鐘山書院以南京東郊鐘山而得名,初設於雍正二年(1724年)。由兩江總督查弼納創建。停辦後於道光九年(1829年)重建。1853年太平天國時期停辦。1864年清克南京城後兩江總督曾國藩重建。1903年,改為江南高等學堂。歷任山長楊繩武 夏之容 盧文弨 錢大昕 姚鼐 胡培翬 陶澍 唐鑒 李聯琇 梁鼎芬 繆荃孫