“哲人石叢書”立足當代科學前沿，彰顯當代科技名家，紹介當代科學思想，激揚科技創新精神，多角度、全方位地勾勒出一個多彩的科學世界。
1998年底，叢書推出第一輯第一冊——1977年諾貝爾化學獎得主伊利亞·普利戈金的《確定性的終結——時間、混沌與新自然法則》。至今，該叢書已推出四個系列——“當代科普名著系列”、“當代科技名家傳記系列”、“當代科學思潮系列”、“科學史與科學文化系列”。
哲人石叢書第一輯
愛因斯坦奇蹟年——改變物理學面貌的五篇論文（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
病因何在——科學家如何解釋疾病（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
混沌七鑒——來自易學的永恆智慧（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
伊托邦——數學時代的城市生活（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
何為科學真理——物理理論與實在（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
大腦工作原理——腦活動、行為和認知的協同學研究（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
隱秩序——適應性造就複雜性（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
混沌與秩序——生物系統的複雜結構（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
從界面到網路空間——虛擬實在的形上學（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
生物技術世紀——用基因重塑世界（哲人石叢書第一輯：當代科學思潮系列）
展演科學的藝術家——薩根傳（上下冊）（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
亂世學人——維格納自傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
無盡的前沿——布希傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
一隻會思想的蘿蔔——梅達沃自傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
星雲世界的水手——哈勃傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
美麗心靈——納什傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
數字情種——埃爾德什傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
無與倫比的手——弗爾邁伊自傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
迷人的科學風采——費恩曼傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
推銷銀河系的人——博克傳（哲人石叢書第一輯：當代科技名家傳記系列）
探求萬物之理——混沌、夸克與拉普拉斯妖（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
分子探秘——影響日常生活的奇妙物質（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
師從天才——一個科學王朝的崛起（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
霸王龍和隕星坑——天體撞擊如何導致物種滅絕（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
雙螺鏇探秘——量子物理學與生命（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
亞原子世界探秘——物質微觀結構巡禮（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
終極抉擇——威脅人類的災難（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
卡爾·薩根的宇宙——從行星探索到科學教育（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
激情澎湃——科學家的內心世界（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
暗淡藍點——展望人類的太空家園（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
大爆炸探秘——量子物理與宇宙學（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
技術的報復——墨菲法則和事與願違（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
地外文明探秘——尋覓人類的太空之友（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
生機勃勃的塵埃——地球生命的起源和進化（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
PCR傳奇——一個生物技術的故事（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
欺騙時間——科學、性與衰老（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
