小鰕虎魚屬（Gobionellus）有以下物種：
•黑鰭小鰕虎魚（Gobionellus atripinnis）
•梭體小鰕虎魚（Gobionellus boleosoma）
•克氏小鰕虎魚（Gobionellus claytoni）
•普通小鰕虎魚（Gobionellus comma）
•細齒小鰕虎魚（Gobionellus daguae）
•纖小鰕虎魚（Gobionellus gracillimus）
•滑鱗小鰕虎魚（Gobionellus liolepis）
•點鰭小鰕虎魚（Gobionellus manglicola）
•細齒小鰕虎魚（Gobionellus microdon）
•西方小鰕虎魚（Gobionellus occidentalis）
•大洋小鰕虎魚（Gobionellus oceanicus）
•擬紋小鰕虎魚（Gobionellus pseudofasciatus）
•眼帶小鰕虎魚（Gobionellus saepepallens）
•箭小鰕虎魚（Gobionellus sagittula）
•舒氏小鰕虎魚（Gobionellus shufeldti）
•寶石小鰕虎魚（Gobionellus smaragdus）
•斑鰭小鰕虎魚（Gobionellus stigmalophius）
•柱頭小鰕虎魚（Gobionellus stigmaticus）
•斑尾小鰕虎魚（Gobionellus stigmaturus）
•大口小鰕虎魚（Gobionellus stomatus）
