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“六都書院”名字的由來：太平天國後期，清總兵方耀以清鄉為名，勒索百姓財帛，人民怨聲載道，清政府為平民怨，派欽差前來飭查，方耀為逃罪責，連忙召集峽山、舉練、黃隴、貴山、直浦、竹山六個都的紳耆籌建書院，以“罰款興學”的美名應付欽差的飭查。書院修建經費，實為六個都分頭攤派，書院建成，名為“六都書院”。
六都書院建成後，幾度擴建和更名。民國9年（1920）年，旅滬士商建前樓，更名為“六都中學”。民國20年，旅暹華僑捐款建學生宿舍，翌年又建造禮堂。至此，學校初具規模，教堂設備為當時縣內中學之冠。抗日戰爭時期，學校內遷，校舍受嚴重破壞。解放後，人民政府多次撥款維修。1950年，“六都中學”更名為“潮陽縣第二中學”。1957年，擴建北山教室區、教師宿舍。1958年，擴建南山教室區、實驗室。1959年，擴建東山教室區。公社化時期，“潮陽二中”更名為“峽山中學”；“文化大革命”初期，又更名為“潮陽縣工農兵中學”，不久又復名為“峽山中學”。1971年，改建原書院院落為學校大禮堂。1978年，東山教室區前面擴建教學大樓，前樓樓座闢為科學館。1985年初，又恢復“六都中學”校名。1993年開始對六都中學進行改造。至1999年完成第一、二期改造工程，總投資2125.79萬元，其中汕頭、潮陽二級市人民政府各撥款500萬元，其餘由峽山鎮政府自籌解決。2000年4月旅港同胞陳有慶及旅泰僑胞陳有漢捐資興建“陳弼臣體育館”及“有慶樓”、“有漢樓”，總建築面積8569平方米。至此，校舍規模比原書院擴大近20倍，成為本區大型的重點學校之一。
一百多年來，這所學校的畢業生，不少人成為國外經濟實業界著名人物，如陳弼臣先生；有的經過深造，成為國內外的知名學者，如59屆高中畢業的陳運雄博士、翁甲隆工程師。
