2008年首批33家國家級國際聯合研究中心
可再生能源綜合技術國際研發中心 中國科學院廣州能源研究所
微納系統及新材料技術國際研發中心 重慶大學
湖南新材料國際研發中心 中南大學
浙江國際納米技術研發中心 浙江大學
生物物理化學國際聯合實驗室 廈門大學
中意中醫藥聯合實驗室 天津中醫藥大學
愛滋病和新發再發傳染病合作基地 中國疾病預防控制中心
中德分子生物學合作研究基地 中國醫學科學院阜外心血管醫院
微電子裝備國際合作基地 中國電子科技集團公司第四十五研究所
山西煤化工技術國際研發中心 中國科學院山西煤炭化學研究所
中韓新材料聯合研究中心 北京有色金屬研究總院
國際反質子與離子大科學研究合作機構 中國科學院近代物理研究所
新生疾病和病毒與病理學國際研發中心 中國科學院武漢病毒所
材料複合新技術國際聯合實驗室 武漢理工大學
新型雷射器研發中心 華中科技大學
幹細胞國際研究中心 北京大學幹細胞研究中心
清華大學新材料國際研發中心 清華大學
新能源與環境國際研發中心 清華大學
全球環境變化人文因素計畫合作中心 中國科學院地理科學與資源研究所
長春國際科技合作與創新園 中國科學院長春分院
綜合信息系統研發國際合作基地 中國科學院軟體研究所
微生物國際研發中心 中國科學院微生物所
半導體照明國際研發基地 中國科學院半導體所
免疫與表象組學國際研究中心 中國科學院生物物理研究所
高能物理國際研發中心 中國科學院高能物理研究所
北京凝聚態物理國際研發中心 中國科學院物理所
中法信息自動化與套用數學聯合實驗室 中國科學院自動化所
系統生物學與中藥國際合作研發中心 中國科學院大連化學物理研究所
系統生物醫學研究中心 上海交通大學
上海中醫藥國際創新園 上海市中醫藥科技產業促進中心
新能源汽車工程中心 同濟大學
生命科學國際研發中心 中國科學院上海生命科學研究院
哈工大國際科技合作基地 哈爾濱工業大學
2013年38家國家級國際聯合研究中心
| 序號 | 編號 | 基地名稱 | 中方依託單位 |
| 1 | 2013B01001 | 中澳中醫藥國際聯合研究中心 | 中國中醫科學院西苑醫院 |
| 2 | 2013B01002 | 創新藥物國際聯合研究中心 | 天津天士力集團有限公司 |
| 3 | 2013B01003 | 光伏技術國際聯合研究中心 | 英利集團有限公司 |
| 4 | 2013B01004 | 分子中醫藥學國際聯合研究中心 | 山西中醫學院 |
| 5 | 2013B01005 | 納米操縱與製造國際聯合研究中心 | 長春理工大學 |
| 6 | 2013B01006 | 先進複合材料國際聯合研究中心 | 哈爾濱工業大學 |
| 7 | 2013B01007 | 幹細胞與再生醫學國際聯合研究中心 | 同濟大學 |
| 8 | 2013B01008 | 發育與疾病國際聯合研究中心 | 復旦大學 |
| 9 | 2013B01009 | 光回響功能分子材料國際聯合研究中心 | 江南大學 |
| 10 | 2013B01010 | 特種裝備製造與先進加工技術國際聯合研究中心 | 浙江工業大學 |
| 11 | 2013B01011 | 智慧型交通國際聯合研究中心 | 安徽科力信息產業有限責任公司 |
| 12 | 2013B01012 | 太赫茲器件研究與套用國際聯合研究中心 | 安徽華東光電技術研究所 |
| 13 | 2013B01013 | 電磁波空間套用國際聯合研究中心 | 華東電子工程研究所 |
| 14 | 2013B01014 | 海洋儀器裝備國際聯合研究中心 | 山東省科學院海洋儀器儀表研究所 |
| 15 | 2013B01015 | 海洋工程材料及深加工技術國際聯合研究中心 | 哈爾濱工業大學（威海） |
| 16 | 2013B01016 | 微納成型技術國際聯合研究中心 | 鄭州大學 |
| 17 | 2013B01017 | 農業生物技術國際聯合研究中心 | 華中農業大學 |
| 18 | 2013B01018 | 建築安全與環境國際聯合研究中心 | 湖南大學 |
| 19 | 2013B01019 | 轉化醫學國際聯合研究中心 | 中山大學 |
| 20 | 2013B01020 | 生物靶向診治國際聯合研究中心 | 廣西醫科大學 |
| 21 | 2013B01021 | 岩溶動力系統與全球變化國際聯合研究中心 | 中國地質科學院岩溶地質研究所 |
| 22 | 2013B01022 | 神經信息國際聯合研究中心 | 電子科技大學 |
| 23 | 2013B01023 | 智慧型感知與計算國際聯合研究中心 | 西安電子科技大學 |
| 24 | 2013B01024 | 光電技術與納米功能材料國際聯合研究中心 | 西北大學 |
| 25 | 2013B01025 | 中東亞乾旱環境變化國際聯合研究中心 | 蘭州大學 |
| 26 | 2013B01026 | 中亞區域跨境有害生物聯合控制國際聯合研究中心 | 新疆師範大學 |
| 27 | 2013B01027 | 結構最佳化理論與套用國際聯合研究中心 | 大連理工大學 |
| 28 | 2013B01028 | 數位化橡膠輪胎裝備國際聯合研究中心 | 軟控股份有限公司 |
| 29 | 2013B01029 | 生物催化技術國際聯合研究中心 | 青島蔚藍生物集團有限公司 |
| 30 | 2013B01030 | 大數據科學與工程國際聯合研究中心 | 北京航空航天大學 |
| 31 | 2013B01031 | 細胞治療國際聯合研究中心 | 中國科學院動物研究所 |
| 32 | 2013B01032 | 口腔醫學國際聯合研究中心 | 北京大學 |
| 33 | 2013B01033 | 機器人微創心血管外科國際聯合研究中心 | 解放軍總醫院 |
| 34 | 2013B01034 | 中德發酵酒品質與安全國際聯合研究中心 | 中國輕工集團 |
| 35 | 2013B01035 | 電子商務信息處理國際聯合研究中心 | 南京財經大學 |
| 36 | 2013B01036 | 奶業國際聯合研究中心 | 中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所 |
| 37 | 2013B01037 | 航天電子信息技術國際聯合研究中心 | 北京遙測技術研究所 |
| 38 | 2013B01038 | 超硬材料先進制備技術國際聯合研究中心 | 昆明理工大學 |
2015年23家國家級國際聯合研究中心
以下列出部分：
質譜科學與儀器國際聯合研究中心 東華理工大學（南昌）
橋樑技術創新與風險防治國際聯合研究中心 福州大學
夸克物質及探測技術國際聯合研究中心 華中師範大學
射電天文與技術國際聯合研究中心 中國科學院新疆天文台
電動汽車動力電池與材料國際聯合研究中心 北京大學深圳研究生院
