劇情簡介
劇照王老吉（ 謝鋼 飾）在平定一場鋪天蓋地的特大瘟疫中大顯身手，並無意中揭開了一個貪贓枉法的黑洞，被朝廷封為“嶺南藥俠”。相繼，他與奸商鬥智打假，與神父鬥法戒毒，與教主鬥勇肅殲，在百姓中傳為佳話；他應召入宮，在險象環生中，以絕技躲過一次次殺身之禍；他愛慕美麗端莊、武藝高強的賴姑娘，卻鬧出一系列令人捧腹的笑話。
分集劇情
第1集清朝光緒初年，嶺南慶州一帶瘟疫流行，一時間，赤地千里，白日鬼唱，死者不計其數，朝廷賑災的銀兩一撥再撥，災情卻毫不見起色。兩宮太后召集各位大臣商議對策。戶部大臣、太醫出身的吳一銘主動請纓，願為欽差，視察疫情，尋找良醫，平瘟賑災。嶺南知府孫子玉因有朝內神秘“主公”撐腰，勾結當地藥霸賀天章，貪污朝廷賑災銀兩，大發國難財。孫知府因被瘟疫所染，請神醫老吉救治。老吉開出天價，讓知府免費供藥，救治病人。孫知府為保命，只好忍痛割肉。俠女賴紅姑為了讓父親十八年前蒙受的冤屈大白於天下，隻身深入嶺南，途中，遇到一夥蒙面殺手與押鏢的鏢隊人馬廝殺，賴紅姑拔刀相助，但為時已晚，鏢首一字未吐，便氣絕身亡。賴紅姑打開所押物品，發現草藥下面，裝的竟全是珍奇珠寶，而所有的麻包上都寫有一個醒目的“吉”字，她不由得疑竇頓生。
第2集賴紅姑誤以為老吉與押解藥材的鏢車有關，把老吉捉入山洞，質問其事，老吉為了通知徒弟來救自己，開了一服藏頭藥方，藥方內容驢唇不對馬嘴，孔笙看得一頭霧水。吳欽差一路南下，越接近嶺南，攔路告狀的百姓越多，逃難病死者滿目皆是，吳欽差憂心漸重，決定微服私訪。吳欽差查訪到老吉處，看出了那張藥方的奧妙，帶人趕到山洞，解救了老吉。老吉與吳一銘一番長談，甚是投機。孫知府得知鏢車被劫氣急敗壞，恰恰趕上欽差大人駕到，一時弄得焦頭爛額。孫知府大擺排場，安排人馬恭迎欽差。不料，接到的只是欽差的隨從牛師爺。賀天章因開倉放藥吃了虧，找茬到老吉藥鋪索帳，刁蠻無理，撒潑耍賴，激怒了欽差吳一銘。
第3集吳一銘在府衙亮出真實身份，孫知府、賀天章、老吉都大吃一驚。吳一銘下令將賀天章責打三十大板，百姓拍手稱快。賴紅姑見很多窮人無錢看病，生命垂危，為拯救病中百姓，將鏢車中的部分珠寶在錢莊兌換成銀子。此事被報與孫知府，引起了孫知府的恐慌。他暗中派出殺手，去劫殺這一神秘女子，未果。於是，賀天章又為其出謀劃策，繼續製造了一起鏢車出動的假案，賴紅姑果真尾隨鏢車前行，被誘入圈套。殺手步步緊逼，賴紅姑奮力激戰，被箭擊傷，包圍圈越縮越小，眼看就要被生擒活捉，危急之時，賴紅姑騎上一匹快馬，殺開一條血路。採藥歸來的老吉邂逅被顛下馬來的賴紅姑。急將賴紅姑抱進草叢，躲過殺手的追趕。老吉將賴紅姑背入山洞，賴紅姑漸漸甦醒，吐露暗害她的人是賀天章。老吉找到吳欽差，希望他下令捉拿殺手賀天章，吳欽差和老吉再回山洞時，賴紅姑已蹤影全無。吳欽差和老吉在不斷的交往中，建立了莫逆之交，他聽取老吉的意見，治瘟大見起色，受到宮廷嘉獎。孫知府十分妒嫉。京城“主公”再次追問貢品遲遲不到的原因，孫知府既抓不到傳說中的神秘女子，又找不到那批丟失的珠寶，決定孤注一擲，他專門設宴，請吳欽差和老吉出席，暗地裡讓人在老吉帶的藥茶中下了毒，想借老吉之手殺掉吳欽差。
第4集吳欽差自赴宴之後，便稱病不起，孫知府以為吳欽差真的毒性發作，大喜過望。老吉得知吳欽差生病，特地前來探病，不料吃了閉門羹。賴紅姑繼續尋找殺父仇人，終於了解到，父親最終是被“陰陽奪命散”毒死的。賴紅姑找老吉了解“陰陽奪命散”的情況，老吉告之，這是一種十分罕見、毒性極強的劇毒藥，中毒者最明顯的症狀是七竅出血。孫知府得知吳欽差已掌握了他貪污賑銀的罪證，為保全性命不得已向吳欽差告發了主公，結果當晚便被人所害。孫知府的突然斃命，引起一場軒然大波，賀天章誣陷孫知府是被老吉所害。因為老吉是第一個看到孫知府死的人，老吉由此被被押入大牢。百姓聞訊，紛紛到欽差府前跪諫，要求釋放老吉，讓老吉繼續救災平疫。吳欽差體恤民意，允許老吉回到藥鋪戴罪立功，但條件是，不準離開藥鋪半步。賴紅姑設計救走了老吉，追問其“陰陽奪命散”和“濟世堂”之事，老吉如墜五里雲霧。
