移植前檢測
1.ABO血型和HLA抗體檢測
保證受者血清中不含針對供者同種異型抗原的抗體，以避免發生超急性排斥反應。通常選擇與受者ABO血型、Rh血型抗原相同的供者，取其淋巴細胞與受者血清進行交叉細胞毒試驗，檢測受者體內是否存在針對供者人類白細胞抗原（HLA）的抗體。細胞毒試驗陽性表明供者不是合適人選。
2.HLA分型
移植前應對供者和受者進行HLA分型鑑定，以便從中選出HLA型別最接近的供者器官進行移植，現採用基因分型技術如聚合酶鏈反應（PCR），對供者和受者DNA進行分型鑑定。不同HLA基因座位產物對移植排斥各異，一般而言，HLA-DR編碼的分子在T細胞應答中有重要作用，對移植物存活影響較大，對移植排斥最為重要。骨髓移植物中含有大量免疫細胞，若HLA不匹配，所致排斥反應會非常強烈，且不易被免疫抑制劑所控制，對HLA配型的要求較高。
移植後的免疫檢測
移植後的免疫監測有助於及時採取相應的防治措施，以防止發生排斥反應。臨床上常用的免疫學檢測指標包括：淋巴細胞亞群百分比和功能測定；血清中細胞因子、C-反應蛋白、抗體、補體、可溶性HLA分子水平或細胞表面黏附分子、細胞因子受體表達水平等不同的免疫分子標誌物水平測定；尿微量蛋白檢測。儘管上述指標都有一定參考價值，但存在一些問題，如特異性不強、靈敏度不高等。
