崇善寺曾是一座規模龐大的佛教寺院。據寺內所存的一幅明版崇善寺建築全圖來看,朱楓所建之時,占地廣達十四萬平方米，有大殿六座，院落十八座，殿閣樓台、堂廊廡近千間。清同治三年(1864年),崇善寺失火，寺內主要建築化為灰燼,僅餘大悲殿一組得以保存，成為現在山西省博物館所在。
崇善寺現存建築主要有山門、鐘樓、東西廂房和主體建築大悲殿。大悲殿坐落於寬厚的台基上，前有月台，成凸字形組合。殿身面闊七間，進深四間，重檐歇山頂，乃是中國現存最完整、最標準的明初木構建築，為研究古代建築提供了豐富的實物資料。大悲殿前兩側，皆有火劫後所建仿明琉璃瓦亭，左為鼓亭，右為鍾亭。山門東側，另有大鐘樓，上懸明正德元年(1505年)鑄造大鐘，重9999斤，鐘聲可響遍全市。
崇善寺現存雕塑、繪畫、佛教經籍等珍貴文物甚多。大悲殿內供奉三大士像，中間為千手千眼觀世音菩薩，左古為文殊、普賢菩薩。三尊塑像旨高達8.5米，色彩絢麗，造型端莊，栩栩如生，為明朝雕塑中的精品。尤其是正中的千手千眼觀世音菩薩，全身金色，肩披綠巾，面相圓潤俊秀，身像完整潔淨，千手千眼皆雕於背光處，正面看如出自肩臂，十分生動傳神。寺內西院另有明朝文殊菩薩的比丘像，造型奇特，衣紋不依現實紋理，而呈螺鏇式波浪圖案，具有古印度健陀羅遺風。此像原奉於太原市文殊寺和北大方院千壽寺，後遷奉於崇善寺。還有其他太原寺院移來的各種佛像達百尊之多，大部分屬明朝造型。明朝崇善寺大雄寶殿外的長廊上，原繪有84幅《釋加世尊應化示跡》及53幅《善財童子五十三參》壁畫，但真跡已於清朝焚寺時毀燼。幸而早在明朝成化年間，有畫師依原畫精心臨摹成137幅絹畫，裝幀考究，後世以“寶石畫”稱之。該畫冊為崇善寺鎮寺之寶，被列為國家一級保護文物。崇善寺亦為中國現時著名的佛教經藏收藏地之一，內藏宋、元、明版等經書達三萬餘卷，且大部分為木刻書法珍本。其中包括宋版《鼓山藏》、《磧砂藏》、元版《普寧藏》和明版《南北藏》。相傳為明版的血書《大方廣佛華嚴經》，為劫後僅餘的孤本。崇善寺所藏還有明、清、民國各時期碑記11塊。寺內另有樹齡已達四百多年的國槐數株。清幽古雅的崇善寺，六百多年來，寂然坐落於塵俗之外，不愧是一座五彩斑斕的文化藝術寶藏。
大殿兩旁築兩條半壁長廊，繪以佛傳故事和經變故事壁畫，更加突出了大殿的主體地位。這座龐大的群體建築，平面布局之恢宏嚴謹；建築規模之雄偉宏大；造型藝術之奇特精湛，充分顯示了我國古代勞動人民的勤勞與智慧，也反映了興建佛寺的那種“費竭財產，務存高廣”，“層宇奢侈，博敞宏麗”的遺風。遺憾的是，寺於清同治三年（1864）十月十五日，被一場大火所吞噬，僅存大悲殿一組建築，即現在的崇善寺。清光緒八年（1882），山西巡撫張之洞倡議，在崇善寺的廢墟上建起一座規模巨大的文廟，使崇善寺一分為二。對於它輝煌的過去，我們只能觀看寺內現存明代繪製的“崇善寺平面圖”藉以神遊，而不能親睹了。 現存的崇善寺，有山門、鐘樓、大悲殿、東西廂房和西小院等，占地面積僅3000平方米，為原寺的四十六分之一。解放後得到政府的精心維護，恢復了原來的風貌，被列為省級重點文物保護單位，又是山西省佛教協會所在地。崇善寺無論是宏麗軒昂、舒展健美的木構建築，還是造型奇特、比例勻稱的密宗造像；無論是構圖豐滿、色彩絢麗的壁畫摹本，還是從宋迄今的各種佛藏版本，以及各種雕刻等，都是研究我國古代建築、雕刻、繪畫藝術、印刷技術和宗教歷史的彌足珍貴的實物資料，具有重要的歷史價值和藝術價值。
大悲殿是現崇善寺的主體建築，矗立在寬厚的台基上。殿前有平曠的“凸”字形月台，殿身面寬七間，進深四間，重檐歇山頂，出檐深遠，黃綠琉璃瓦剪邊，通高近20米。殿內正面須彌座上，三尊泥塑貼金菩薩並立，通高8．3米，為觀音、文殊、普賢，稱為“三大士”。三尊造像，比例適度，身容敦肅，體態健碩，面像豐圓，顏貌舒泰，服飾華麗，衣紋流暢，具有一種溫文敦厚、雍容華貴、秀麗嫵媚、和藹慈祥、可親可敬的神韻，是我國明代雕塑藝術的傑作。 正中為千手千眼觀音菩薩。據稱，遇難眾生只要誦念其名號，菩薩即觀其音聲前往拯救解脫，故名“觀世音”，後避唐太宗李世民諱，而稱“觀音”，道場在浙江定海普陀山，其生日為夏曆二月十九，成道日為夏曆六月十九，涅磐日為夏曆九月十九。