第5集孔笙為尋師傅，找到老吉和賴紅姑躲藏的破廟，尾隨其後的官兵也把破廟團團圍住。賴紅姑與官兵一場打鬥。老吉不會武功，急中生智，燒著了廟裡的蒲團，濃煙燻得官兵睜不開眼。乘亂之際，他領著賴紅姑和孔笙，從後山小路溜下了山。為緝拿老吉，所有的要塞關口都張貼著捉拿文告。賴紅姑讓老吉裝成病屍，用小車把老吉推到鄉下。老吉惦念飽受瘟疫折騰的鄉親，憂心忡忡。孔笙外出打探訊息時，背回來一個奄奄一息的假小子。假小子醒來之後，滿口胡言亂語，可笑之極。老吉將其收為義女，取名木蝴蝶。一度平息的瘟疫再次捲土重來，吳欽差四處尋找老吉，始終沒有訊息。賀天章想出一條詭計，打著老吉的旗號，到處賣假藥騙人，被害民眾將火發泄到到真老吉頭上，老吉終於浮出水面，一對冤家重新聚頭。
第6集老吉從賀天章的嘴裡得知瘟疫復發的訊息，萬分焦急，要連夜趕回慶州為百姓治病。賴紅姑為弄清濟世堂和陰陽奪命散的內幕，決定北上京城。吳欽差以熱烈的儀式歡迎老吉到來，使老吉受寵若驚。賴紅姑來到京城，暗訪“濟世堂”，所見所聞，使她意識到“濟世堂”中必有碩鼠。於是，擊鼓告御狀，藍御史和順親王決定將計就計，利用賴紅姑除掉異己。老吉因救治大批疫民，藥材告罄，吳欽差下令讓各藥商捐贈藥材，賀天章恨得咬牙切齒。就在這時，他突然收到了一封“主公”的密信，信中告之，“濟世堂”特使將來訪。賀天章上下張羅，請來慶州府各界名流，隆重迎接“濟世堂”特使的光臨。誰知，轎里走出來的竟是喬裝打扮的賴紅姑。老吉頓時目瞪口呆。
第7集吳欽差得知京城“濟世堂”特使來臨，覺得十分蹊蹺，他特地為京城的“曲小姐”設宴洗塵，並請老吉、賀天章等人作陪。宴席上，吳欽差不動聲色，與“曲小姐”頻頻舉杯，仿佛跟“濟世堂”的老闆是故交。老吉只顧低頭吃菜，只有賀天章得意洋洋，欽差大人居然也要和這位“曲小姐”攀關係。宴席接近尾聲，吳欽差手拿杯子站起來，正準備按約定暗號動手，忽聽一陣腳步聲，來人是“曲小姐”的部下，告之丟失的貢品已經找到，眾人皆驚。“曲小姐”率人來到山洞，起出了數箱珠寶。正準備離開時，一隊人馬奔過來，將其團團圍住，而帶頭人正是吳欽差。吳欽差哈哈大笑，說沒想到冒名的“曲小姐”，竟然給真正的老闆立下了大功。賀天章愕然。賴紅姑揭穿了欽差貪污賑災銀兩、殺知府滅口的真面目，原來吳欽差就是神秘的“主公”。正當欽差準備動手時，紅姑拿出一面小鏡子。鏡子的光芒照到山上，四周人影聳動，整座山均被官兵包圍起來。吳欽差束手就擒，被押入大牢。賴紅姑再次出現在吳欽差面前。吳欽差承認十八年前是他毒死了賴紅姑的父親，但他也是奉一位姓萬的道台之命。這位道台幹完這件事之後，不知是因為良心受到譴責，還是擔心全家被滅口，掛印棄官而去，至今下落不明。
第8集老吉因平疫有功，受到朝廷嘉獎，朝廷派人專程為老吉送來了“嶺南藥俠”的金匾。老吉一時間成為慶州地界家喻戶曉的英雄。說媒者也蜂擁而至，面對一個個如花似玉的小姐，老吉心裡想的卻是賴紅姑。賴紅姑為繼續尋找殺父仇人萬道台，在小鎮上開了一家古董字畫店，並收購到了當年萬道台的一副字，尋根溯源，找到了當年萬道台的幕僚、隱居在鄉間的陸師爺。海歸派顧西來在老吉藥店的對面開了一家西醫診所。他用人們從來未見過的西醫治病，吸引了不少病人。賴紅姑對西醫充滿好奇，她在與顧西來的接觸中，頗得顧西來的青睞。老吉因吃醋而妒嫉顧西來，從而對西醫生髮出一種莫名的牴觸。
第9集賀天章了解到老吉對中醫存有戒備和牴觸的心理，決定在慶州成立一個中醫聯合會，請老吉出任會長，把西醫趕出慶州地面，老吉思慮再三，沒有同意出任這個會長。緊接著，便出現了一系列怪事，先是老吉藥鋪被燒，相繼，三三兩兩的孩子失蹤。傳言，是顧西來把這些孩子捉去，用他們的心肝做藥了，一時搞得小鎮上人心惶惶。孔笙和木蝴蝶為了探明究竟，趁著夜色悄悄爬進顧西來的診所。結果被顧西來抓了個正著。他恐嚇木蝴蝶和孔笙，要把他們的心肝挖出來做藥。老吉對賴紅姑情有獨鍾，有事沒事便跑到賴紅姑的古董店去看她，可賴紅姑對老吉一直不冷不熱，使老吉的情感屢屢受挫。南洋富商佟鶴齡到慶州經商，逛到賴紅姑的古玩字畫店，對掛在店裡的那副萬道台的字發生了興趣。賴紅姑也對佟鶴齡這個人引起關注。
