發展歷史
學院活動廈門大學藥學專業本科生招生 始於2004年。
2007年，學校開始招收藥物化學和藥理學碩士研究生，以及化學生物學碩士和細胞生物學博士研究生。
2008年，學校招收化學生物學博士研究生。
2009年，廈門大學藥學實驗教學示範中心獲評省級實驗教學示範中心。
2010年，在原廈門大學生物醫學研究院、醫學院藥學系的基礎上整合成立專門性的藥學學科教學科研機構廈門大學藥學院。12月，廈門大學生物醫學研究院成立。
2015年，學院開始招收轉化醫學學術型碩士和公共衛生專業型碩士。
廈門大學藥學院院牌揭幕儀式2017年，學院藥學虛擬仿真實驗教學中心獲省級立項。
辦學條件
院系設定
根據2017年12月學院官網信息顯示，學院設有1個教學系，設有1個本科專業。
| 系 | 專業及方向 | 授予學位 |
| 藥學系 | 藥學（靶點藥物與藥理學方向） | 理學 |
| 藥學（藥物化學與信息學方向） | 理學 | |
| 藥學（藥物製劑與工程學方向） | 理學 | |
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師資力量
根據2017年12月學院官網信息顯示，學院有國家中組部“千人計畫”6名（含“外專千人計畫”1名、“青年千人計畫”1名）、“長江學者”講座教授1名、國家“優秀青年科學基金”獲得者1名、教育部“新世紀優秀人才支持計畫”1名、“閩江學者”特聘教授1名、福建省“百人計畫”6名、福建省“傑出青年基金”獲得者2名、福建省“新世紀優秀人才支持計畫”3名、福建省特支計畫“雙百計畫”2名、福建省高校領軍人才1名、福建省在閩優秀台灣人才1名、廈門市“雙百計畫”9名；教師隊伍100%具有博士學歷，三成以上在國（境）外獲得博士學位，82%以上有一年以上海外學術經歷。
中組部“千人計畫”入選者：張曉坤、洪萬進、周強授、鄭立謀 、DieterA.Wolf 、許華曦
教育部“長江學者”講座教授：張曉坤
教育部“新世紀優秀人才支持計畫”：周虎
福建省“新世紀優秀人才支持計畫”：呂忠顯 等
教學建設
根據2017年12月學院官網信息顯示，學院有福建省人才培養創新實驗區1個，福建省實驗教學示範中心1個，福建省級虛擬仿真實驗教學中心1個。
福建省人才培養創新實驗區：藥學人才培養創新實驗區
福建省實驗教學示範中心：藥學實驗教學示範中心
福建省級虛擬仿真實驗教學中心：藥學虛擬仿真實驗教學中心
學科建設
根據2017年12月學院官網信息顯示，學院有一級學科碩士學位授權點1個，專業碩士學位點1個。
一級學科碩士學位授權點：藥學
專業碩士學位點：公共衛生
學術科研
科研平台
根據2017年12月學院官網信息顯示，學院有海洋活性物質功能、質量和安全性評價技術平台（國家海洋局-廈門市），國家海洋局“十三五”海洋經濟創新發展示範城市項目1個，教育部創新團隊1個，福建省重點實驗室1個，市級科研平台6個，共建研究機構3個；參與建設兩岸關係和平發展協同創新中心（國家級）、細胞信號網路協同創新中心（國家級）。
教育部創新團隊：“核受體腫瘤分子靶點與藥物開發”創新團隊
國家海洋局“十三五”海洋經濟創新發展示範城市項目：南方海洋創新藥物研發平台
福建省重點實驗室：福建省新藥物靶點研究重點實驗室
市級科研平台：廈門化學創新藥研發重大平台、廈門市代謝性疾病重點實驗室 、廈門市腫瘤細胞與分子診療重點實驗室、廈門市靶點新藥工程技術研究中心、廈門市林下中藥資源工程技術研究中心、廈門生物醫藥協同創新中心
共建研究機構：廈門大學藥學院―元生泰生物醫藥研發中心 、廈門大學藥學院--柘榮縣生物醫藥研發中心 、廈門大學藥學院--安特諾細胞醫藥研發中心
科研成果
2012年，學院6名教師獲國家自然科學基金資助。
| 負責人 | 項目名稱 | 項目類別 | 批准金額 |
| 周虎 | GSK3β對RXRα的磷酸化作用及其生物學功能研究 | 面上項目 | 80 |
| 吳振 | 基於深海功能基因的活性化合物及其形成機制研究 | 面上項目 | 67 |
| 徐陽 | 土貝母皂苷甲調控內質網應激及其生長途逕到凋亡途徑的轉變 | 青年科學基金項目 | 24 |
| 薛玉花 | P-TEFb複合體調控潛伏期HIV-1再激活的機制研究 | 青年科學基金項目 | 23 |
| 陳海峰 | 基於澱粉樣前體蛋白APP相關通路的小葉葡萄抗老年痴呆活性物質研究 | 青年科學基金項目 | 23 |
| 林挺 | 對四株筋骨草內生真菌次級代謝產物的研究及其抗癌機制的初步探索 | 青年科學基金項目 | 23 |
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合作交流
根據2017年12月學院官網信息顯示，學院與美國桑福德-伯納姆-普利貝斯醫學研究所、新加坡分子與細胞生物學研究院、美國辛辛那提大學藥學院、美國加州大學伯克利分校、英國紐卡斯爾大學生物醫學科學院、台北醫學大學藥學院等中國境外院校開展密切的教學、科研合作與交流，輸送學生出國長期或短期留學、交流，聯合培養國際型拔尖人才。
文化傳統
院徽
院徽院徽中心以抽象化的蛇杖代表現代醫學，以象徵生命密碼的DNA雙螺旋纏繞其上，以“藥”的拼音字頭“Y”字化成的雙手形狀環圍，喻意生物醫藥的跨學科結合。主體的深藍色體現專業權威的穩重感，DNA雙螺旋的鮮藍、鮮綠色顯示了希望和創新。“2010”是藥學院成立的年份。院徽綜合體現了藥學院融合生物、醫學與藥學等學科，運用現代科學的精尖技術和手段，進行國際前沿的高水平生物醫藥創新研究的發展特色，和以科技造福人類的使命目標。
文化活動
根據2017年12月學院官網信息顯示，學院開展了“十九大報告網上學，小萌來助力”、2017年武夷山採藥實習活動，組織學生參加廈門大學“我的青春我的夢”主題徵文活動、廈門大學第52屆翔安校區學生運動會。
現任領導
| 職務 | 姓名 |
| 院長 | 張曉坤 |
| 黨委書記 | 陳懷鋒 |
| 副院長 | 吳振、曾錦章 |
| 黨委副書記 | 陳夷、丁昌利 |
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