教學工作
承擔的課程
構造地質學（含大地構造）、油區構造分析、含油氣盆地分析。
教學論文：
[1] 吳孔友，洪梅，陳清華．構造地質學實驗CAI課件系統及其套用．實驗技術與管理，2000，71: 23-27.
[2] 吳孔友，洪梅．構建新世紀資源勘查工程專業實踐教學體系．石油高等教育，2000，74：12-15.
[3] 吳孔友．完善《（石油）構造地質學》教學體系，培養高素質石油專門人才．高教論壇，2009，5：55-58．
編寫教材：
[1] 吳孔友，冀國盛．秦皇島地區地質認識實習指導書．東營石油大學出版社，2007．
學術研究
1、承擔的科研項目
2004-2005，柴達木盆地東部石油地質條件和中石化區塊有利勘探方向，中石化，縱向，120萬；
2005-2007，西北緣烏-夏斷裂帶精細勘探潛力研究，中石油，縱向，800萬；
2006-2008，柴達木盆地西部疊層石紋層的成因與地球化學研究，國家自然科學基金，縱向，29萬；
2008-2009，冀中探區前第三系基底結構以及潛山、潛山內幕成藏條件與勘探方向研究，華北油田，橫向，200萬；
2008-2009，湘桂地區海相油氣地質條件，中石化，縱向，200萬；
2008-2010，不整合縱向結構特徵及其控藏作用，國家自然科學基金，縱向，29萬；
2009-2009，惠民凹陷南部地區輸導體系特徵及其成藏作用研究，勝利油田，橫向，48萬；
2009-2011，不整合分層結構與隱蔽油氣藏勘探，山東省自然科學基金，縱向，5萬；
2、發表的論文
[1] 吳孔友，陳清華. 青藏地區措勤盆地它日錯深凹陷主含油氣系統. 石油大學學報，1999，4（6）: 13-15.
[2] 吳孔友，王建平，陳清華. 西藏措勤盆地它日錯地區下二疊統昂傑組的發現及其地質意義.地球學報，2000，21（1）：71-77.
[3] 吳孔友，洪 梅，劉偉. 徐黑-埕北斷階區古岩溶測井相與演化模式. 西南石油學院學報，2000，22（3）：21-24(EI檢索).
[4] 吳孔友，洪梅. 西藏措勤盆地它日錯深凹陷子含油氣系統. 新疆石油地質，2001，22（2）: 119-121.
[5] 吳孔友，查明，柳廣弟. 準噶爾盆地二疊系不整合面及其油氣運聚特徵 . 石油勘探與開發，2002，29（2）: 53-57(EI檢索).
[6] 吳孔友，郭志強，田 輝.吉爾嘎朗圖凹陷寶饒斷層的構造特徵及其控油作用．新疆石油學院學報，2003，15（1）: 16-20.
[7] 吳孔友，查 明，洪 梅. 準噶爾盆地不整合結構的地球物理回響及油氣成藏意義．石油實驗地質， 2003，25（4）: 328-332.
[8] 吳孔友，查 明， 洪 梅. 準噶爾盆地不整合結構模式及半風化岩石的再成岩作用．大地構造與成礦學， 2003，27（3）: 270-276.
[9] 吳孔友，查 明，曲江秀等. 博格達山隆升對北三台地區構造形成與演化的控制作用. 石油大學學報（自然科學版），2004，28（2）:1-5 (EI檢索).
[10] 吳孔友，查明，王緒龍，郭志強. 準噶爾盆地莫索灣地區斷層控油作用. 地質力學學報，2005，11（1）: 60-66.
[11] 吳孔友，查明，王緒龍，曲江秀，陳新. 準噶爾盆地構造演化與動力學背景再認識. 地球學報，2005，26（3）: 217-222.
[12] 吳孔友，查明，鍾建華. 準噶爾盆地超壓系統分布及其演化. 地質科學，2006，41（3）: 636-647.