第10集賀天章召集中醫聚會，強迫老吉涼茶捆綁眾家藥品一起銷售，被老吉一口回絕。賀天章見說服不了老吉，便聯合眾中醫，背著老吉，製造了大量假冒的“老吉藥茶”，減價銷售，病家上當受騙後，登門來找老吉討說法，使老吉有口難辯，聲名掃地。老吉把賀天章告到官府，想不到賀天章早已把衙門買通，老吉有苦難言。老吉去找賴紅姑，請她幫著出主意。賴紅姑提出，要想打假，必須以正壓邪，建議老吉免費贈送正宗藥茶。老吉免費贈送藥茶之舉，非旦沒有控制住假藥茶的泛濫，反而讓賀天章鑽了空子。賀天章網路了一批藥托，裝扮成病人，輪流到老吉處領取藥茶。賀天章又將這些正宗的“老吉藥茶”改換包裝，轉送給知府，討了一個大大的人情。老吉藥盡財空，終於支持不下去了，木蝴蝶主動提出給乾爹找藥資，她收羅了一些破盆爛碗，到賴紅姑店裡去賣古董，被賴紅姑識破，最後只好用身上的玉佩做抵押，換回了五十兩銀子。佟鶴齡看到了賴紅姑身上懸掛的玉佩，引起他的好奇，追根溯源，才知道玉佩是木蝴蝶的。他又親耳聽到木蝴蝶唱的一支小曲，更使他聯想起一些支離破碎的往事。
第11集老吉免費送藥的營生實在做不下去了，於是，想到了一個以惡制惡的絕招，他帶著徒弟二人上街收購假藥，此舉使孔笙頗為不解。知府夫人喝了賀天章進貢的“老吉藥茶”，十分高興，讓賀天章繼續供藥。賀天章只好求到老吉門下，花高價購買，老吉慨然應允。然而，他賣給賀天章的“老吉藥茶”，卻是從街上收來的假藥。賀天章將此藥奉送給知府，喝得知府夫人上吐下瀉。知府大怒，抓來賀天章問罪。賀天章招供，藥茶來自老吉處。知府又將老吉帶入大堂，老吉坦言，這些藥茶都是他從街上花低價買來的。於是，一個以賀天章為首的製造假藥的黑窩點被揭開，所有假藥被當眾焚毀。賀天章不但挨了板子，而且藥去財空。知府為了懲罰老吉知假售假，決定將其藥鋪查封。老吉藉機來到賴紅姑的古董店，做了一名打工夥計。老吉在賴紅姑的古董店裡笨手笨腳，惹出一系列的麻煩，先是把癮君子陸師爺送來抵押的瓷瓶打碎，又擅自把萬道台的字作為賠償送給了陸師爺，惹得賴紅姑大怒，一定要把老吉趕出古董店。佟鶴齡得知老吉藥鋪被封，出資為老吉贖回了藥鋪。木蝴蝶趁著乾爹不在，自作主張把藥鋪裝修得不倫不類，還洋洋得意地做起了女老闆，差點沒把孔笙的鼻子氣歪。
第12集佟鶴齡在慶州表面上是做生意，暗地裡卻和洋人神甫相勾結，建教堂，開煙館。神甫為了擴大煙館，看中了老吉的藥鋪，為了達到目的，讓賀天章去勾引孔笙吸鴉片，孔笙真的中了圈套，木蝴蝶又氣又恨。孔笙吸鴉片上了癮，雖內心悔恨卻不能自拔。老吉請教顧西來，西醫有無戒毒良藥。顧西來告之，英國人自己從來不吸鴉片，全把鴉片運到殖民地去了。他希望老吉能用中醫的方法研究出一條戒毒的路子。賴紅姑愈發對佟鶴齡產生了懷疑，她登門去找佟鶴齡對質，卻碰了一個不軟不硬的釘子。賴紅姑在回來的路上遇到陸師爺，得知萬道台那副字是陸師爺做圈套騙走的，她這才發現是自己誤會了老吉，對老吉生出一種愧疚和思戀。
第13集佟鶴齡通過玉佩的線索終於查明，木蝴蝶就是他的親生女兒，當他拿著另外半塊玉佩準備和木蝴蝶相認時，玉佩不慎失落，被孔笙撿到，將玉佩押在賴紅姑處，換錢吸了大煙。賴紅姑發現那半塊玉佩不是木蝴蝶的心生蹊蹺，她主動找木蝴蝶打探木蝴蝶的家事，木蝴蝶一陣胡吹亂侃。老吉冥思苦想地研究戒毒，收效甚微。神甫從賀天章處得知老吉在研究戒毒，想讓老吉放棄這種做法，特地請老吉吃西餐，老吉也將計就計，讓神甫給他送煙膏。這件事被賀天章透露給賴紅姑，賴紅姑以為老吉真的墮落了，一怒之下，將老吉研究戒毒的十幾個藥罐砸個稀爛。孔笙半夜犯了菸癮，去找老吉藏匿的煙膏，被老吉發現，無處躲藏，只好跳進了浴缸。木蝴蝶為了給孔笙打掩護，將被賴紅姑打翻的各種藥渣藥湯通通倒進浴缸，結果，陰差陽錯，竟然把孔笙的菸癮戒掉了。癮君子陸師爺無意中認出佟鶴齡就是當年的萬道台。他為了敲詐佟鶴齡，寫下一封匿名信，讓他出一百兩銀子，裝在藥罐里，放在樹下。誰知，這銀子竟被木蝴蝶拿了去，使佟鶴齡百思不得其解。當佟鶴齡意識到，陸師爺將給他帶來麻煩、決定幹掉陸師爺時，賴紅姑已提前一步將陸師爺救下。
