金剛比修寂靜本尊成就快。
從外表上看，憤怒金剛比一般的魔鬼還要兇惡，如果不懂其內在涵義，也許會被大家當成邪魔外道的鬼神。比如說，在憤怒金剛和護法的背後，都有熊熊燃燒的火焰，而寂靜本尊的背後卻是白光。實際上，這裡的火焰，代表佛的智慧。如同火可以燃燒一切一樣，智慧也可以斬斷所有的煩惱，所以用火焰來表示智慧；還有，在憤怒金剛的手裡捧的不是缽盂，而是天靈蓋，天靈蓋裡面裝的也不是水果、五穀等善妙之物，而是紅色的血，這又是什麼意思呢？血代表貪心，貪心又是墮落惡趣的主因。如果將血喝掉，就表示徹底消滅了對輪迴的貪心。
灌過頂的人，可以看一些密宗的書，以便進一步全方位地了解密宗的內在意義，倘若僅僅因為自己的無知，單從外表上進行判別，進而批駁密宗如何如何不好，這種做法非常愚蠢。密宗的修法十分殊勝，對一個真正的修行人來說，其快速推翻執著的作用，是顯而易見的。
——出自慈誠羅珠堪布開示《黑蛇總義》
