館藏文物
吉木薩爾縣博物館經鑑定，展品中國家一、二、三級文物計20件，其中不少具有很高的歷史價值、科學價值和藝術價值。如漢時期的彩陶罐是西域地區彩陶文化的典型器物。唐時期的比丘頭像、比丘身像、龍首、吉木薩爾縣博物館現有藏品546件，多以搶救性出土、徵集和捐贈等方式獲得。藏品按材質劃分為金屬器類、陶瓷類、石器類、竹木器物、玉器類等，錢幣則單獨劃分。其中金屬器物104件，陶瓷器物170件，其餘為石、玉、竹木器物。錢幣總計256枚。各類具有重大科學、歷史、藝術價值藏品的保護尤為重要，博物館為此安裝了安防設備，設立專門的藏品保管人員，制定藏品安全管理制度，定期對藏品存放狀況進行檢查。因展館採用水熱採暖設備，四季溫度、濕度條件相差不大，而且適時通風，基本符合這些藏品所需的安全存放條件。
發展歷史
2006年10月，吉木薩爾縣文博中心大樓在福建省援疆幹部及社會各界的大力支持下開工建設，2008年5月正式完工。該文博中心占地面積13510平方米，投資3500萬元，是一座大型的融北庭鮮明的區域文化與盛唐歷史文化於一體的仿古建築，也是縣內最大的一所綜合性服務機構，內設三個中心、四個展館。吉木薩爾縣博物館就位於該文博中心大樓四樓占地約800平方米，於2008年5月1日正式開放。下設博物館辦公室和文物保護部，具體負責博物館開展、運行的各項事務。文化建設
高素質的人才隊伍是文博事業發展的核心動力。吉木薩爾縣博物館為此狠抓文博人才的培養和文博隊伍的建設，採取請進來、派出去的學習方式，先後邀請中國社科院、新疆社科院、新疆大學、敦煌研究院等處知名專家、學者來吉木薩爾地區考察調研，派文博專業人員跟隨學習；另外自籌資金，派專業人員參加新疆考古所、社科院在新疆和田、伊犁阿勒泰等地的考古發掘；參加新疆考古所的器物繪圖與文物修復學習；參加新疆自治區文物局舉辦的全疆講解隊伍的培訓班等，通過不懈的努力，文博隊伍的專業水平已逐步提高，文博工作人員已基本掌握了考古、修復、繪圖、講解、鑑定等多方面專業知識，整體專業水平已明顯提升，為文博事業的新發展奠定了良好基礎。
開展館際之間的交流也是促進文博事業發展的好方法。吉木薩爾縣博物館自2008年5月至2009年12月先後同新疆昌吉州博物館、新疆奇台縣博物館、新疆烏魯木齊市文管所等就文物展陳、保護、講解、鑑定等方面展開交流、學習與協作，相互調撥文物進行展覽，以促進博物館工作的不斷創新與發展。
行政機構
吉木薩爾縣博物館由吉木薩爾縣文物局進行管理，是依照公務員管理的行政事業單位，經濟來源主要為財政撥款。博物館下設博物館辦公室和文物保護部，人員編制核定11人，從事業務工作人員6人，均為大專學歷以上的中、青年。博物館堅持“三貼近”原則，為公眾提供文物展示、徵集、講解、鑑定、文物保護、宣傳、利用等服務並不斷增強博物館的宣傳展示和服務水平，充分發揮博物館在公眾思想道德建設中的獨特作用，把博物館作為大眾受教育的基地，作為人們了解、研究、發掘新疆北庭深厚歷史與文化的基地，更是愛國主義教育基地和青少年校外活動基地。博物館嚴格遵照上級博物館的指示精神實行免費開放制度，年均接待國內外參觀人員2萬人。