第14集老吉為了捉弄神甫，也請神甫吃了一頓美味佳肴，誰知，神甫回去便上吐下瀉。神甫把狀告到知府，說老吉害他，但食物中卻查不出半點有毒物質，原來，老吉是利用食物相剋的原理，故意給神甫一點厲害嘗嘗。賴紅姑經過一番艱難的排查，終於弄清，佟鶴齡便是當年殺害父親的萬道台。紅姑提劍前往佟鶴齡住處，決定報仇雪恨，不料，正碰上木蝴蝶與佟鶴齡相認。賴紅姑一劍刺去，被木蝴蝶擋住。賴紅姑被他們的父女親情所感動，抽劍走開了。老吉幾經試驗，終於摸索到戒毒良方，成立了戒菸館。佟鶴齡良心發現，愧悔交加，讓神甫歸還了所有菸民的房契、地契，決定帶著女兒木蝴蝶遠離慶州。但木蝴蝶卻捨不得老吉和藥鋪。佟鶴齡答應木蝴蝶留下，他也打算把南洋的產業搬到慶州來，葉落歸根，安度晚年。
第15集老吉突然接到懿旨，讓其頂替太醫劉洪到紫禁城做御醫。老吉摸不清底細，託病敷衍。賴紅姑得知後，答應陪同老吉一同前往。因為她調查清楚萬道台也是受人指使，她要把殺父的真正元兇查出來。老吉得知太醫劉洪是因老母病逝回家奔喪，路經劉洪府時，便約了賴紅姑一起去府上弔孝，誰知劉洪老母精神矍鑠，老吉被棍棒哄趕出來。老吉愈發覺得事情蹊蹺。到了京城，老吉一行被安置在皇城根的一個四合院裡，等待太后召見。老吉帶著兩個徒弟上街，看到什麼都覺得新鮮。孔笙在路上碰到一個絕色女子，要為其診病，卻換了一頓臭罵，他萬萬沒想到，這位絕色女子便是從宮中跑出來幽會情人的七格格。
第16集老吉一行被太后宣召進宮，正趕上兩宮太后在戲樓看戲。慈安對慈禧召土郎中老吉進京頗為不解，她從骨子裡看不起這個鄉下土郎中。慈禧決定當場考考老吉。她先讓老吉對一副用九味中草藥藥名串成的長聯，老吉對得十分工整，慈禧暗中嘆服。慈禧又讓老吉為自己和慈安懸絲診脈。慈安讓七格格替她躺入賬中，老吉摸著摸著，竟虛脫暈倒。原來，老吉在診脈時發現了喜脈，他驚恐難言，只好耍了個花招。這件事引得慈安一陣嘲笑。順親王卻從中看出破綻，把老吉接到府上了解情況，老吉不敢直言，懇求順親王放他回嶺南，順親王沒有答應。
第17集七格格陪慈禧在園中散步，慈禧想把七格格許給順親王的四貝勒，七格格卻喜歡京劇武生楊小雲。慈禧發現七格格有反胃嘔吐症狀，宣老吉進宮為七格格診脈，老吉再次被嚇個半死，原來七格格也是喜脈。賴紅姑替老吉去給七格格送藥，從七格格嘴裡得知，她那天為慈安當替身的事，老吉這才弄明白，原來懷孕的只是七格格一人。七格格懇請老吉救她，否則，就一死了之。老吉給七格格開一服打胎藥，也請七格格在太后面前說情話，放他們回嶺南。慈禧考慮到慈安對老吉的反感，決定放老吉回去，臨走前讓老吉開一些養顏美容的藥方，賴紅姑利用這個機會，寫了一張特殊的“藥方”，引發了慈禧的興趣。慈禧宣老吉、賴紅姑進見。老吉不知何故，賴紅姑卻十分坦然，當著慈禧的面對那張特殊的藥方侃侃而談，慈禧對賴紅姑十分喜歡，故而決定把老吉等人重新留下。老吉責怪賴紅姑害了他。
第18集慈安太后突然病了，且病勢越來越重，請了幾撥太醫醫治，均不見效。慈禧宣老吉為慈安看病，老吉開出一張虎狼藥方，太醫院的人不敢依方抓藥，擅自減了藥量，結果，慈安的病非旦沒有好轉，反而危在旦夕。老吉因此被綁，就在準備行刑時，賴紅姑闖入宮中，弄清了事情真相，救了老吉。慈安因殆誤時機，已病入膏肓。老吉提出，要救慈安，必須用“鳳脂”做藥引子，所謂“鳳脂”便是西太后慈禧的血，慈禧慨然允之。慈安轉危為安，了解詳情後十分感動，當著慈禧的面，燒毀了先帝留下的秘詔。兩宮太后決定褒獎老吉救駕之功，老吉提出，既不要官，也不要錢，只求太后準許他回嶺南，兩宮太后駁回了他的請求。老吉被御封為太醫院院長，官至五品。兩宮太后同時賜與紅姑一枚進宮腰牌，可隨時到後宮行走。
