1562年1月12日， 卡洛·埃馬努埃萊在位於皮埃蒙特的利沃利城堡內出生。 他是薩伏依公爵埃馬努埃萊·菲利貝托和貝里女公爵，法蘭西的瑪格麗特的獨子。 他於1580年8月30日繼承了爵位。
卡洛·埃馬努埃萊接受了良好的教育，他聰明伶俐，會講義大利語、法語、西班牙語和拉丁語。 雖然他矮小駝背，但是卻不妨礙他證明自己是個是個能幹的軍人。雄心勃勃的卡洛·埃馬努埃萊還在公國內推行擴張政策，試圖將自己的公國變成王國。
1588年秋， 卡洛·埃馬努埃萊乘法國國內在其表哥亨利三世的統治下爆發法國宗教戰爭之時占領了受法國庇護的薩盧佐侯國。 亨利四世要求卡洛·埃馬努埃萊歸還土地，但是卻遭到了他的拒絕，而戰爭也隨之而來。 1598年5月2日， 《韋爾萬條約》的簽訂不僅結束了法國和西班牙之間廣泛衝突， 也使得薩盧佐目前尚未解決的獨立問題得以解決。 在公爵與西班牙談判後，亨利威脅說要重返戰場。 1601年1月17日 《里昂條約》簽訂， 卡洛·埃馬努埃萊用布雷斯和阿爾卑斯山上的其他領土換取了薩盧佐。 按照條約的規定，公爵還將要消滅公國內的一切新教信仰。
1602年，卡洛·埃馬努埃萊開始襲擊日內瓦。 在屢遭失敗後，孤注一擲的卡洛·埃馬努埃萊於同年12月11日晚率領軍隊朝日內瓦城進發， 12日凌晨兩點，薩伏依軍隊包圍了日內瓦城。 為了能出其不意，他命令薩伏依軍隊的胸甲騎兵紛紛下馬，全副武裝的士兵開始攀爬日內瓦城的城牆。 然而，此情此景卻被日內瓦城的守夜的士兵目睹，他們發出了警報，日內瓦民兵也聞訊而至。 這次突襲讓卡洛·埃馬努埃萊元氣大傷，一共有54名薩伏依士兵被殺，眾多的士兵被俘。 卡洛·埃馬努埃萊的軍隊不得不驚恐地撤退，被俘虜的士兵也遭到了處決。 為了紀念此次“登城事件”，日內瓦人便將每年的12月11日夜到12月12日設為登城節。