觀音菩薩有各種不同的形象，大悲殿內的千手千眼觀音屬密宗（佛教的一個宗派）所屬六種形象之一。觀音菩薩的左側是千手千缽文殊菩薩。文殊菩薩以智慧和能言善辯著稱，故其名號為“大智文殊”，道場在山西五台山。塑於大悲殿內的這尊文殊立像，只有三頭六臂，之所以稱千手千缽，是因為她身後的相輪是由一圈圈手臂組成，而每隻手都托著一個金缽，每個金缽中都端坐著一尊雕刻精細、玲瓏剔透的釋迦佛，據說也是文殊的變相之一。從造形可以看出他的智慧確實大得很，據佛經講，一隻手持一個體，代表一個僧人，千手千缽代表一千個僧人，而千手千缽實際是“無數”的代名詞。這樣“無數”僧人的智慧集於一身，智慧當然就是無限的了。
明代的崇善寺是完全按照標準的宮殿式建築的格式修建的。中軸線上的金剛殿、天王殿、大雄殿、毗盧殿、大悲殿、金靈殿，由南往北一字排開。在各大殿的左、右，又整齊的排列著一系列的小院落。它們不僅對稱，而且整齊劃一。這種格局，與北京故宮中軸線上的主殿和東西六宮的布局極為相似。從這幅圖，我們可以想像得到當年占地二百四十五畝的崇善寺，是多么的富麗堂皇，宏偉壯觀。當年的崇善寺不僅外表引人注目，更重要的是擁有其他寺廟不具備的條件，那就是它不僅是一座寺院，而且是朱家王朝的一座祖廟。中軸線上的最後一座大殿——金靈殿，就是一座沒有帝座的祖廟。這在中國佛教寺院的修建中是罕見的。崇善寺既是佛教寺廟，又是皇家祖廟，因此，它享受著比一般寺廟更多的香火。在這種背景下，它渡過了自己旺盛、興隆的時期。
我們現在看到的崇善寺，只是原來寺廟的幾十分之一，僅是六大主殿中的一座——大悲殿。崇善寺的其他宏偉建築，於清代同治三年（公元1864年）的大火中全都化為了灰燼。
倖免一毀的大悲殿，雖然在明成化和清嘉慶年間進行過修葺，但都是小修，大至梁架，小至門窗都未更換，基本上還是明代初修時的原物。因此具有更高的歷史價值。
占地僅為九百平方米的大悲殿，雖然僅是原崇善寺的幾十分之一，但它卻保存著崇善寺的精華，保存著價值連城的寶物。
藏經是它的第一寶。這裡保存的佛教藏經，數量之多，版本之名貴，在全國是少有的。寺內保存著我國木刻印刷史上的早期珍貴版本——北宋《崇寧萬壽藏》和南宋《磧砂藏》。《崇寧萬壽藏》又稱《鼓山大藏》，前後用了三十三年時間刻成。原刻本共五百六十四函，五千八百餘卷。現僅存十七卷零十八頁。《磧砂藏》是南宋紹定四年（公元1231年）開刻，到元英宗至治二年（公元1323年）完工。歷經百年刻成的《磧砂藏》，共五百九十一函，六千三百六十二卷。現存五百六十二函，四千八百四十六卷。除此之外，這裡還一直保存著元版藏經，即元皇慶元年（公元1312年），由民間募資刻印的《普寧藏》，現存五百零五函，四千二百五十七卷，比原版少八十一函，二千零六十八卷。
除上述版本外，這裡還有以後從其他寺院或地方移來的藏經多種，如從太原中十萬院移來的明版藏經《南藏》和從大同移來的《北藏》，二十世紀七十年代從日本清置的影印藏文《大藏經》，又名《甘珠爾》等。此外還有另具特色的石刻《金剛經》拓本、金字《華嚴經》、《法華經》及刺血《華嚴經》等。正是這一些不同時期、不同版本、不同特色的藏經，使崇善寺在佛教寺院中占據著重要的席位。
崇善寺的第二寶，就是那兩套壁畫臨摹本。在還沒有照像和製版技術的古代，臨摹複製是使歷史上的名畫流傳後世的唯一手段。我們今天能夠一睹大雄寶殿當年兩掖長廊上的繪畫風采，應感謝為我們留下如此珍貴摹本的先人。這兩套繪畫，一套是《釋迦世尊應化示跡圖》，描繪了釋迦牟尼成佛的故事；另一套是《善財童子五十三參圖》，描繪了善財童子參拜諸佛學法的故事。這兩套摹本，雖經五百餘年，但仍鮮艷如初，被人們稱為“寶石畫”。這些畫不僅可使我們得到美的享受，同時也為我們研究我國的繪畫史等等，提供了寶貴的資料。
崇善寺的第三寶，就要數那位於大悲殿正面須彌座上的三尊泥塑貼金菩薩立像了。這三尊佛像是明洪武年間塑制的，距今已有五百餘年的歷史。正中是千手千眼觀音菩薩像；其左為普賢菩薩像；其右為千手千缽千釋迦文殊菩薩像。三尊立像均高八米左右，身姿秀美，面慈目善，雍容華貴，給人可親可敬的感覺。這三尊佛像造型奇特，雕工細膩，實為我國雕塑藝術的珍品。
崇善寺的文物寶藏很有特色，也很珍貴。這是中華民族的驕傲。今天，崇善寺正以它自己獨特的魅力，迎接著日益增多的四方客人。