第19集老吉半夜穿上官服起來臭美，被賴紅姑看到，奚落一番。老吉到太醫院去上班，和那些照本宣科的老夫子太醫格格不入。賀天章聽說老吉在京城當了官，千里迢迢從嶺南趕來，希望藉助老吉的外力發大財。老吉在請賀天章吃飯時，偶遇李蓮英。善於投機鑽營的賀天章靠吹牛拍馬，送禮行賄等手段，討得李公公歡喜。賀天章仗著李公公的關係，盤下了專門為太醫院供藥的“濟世堂”大藥房，更名為“濟生堂”，並舉行了隆重的揭幕儀式。
第20集老吉街上邂逅劉洪，劉洪開始說老吉認錯了人，以後又遮遮掩掩，似有難言之隱。劉洪暗示老吉當晚後海湖邊說話，老吉如期而至，劉洪已被人滅口。順親王再次安排楊小雲所有的戲班子進宮為兩宮太后唱堂會。戲演了一半，扮做戲子的殺手突然向慈禧射出毒箭，幸虧楊小雲及時用槍挑開，避免了一場血案。慈禧震怒之極，傳旨將兇手五馬分屍，賴紅姑由此看到了慈禧兇殘的一面。賴紅姑由此斷定，當年下旨殺她父親的就是慈禧。一時千仇萬恨湧上心頭，正當她準備用暗器襲擊慈禧時，被老吉制止。戲班子所有的人都因謀殺之事被打入死牢。戲班班主屈打成招，承認殺手是九門提督派來的，九門提督因此被斬首，換上了順親王的人。順親王也準備送楊小雲上西天。。老吉怕賴紅姑惹出殺身之禍，用迷藥將她麻倒。楊小雲臨刑前，被李蓮英拿著慈禧的懿旨救下，楊小雲感激慈禧救命之恩，願為慈禧收集順親王篡權謀反的證據。老吉被順親王宣進府里看病，孔笙發現了被老吉綁起來的賴紅姑，以為老吉非禮賴紅姑，由此對師傅心生蔑視。
第21集順親王決定利用賴紅姑的復仇心理，將賴紅姑接進王府，故意製造出一些假相，使賴紅姑愈發堅信，當年殺害父親的禍首就是慈禧。孔笙做夢也沒有想到，一頂五品的官帽子竟從天而降。他告別了老吉，決心在官場上乾出一番轟轟烈烈的大事業。順親王為兩宮太后進獻了一張民間祖傳的延年益壽藥方，李蓮英將藥方交給老吉，讓他親自熬制，直接送給兩宮太后服用。孔笙做了九門提督副都統後，秉公執法，斷案如神，深得市民的讚頌，被稱為“孔青天”，也讓木蝴蝶刮目相看。
第22集賀天章因不斷地向李蓮英行賄，深得李蓮英的賞識。賀天章想過一把官癮，李公公專門為他借來了二品官服官轎，正當賀天章忘乎所以，招搖過市時，被孔笙撞見捉拿歸案。孔笙得知始作俑者是李蓮英，也將李蓮英捉起來，與賀天章一起在城門示眾。順親王將此事報告兩宮太后，慈禧雖恨得咬牙切齒，但也不便發作，小皇上為褒獎孔笙，將唱戲用的金鐧獎給孔笙。孔笙拿著小皇上獎勵的金鐧去向老吉和木蝴蝶炫耀，老吉告誡孔笙，官場險惡，讓他不要太張揚，要謹慎從事，遇到孔笙的譏笑。賴紅姑在順親王的書房發現了一個暗室，從暗室中看到了當年慈禧下令誅殺父親的文書。她回到老吉住處，想尋找進宮腰牌，老吉怕她惹來殺身之禍，不肯給她。
第23集慈安太后在沒有任何疾患的情況下突然暴斃，在宮內引起恐慌。順親王令老吉查找慈安的死因，並誘導老吉把陷害慈安的罪名扣在慈禧頭上，老吉不從。慈禧自慈安暴斃後，臥床稱病。順親王眼看皇權炙手可得，讓賀天章在慈禧的藥里下毒，此事被楊小雲發現，將下毒的藥液打翻，並一路追殺賀天章。賀天章走投無路，躲進了老吉的宅院。誰知，老吉的宅院也不安全，老吉為他出主意，到格格府上躲一躲。木蝴蝶帶著賀天章剛到格格府，就碰到楊小雲，嚇得賀天章落荒而逃。順親王對老吉軟硬兼施，希望老吉做偽證。老吉不肯，順親王惱羞成怒，決定讓孔笙把老吉打入天牢。孔笙不敢違命，只好昧著良心把師傅抓走，同時把賀天章也捎了進去。