[13] 吳孔友，查明. 柴達木盆地北部塊斷帶斷層控烴作用. 石油學報，2007，28（3）: 17-22(EI檢索).
[14] 吳孔友，查明，王緒龍. 準噶爾盆地成藏動力學系統劃分. 地質論評，2007，53（1）: 75-82.
[15] 吳孔友. 莫索灣地區侏羅系油氣成藏主控因素分析. 天然氣工業，2007，27（3）: 36-39.
[16] 吳孔友，洪梅. 烏-夏斷裂帶侏羅系油氣成藏主控因素. 新疆石油地質，2007，28（4）: 434-436.
[17] 吳孔友，查明，肖敦清，袁淑琴．黃驊坳陷埕北斷坡不整合與油氣成藏．古地理學報，2008，10（5）: 545-554.
[18] 吳孔友．準噶爾盆地烏-夏地區油氣成藏期次分析．石油天然氣學報，2009，31(3): 18-23.
[19] 吳孔友, 劉磊. 大南盤江地區構造對油氣藏破壞作用研究. 大地構造與成礦學, 2010, 34(2): 255-261.
3、 出版專著
[1] 查明，吳孔友，曲江秀，陳中紅．斷陷盆地油氣輸導體系與成藏作用．東營: 中國石油大學出版社，2009．
獲獎情況
1、教學獲獎
2003，“油區構造分析CAI課件”獲中國石油大學優秀CAI課件一等獎，排名第1；2005，“油區構造分析CAI課件”獲中國石油教育學會網路課件大賽一等獎，排名第1。
2、科研獲獎
2002，“準噶爾盆地地溫場及油氣運聚史研究”，獲中國石油大學優秀科技成果二等獎，排名第2。
2003，“準噶爾盆地北三台地區油氣成藏史研究”，獲中國石油大學優秀科技成果二等獎，排名第2。
2004，“不整合面研究的理論與方法體系及其在含油氣盆地中的套用”，獲中國石油大學優秀科技成果二等獎，排名第2。
2004，“渤海灣盆地潛山油氣藏分布與典型潛山成藏機理研究”，獲中國石油大學優秀科技成果三等獎，排名第2。
2005，“黃河下游及三角洲現代沉積構造與沉積環境的研究”，獲中國石油大學優秀科技成果一等獎，排名第2。
2005，“莫索灣地區油氣成藏及勘探方向研究”，獲中國石油大學優秀科技成果三等獎，排名第1。
科研方向
1、不整合結構控藏作用研究
首次將不整合在縱向上劃分為底礫岩（或水進砂體）、風化粘土層、半風化岩石，提出了覆蓋區三層結構的識別方法，研究了不同結構層的成藏意義，並通過物理模擬實驗進行了驗證。該方法在準噶爾盆地油氣勘探過程中得到廣泛使用，並取得了良好的勘探效果。本研究方向得到國家自然科學基金、山東省自然基金、國家油氣專項的聯合資助，多篇論文被EI檢索，參加了多次國際會議。
2、斷層封閉性及其成藏作用研究
斷層是控制含油氣盆地各種地質作用和油氣生、運、聚、散、分布的根本原因，斷層與油氣藏的關係好比枝(斷層)與果(油氣藏)、藤(斷層)與瓜(油氣藏)的關係。斷層既可以作為油氣運移通道，又可以成為油氣聚集的遮擋面，究竟何時開啟，何時封閉，需要通過定性和定量的方法進行評價。在斷層封閉性評價中，我們運用了側向封閉和垂向封閉雙向評價的方法，提出斷層緊閉指數評價參數，探討了成岩膠結作用對斷層封閉性的貢獻；在斷層開啟性評價中，首次建立了斷層輸導油氣能力的定量數學模型。這一成果在核心期刊上發表多篇論文，其中多篇論文被EI檢索，同時參加了國際會議。
3、成藏過程與成藏模式研究
從油氣藏非均質性研究入手，採用定性手段和定量方法，明確油氣充注時間和期次，結合構造演化分析，恢復油氣成藏過程，建立油氣成藏模式。