失敗的邏輯——事情因何出錯，世間有無妙策（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
虛實世界——計算機仿真如何改變科學的疆域（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
超越時空——通過平行宇宙、時間捲曲和第十維度的科學之旅（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
完美的對稱——富勒烯的意外發現（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
確定性的終結——時間、混沌與新自然法則（哲人石叢書第一輯：當代科普名著系列）
哲人石叢書第二輯
科學的統治——開放社會的意識形態與未來（哲人石叢書第二輯：科學史與科學文化系列）
尋求哲人石——鍊金術文化史（哲人石叢書第二輯：科學史與科學文化系列）
一種文化？——關於科學的對話（哲人石叢書第二輯：科學史與科學文化系列）
整體性與隱纏序——卷展中的宇宙與意識（哲人石叢書第二輯：科學史與科學文化系列）
早期希臘科學——從泰勒斯到亞里士多德（哲人石叢書第二輯：科學史與科學文化系列）
科學革命——批判性的綜合（哲人石叢書第二輯：科學史與科學文化系列）
愛因斯坦恩怨史——德國科學的興衰（哲人石叢書第二輯：科學史與科學文化系列）
新生態經濟——使環境保護有利可圖的探索（哲人石叢書第二輯：科學史與科學文化系列）
脆弱的領地——複雜性與公有域（哲人石叢書第二輯：當代科學思潮系列）
科學哲學——當代進階教程（哲人石叢書第二輯：當代科學思潮系列）
技術時代的人類心靈——工業社會的社會心理問題（哲人石叢書第二輯：當代科學思潮系列）
物理與人理——對高能物理學家社區的人類學考察（哲人石叢書第二輯：當代科學思潮系列）
我思故我笑——哲學的幽默一面（哲人石叢書第二輯：當代科學思潮系列）
真科學——它是什麼，它指什麼（哲人石叢書第二輯：當代科學思潮系列）
孤獨的科學之路——錢德拉塞卡傳（哲人石叢書第二輯：當代科技名家傳記系列）
避孕藥的是是非非——傑拉西自傳（哲人石叢書第二輯：當代科技名家傳記系列）
為世界而生——霍奇金傳（哲人石叢書第二輯：當代科技名家傳記系列）
奇異之美——蓋爾曼傳（哲人石叢書第二輯：當代科技名家傳記系列）
邏輯人生——哥德爾傳（哲人石叢書第二輯：當代科技名家傳記系列）
知無涯者——拉馬努金傳（哲人石叢書第二輯：當代科技名家傳記系列）
突破維數障礙——斯梅爾傳（哲人石叢書第二輯：當代科技名家傳記系列）
人生舞台——阿西莫夫自傳（哲人石叢書第二輯：當代科技名家傳記系列）
千年難題——七個懸賞1000000美元的數學問題（哲人石叢書第二輯：當代科普名著系列）
“深藍”揭秘——追尋人工智慧聖杯之旅（哲人石叢書第二輯：當代科普名著系列）
改變世界的方程（哲人石叢書第二輯：當代科普名著系列）
數學大師——從芝諾到龐加萊（哲人石叢書第二輯：當代科普名著系列）
戀愛中的愛因斯坦（哲人石叢書第二輯：當代科普名著系列）
無之書——萬物由何而生（哲人石叢書第二輯：當代科普名普系列）
共創未來——打造自由軟體神話（哲人石叢書第二輯：當代科普名著系列）
反物質——世界的終極鏡像（哲人石叢書第二輯：當代科普名著系列）
人之書——人類基因組計畫透視（哲人石叢書第二輯：當代科普名著系列）
哲人石叢書第三輯
古代世界的現代思考——透視希臘、中國的科學與文化（哲人石叢書第三輯：科學史與科學文化系列）
精神病學史——從收容院到百憂解（哲人石叢書第三輯：科學史與科學文化系列）
愛因斯坦年譜（哲人石叢書第三輯：科學史與科學文化系列）
認識方式——一種新的科學、技術和醫學史（哲人石叢書第三輯：科學史與科學文化系列）
黃鐘大呂——中國古代和十六世紀聲學成就（哲人石叢書第三輯：科學史與科學文化系列）
工程學——無盡的前沿（哲人石叢書第三輯：當代科學思潮系列）
哲人石——探尋金丹術的秘密（哲人石叢書第三輯：當代科學思潮系列）
穿越歧路花園——司馬賀傳（哲人石叢書第三輯：當代科技名家傳記系列）
星光璀璨——美國中學生描摹大科學家（哲人石叢書第三輯：當代科技名家傳記系列）
天才的拓荒者——馮·諾伊曼傳（哲人石叢書第三輯：當代科技名家傳記系列）
曠世奇才——巴丁傳（哲人石叢書第三輯：當代科技名家傳記系列）
傳播，以思想的速度——愛因斯坦與引力波（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
大眾科學指南——宇宙、生命與萬物（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
盛裝猿——人類的自然史（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
阿爾法與奧米伽——尋找宇宙的始與終（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
核子彈秘史——歷史上最致命武器的孕育（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）（上、下冊）
解碼宇宙——新信息科學看天地萬物（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
誰動了愛因斯坦的大腦——巡視名人腦博物館（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
不羈的思緒——阿西莫夫談世事（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
宇宙秘密——阿西莫夫談科學（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
大流感——最致命瘟疫的史詩（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
素數之戀——黎曼和數學中最大的未解之謎（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
心靈的嵌齒輪——維恩圖的故事（哲人石叢書第三輯：當代科普名著系列）