第24集賴紅姑得知老吉被抓進大牢，懇求順親王網開一面，順親王裝出一副為難的樣子，把責任全部推到慈禧身上，愈發激起了賴紅姑內心的仇恨。慈禧一方面稱病，同時也部署親信為順親王挖下陷阱。老吉在獄中，雖受酷刑，但仍不從。老吉用藥使賀天章詐死，僥倖逃命。賴紅姑去大牢看望老吉，第一次向老吉傾吐了愛慕之情。老吉勸賴紅姑一定要謹慎從事，不要被人利用。賴紅姑聽不進去，當晚便進宮去刺殺慈禧。誰知，慈禧早有預料，反將賴紅姑擒獲，慈禧告訴賴紅姑，真正殺她父親的禍首就是順親王。
第25集慈禧親筆寫下手諭，讓李公公到天牢里以為慈禧治病為名，解救出老吉，並讓老吉將計就計，把順親王騙進宮來。順親王以為慈禧真的被賴紅姑刺傷，準備進宮去收拾殘局，不料，卻中了慈禧的圈套。賴紅姑、楊小雲與順親王一番廝殺，順親王當場斃命。順親王的親信黨羽一夜之間被剿滅，孔笙也因此被抓入大牢，幸得老吉求情，免於一死。慈禧要獎賞老吉，老吉堅決要求回嶺南，被慈禧獲準，賴紅姑則被慈禧封為紅格格。賴紅姑為老吉送行，正好碰到落魄的孔笙，孔笙求老吉原諒他的過錯，繼續收他為徒。老吉堅決不允，孔笙悲痛萬分，喝下了賴紅姑調製的“毒藥”。（實為安眠藥）老吉、孔笙、木蝴蝶從此結束了宮廷的榮華富貴和驚心動魄，離開了京城。老吉一行回到嶺南，一路上看到不少怪現象，求神拜佛的，有病不治的，跳崖自殺的，老吉心驚肉跳。老吉帶著木蝴蝶和孔笙回到自己的藥鋪，想不到藥鋪早已被賀天章變賣，變成了足浴按摩房，那塊“藥俠”的金匾也成了足浴房的招牌。
第26集老吉要找賀天章算帳，到了賀天章藥店，發現這裡已變成黑蓮教講經說法的講壇，一群無知百姓跪地聽講，賀天章儼然一個小頭目模樣，正端著銅盆為教徒灑點聖水，見到老吉來，將整整一盆水全潑到了老吉的身上。賀天章臨時將老吉一行安排到一處小竹屋，並找來一個啞巴做僕人。佟鶴齡從南洋再次歸來，住進瞭望海樓客棧，佟鶴齡尋訪老吉不遇，卻遇到賀天章。賀天章套出佟鶴齡歸來的目的，原來，他一方面要與木蝴蝶同享天倫，一方面帶了大筆資金準備投資老吉藥茶，擴大市場。賀天章想打這筆錢的主意，故意騙佟鶴齡，說老吉生死不明，讓佟鶴齡與自己合作，佟鶴齡不允。木蝴蝶帶著藥茶到城裡來推銷，在望海樓門口，教徒們都不喝藥茶，讓木蝴蝶氣惱不已。吵鬧之聲驚動了佟鶴齡，使木蝴蝶與父親意外相逢。木蝴蝶在一個偶然的機會，見到了黑蓮教教主，頓時一見傾心。佟鶴齡帶著木蝴蝶上街買東西，木蝴蝶買下一個價格不菲的玉蓮花，準備找機會獻給黑蓮教教主。賴紅姑奉旨回嶺南查邪教。看到老吉的藥鋪變成了足浴中心，女老闆告之舊東家病死了。賴紅姑誤以為說的是老吉，十分悲痛。
第27集賴紅姑恍恍惚惚走在街上，突然看到老吉和賀天章大搖大擺進了一家妓院。一身男裝的賴紅姑，在老吉隔壁廂房坐定，只聽老吉跟姑娘們打情罵俏。賴紅姑越聽越惱，拍案而起，一場混戰把妓院攪得七零八落。黑蓮教教主得知賴紅姑是朝廷新封的紅格格，主動登門求見，並恭請賴紅姑入教。賴紅姑為打入黑蓮教內部，慷然應允。賀天章利用賴紅姑為教會造勢，特設蓮花寶座，大張旗鼓迎接賴紅姑入壇。木蝴蝶在教民中聽說京城來了個格格，又親眼看到賀天章把賴紅姑請上教會神壇，簡直不敢相信自己的眼睛。木蝴蝶告之老吉賴紅姑回來了。老吉隨木蝴蝶趕到現場，教主當眾封賴紅姑為黑蓮教聖姑。賴紅姑走下神壇為每個教民滴水賜福，走到老吉身邊，老吉迫不及待地攔住賴紅姑，賴紅姑卻不理不睬。老吉氣急高聲叫嚷，被教主冠以褻瀆聖姑之罪，抬起來扔了出去。老吉以為賴紅姑變了心，心裡憤憤不平，卻不知這鹽打哪鹹，醋打哪酸。黑蓮教五名教徒集體自殺，事件驚動官府，官府派兵前去制止，但來遲一步，只有一個教徒被救下，其餘全部身亡。老吉耳聞目睹，愈發覺得事態嚴重，認定黑蓮教是一個殺人的魔教，老吉擔心賴紅姑，勸賴紅姑不要上當。賴紅姑故意說反話，氣跑老吉。木蝴蝶迷上了黑蓮教教主，不顧父親和老吉的反對，執意加入黑蓮教。父親一氣之下，將她反鎖在屋中，木蝴蝶又急又氣，無奈中，忽然發現窗戶紙捅破了一個窟窿，有人為她送來了鋸條。
