同源克隆

所謂“同源克隆”，即是我們想獲得物種A的某個基因時，因為物種A尚未完成基因組測序工作（如：小麥），或者是該基因缺少其轉錄信息（缺少全cDNA測序資料）以至於我們不知道其中內含子和外顯子所在的區段。

在如上情況下，我們僅知道這個基因可能的功能信息，那么為獲得這個基因，則需要利用生物信息學的手段從其它與該物種進化關係上較為接近的（如：小麥和水稻同為禾本科），已知基因信息較多的（如：擬南芥、水稻）物種B上尋找已經研究過或預測過的該功能的基因，並以此為模板，分析該功能基因之中外顯子的保守序列設計引物，來在物種A的cDNA上進行擴增，以期得到目的基因的保守區域。 在分析過程中要充分考慮到該蛋白在各物種中的進化關係（一般為由簡單到複雜），確定其保守區域。在獲得一段保守區域後，利用RACE技術，分別向該基因的5’端和3’端進行延伸，因為真核生物為單順反子結構，所以如此便可得到該基因的cDNA全長。同源克隆涉及問題較多，所以在實際操作中，這往往是一件繁瑣、複雜的過程，需要在實驗過程中不斷調整策略方法才能最終得到我們期望的目的基因。