永泰二年(766)，方清戰敗犧牲。仁歡以赤山鎮賦役繁難不便，奏請建縣。朝廷詔劃黟縣六鄉和浮梁縣東北，委仁歡建縣。仁歡統籌規劃，“方其街如田字，曲其水如之字，井列七星，橋分八卦，城環百武，門通七鄉”(《吳氏重修宗譜·尤侯建縣右吳公祠碑銘》)，以志和祖基為縣治，改鎮為縣，合祁山、閶門二景曰祁門縣。事成，朝廷仍命知石州事，從政二年，以父母年老上表乞回鄉任職，朝廷恩準帶刺史俸知祁門縣事。仁歡在任9年，百姓安居樂業。後升鄭王府長史，辭不就，隱居縣西武陵。元和二年(807)，卒於鄉，終年80歲。
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唐代宗寶應元年（762），江南饑荒，民不聊生，歙人方清率領饑民起義，永泰元年（765），攻下歙州，殺死歙州刺史龐睿，占據黟縣赤山鎮，設定了閶門縣。吳仁歡乘機而起，聚集本地武裝數千人，配合官兵，第二年平定了方清起義。代宗下詔召他入朝，授予朝散大夫、石州（治所在今山西離石）刺史，恩賜紫金魚帶。因赤山鎮距黟遙遠，賦役繁難不便，吳仁歡遂上奏朝廷，乞請改鎮為縣。朝廷遂劃黟縣6鄉和浮梁縣東北，委仁歡建置新縣。仁歡統籌規劃，“方其街如田字，曲其水如之字，井列七星，橋分八卦，城環百武，門通七鄉”，以張志和祖基為縣治，因境內有祁山、閶門二景，故命縣名為“祁門”。事成之後，朝廷仍命其知石州事，但是吳仁歡為了不遠離自己的鄉土勢力，藉故父母年老，請求回家鄉任職。朝廷同意他帶著刺史的官俸去任祁門縣令，於是吳仁歡就成了祁門建縣後的第一任縣令。
吳仁歡在任上頗注意對百姓的安撫，使百姓在兵荒馬亂、流離失所的長期痛苦生活中得到一些休養生息，他因此逐漸得到祁門百姓的擁戴。9年後，朝廷又升吳仁歡為鄭王府長史，但他自覺年事已高，精力減退，堅決辭位歸田。
據說祁西武陵源，原名松林源，吳仁歡胞兄吳仁政性愛山水，一日游至此地，遇一老叟引入山林，手指山巔一亭說，八仙之一的藍采和曾在此吹笛。吳仁政認為這是仙人指點，又愛這裡山林清幽，遂與吳仁歡攜子來此築廬定居，過著耕讀的隱居生活。
吳仁歡死後，祁門百姓在武陵源建了“吳長史祠”紀念他，後祠遷至縣城。自唐至清，祭祀不斷。（摘自《祁門風物》）