第28集木蝴蝶逃出客棧，一心去找黑蓮教主，路遇兩個流氓，危急時刻，一俠客從天而降，將木蝴蝶解救出來。木蝴蝶愈發堅信，是教主在保佑她。木蝴蝶找到教主所在地，教主打開一個暗門，裡面別有洞天，香霧繚繞，木蝴蝶很快中了迷藥。教主露出真面目，欲行不軌。幸虧孔笙及時趕到，拿起香爐朝教主砸過去，教主卻用木蝴蝶做擋箭牌，木蝴蝶被砸傷。教民們紛紛趕來，要和孔笙拚命。老吉和佟鶴齡帶著官兵趕到。一群人全部被扭送到官府。公堂之上，知府主審孔笙，老吉義憤填膺，慷慨激昂揭露邪教，捎帶連賴紅姑一塊痛罵。在衙門後面偷聽的賴紅姑，忍不住站了出來，端出了老吉去妓院的醜事。孔笙為老吉澄清了不白之冤。賴紅姑覺得錯怪了老吉，心中過意不去，派人給老吉送來了陶塤。木蝴蝶從昏迷中醒來，責怪孔笙壞了她的好事，對孔笙又打又罵，佟鶴齡怕木蝴蝶出事，特地買了一所大宅院，把木蝴蝶軟禁起來。木蝴蝶心中仍然思念教主，只好讓教會姑娘阿蘭為她傳遞信息。賴紅姑和老吉重歸於好，老吉苦心勸賴紅姑離開黑蓮教，賴紅姑也不便說明真相，只是一味敷衍，老吉很失望，下決心揭穿黑蓮教的小把戲。黑蓮教教主雇了一幫託兒冒充從朝聖地回來，把聖地吹得天花亂墜。阿蘭沒錢交報名費，被攆了出來，正好被教主撞見，教主見其年輕美貌，破格給了她一個名額。阿蘭喜出望外。賴紅姑一旁冷眼旁觀。
第29集阿蘭給木蝴蝶送來一封教主的親筆信。信中勸木蝴蝶前往聖地，功德圓滿後便會成為蓮花使者。看得木蝴蝶心潮澎湃。孔笙看到這一幕，質問木蝴蝶，並搶過書信，收繳了教主送給木蝴蝶的天梯。佟鶴齡回到家中，發現木蝴蝶不見了蹤影。他去找賀天章詢問，正好碰到阿蘭奶奶，得知木蝴蝶和阿蘭準備一塊去朝聖，並從賀天章嘴裡得知朝聖的人無一歸還。木蝴蝶中途被孔笙救下。木蝴蝶對孔笙又抓又咬，孔笙無奈，只好將其打暈，孔笙把木蝴蝶背回老吉住的小院。次日，老吉去找佟鶴齡，赫然發現佟鶴齡已死，身邊留有遺書一封。賴紅姑發現了遺書上的疑點，指示知府詳查，並派孔笙追查佟鶴齡生前接觸過的所有人。同時指令老吉為佟鶴齡驗屍。老吉證實佟鶴齡為他殺，確切的死亡時間在傍晚時分。賀天章為擇清自己，把從佟府上偷來的西洋座鐘抱到教會暗室，正好碰到黑蓮教教主，便假心假意地把座鐘送給了教主。孔笙帶人到賀天章家搜查，不料，賀天章剛剛送出去的那個西洋座鐘又意外地回到了他的桌上。被孔笙抓了個正著。賀天章作為疑犯被押入大堂，他承認當天晚上他確實去過佟府，但並沒有見到佟鶴齡。眾人對賀天章的招供將信將疑，賴紅姑卻建議放人。
第30集賀天章回到家中，輾轉難眠，突然有個黑衣人上門行刺。賴紅姑及時出手相救，蒙面人逃脫。賀天章心驚膽戰，一大早來到府衙擊鼓，承認自己就是謀害佟鶴齡的兇手！目的是為了住進牢房，圖個平安。木蝴蝶為父親守靈，黑蓮教教主親自登門作法，助佟鶴齡升天，木蝴蝶十分感動。木蝴蝶為報答黑蓮教教主，決定將父親遺留的十萬銀票，全部兌換成銀子，送給黑蓮教。木蝴蝶去錢莊兌銀時，正碰上賴紅姑和一些喬裝打扮的精兵。正當賴紅姑與木蝴蝶糾纏之際，賴紅姑突然意識到這是聲東擊西之計，待她返回到錢莊，錢莊老闆已遇害，銀兩不翼而飛。賴紅姑把木蝴蝶押上大堂，木蝴蝶卻罵賴紅姑公報私仇，孔笙和老吉都為木蝴蝶的執迷不悟而憂心。阿蘭的奶奶意外身亡，賀天章終於供出了教主，木蝴蝶如夢初醒。賴紅姑連夜審訊黑蓮教教主，教主對殺害佟鶴齡供認不諱，但賴紅姑卻覺得事情並不像這么簡單。
第31集倭寇冒充獄卒趁夜劫獄，企圖搭救教主，被賴紅姑攔下。教主眼看出逃無望，拔出倭刀剖腹自殺。賴紅姑面對倭刀陷入沉思。木蝴蝶重新搬回藥鋪，無意中，發現啞仆臥室里藏有很多銀子，心生疑惑。賴紅姑也發現了啞仆的一些破綻，卻欲擒故縱，聲稱自己要回京城。賀天章焚燒了所有黑蓮教的書籍，表白改邪歸正的決心。老吉接納賀天章做了自己的主管。啞仆利用送藥做掩護，把銀兩帶到船上，老吉偶然間發現了被捆綁的木蝴蝶，啞仆凶相畢露，索性抓住木蝴蝶和老吉作為人質。危急時刻，賴紅姑趕到，一場廝殺，難分高下，最終賴紅姑在清兵的協助下，活捉了啞仆。啞仆交待，倭寇與黑蓮教早有勾結，他才是黑蓮教真正的幕後黑手。佟鶴齡、阿蘭奶奶、錢莊老闆、顧西來都是他所殺，所謂的教主不過是他棋盤上的一顆棋子。黑蓮教一舉粉碎，上上下下皆大歡喜。老吉、賴紅姑有人情終成眷屬。
