基因表達序列標籤

內容介紹

本手冊以基因表達序列標籤（ExpressedSequenceTag，EST）的處理分析流程為主線，結合大量實例，以“跟我學”的方式較為系統地介紹了EST測序，EST數據分析平台的構建，EST的文獻檢索和資料庫查詢，EST序列的聚類組裝，EST的功能分類、代謝途徑及基因產物的詮釋等方面所涉及的方法和常用軟體。此外，還介紹了如何利用大量的網上和專業軟體來從基因和蛋白質水平分析基因及其蛋白質產物的基本特性和功能。從核苷酸水平介紹了開放閱讀框尋找、基因功能預測、基因結構分析、選擇性剪下分析、基因多態性位點分析、基因表達調控區域分析、序列GC含量和密碼子使用偏性統計，以及酶切位點和引物設計等內容。從胺基酸水平介紹了理化性質、結構域、二級結構、三級結構和系統進化等方面的分析。