姚治學態度嚴謹,從事教育多年,“接來學者千餘輩,教成楚材”,為時所稱。他大力推行教育改革,鼓吹教育內容必須向科學演變,提出“才能須應萬變,學業豈拘五經”;向學生介紹西歐及日本科學、民主思想,增加新課程;親自選派優秀學生出國留學,為湖北培養
科技教育人才。
著作有《三家書義發微》、《春秋備疏》、《經論》、《禮經雜記》、《漢志礦地記》、《九宮隨釋》、《國小教育法》等20餘種。不僅在音韻學、詞章、考據、訓詁上造詣很深,對醫學亦有研究。
1916年病故,總統黎元洪以其“學術精通,道德純備”,明令國史館為之立傳。