分集劇情內容來源
演職員表
演員表
| 角色 | 演員 | 備註 |
| 謝鋼 | 老吉 | 配音 趙嶺 |
| 楊麗菁 | 賴紅姑 | 配音 晏積瑄 |
| 趙燕國彰 | 賀天章 | 配音 趙曉明 |
| 毛樂 | 孔笙 | 配音 吳凌雲 |
| 法提麥·雅琦 | 木蝴蝶 | |
| 孫承政 | 吳一銘 | |
| 楊洪武 | 佟鶴齡 | |
| 修宗迪 | 順親王 | 配音 李志新 |
| 馬麗 | 慈禧太后 | |
| 溫玉娟 | 慈安太后 | 配音 晏積瑄 |
| 王智慧 | 七格格 | 配音 何新 |
| 王九勝 | 楊小雲 | 配音 谷峰 |
| 陳明浩 | 李蓮英 | 配音 海頓 |
| 仇永力 | 知府 | |
| 詹靜波 | 孫子玉 | |
| 江濤 | 顧西來 | |
| 朱建國 | 神甫 | |
| 楊君 | 教主 | |
| 崔金榮 | 啞叔 | |
| 馬書立 | 牛師爺 | 配音 谷峰 |
職員表
| 出品人 | 朱彤、高小平 |
| 監製 | 施少斌、陳鴻道、祁茂林 |
| 導演 | 劉家成 |
| 副導演（助理） | 崔金榮、武志勇 |
| 編劇 | 馬繼紅、高軍、胡蓉蓉、鄧小川 |
| 攝影 | 小海 |
| 配樂 | 張宏光 |
| 剪輯 | 王秋月 |
| 道具 | 解延福 |
| 美術設計 | 魯琳 |
| 造型設計 | 李菊榮 |
| 服裝設計 | 李鳳鳴 |
| 燈光 | 高長柱 |
| 錄音 | 萬仲平 |
| 劇務 | 周勇、王延瑜、谷潤江、混坤 |
| 場記 | 丁蓮芳 |
| 布景師 | 王立軍 |
演職員表內容來源
角色介紹
 嶺南藥俠 |
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 嶺南藥俠 |
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 嶺南藥俠 |
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 嶺南藥俠 |
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 嶺南藥俠 |
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角色介紹內容來源
音樂原聲
| 曲名 | 作詞 | 作曲 | 演唱 | 備註 |
| 《嶺南藥俠》 | 劉世新 | 張宏光 | 宋祖英 | 片頭曲 |
| 《昔年》 | 陳濤 | 張宏光 | 韓磊，王智慧 | 片尾曲 |
幕後花絮
•該劇是楊麗菁繼《鐵齒銅牙紀曉嵐2》之後，再度飾演俠女角色 。
•該劇是法提麥·雅琦繼電視劇《懷安奇案》、《少林武王》之後，與導演劉家成第三度合作 。
•該劇拍攝期間，謝鋼遭遇父親病逝，他堅持拍完了原定的戲，才回家奔喪 。
劇集評價
該劇因其濃烈的嶺南特色，吸引了廣東觀眾的追看和好評，獲觀眾評價廣東的王老吉一點都不比北京的“喜來樂”差，也是老百姓的好郎中。 （金羊網評）
該劇處處充滿幽默、詼諧的喜劇色彩、令人捧腹，即使是一個沉重的主題，也是用輕鬆的筆觸和活潑的色調來完成的。此外，劇中還涉及到不少撲朔迷離的案情，驚險刺激，隨著案情的步步深入，層層剝開，最終達到“情理之中，意料之外”的效果。該劇又非純粹搞笑的鬧劇，每一章節都具有深刻內涵，作者力圖把嚴肅的思考融在妙趣橫生的故事裡，讓觀眾在詼諧、幽默的氣氛中完成一次觀賞之旅。 （搜狐娛樂評）
