該所確定以元代文史研究和元代古籍整理為科研重點。北京師範大學原校長陳坦教授雖不傳治元史，但這位史學大師有開元史的名篇傑稿影響很大。他的手稿《元人文集六十種子目索引》，現存北京圖書館。啟攻教授受陳垣先生影響，對元代詩文非常重視，曾開設元代詩文研究的專門課程。郭預衡教授正在編寫《中國散文史》，元代部分已交稿，並發表有論元代散文之專文。李修行教授參加游國恩等主編的《中國文學史》的編寫工作，負責執筆元代大部分章節，並編有《宋遼金元文學史綱要》等。1988年10月開始，集體編纂《國內所見元人別集版本目錄》，已完成初稿。李修生教授主持編纂的《全元文》，已列入古籍整理規劃項目。該所還完成了《元史選擇》，並開始全部《元史今譯》的工作。
許嘉路教授主持編寫了《傳統語言學辭典》（已出版）。他與北京大學安平秋副教授共同主持二十四史今譯和《三隱廬叢著》編纂的工作。白壽彝教授主持編注的《文史英華》，是一部文史名著精選本。劉乃和教授主持編寫的《陳垣年譜》，將在明年完成。
加強對中國傳統文化的研究是古籍整理研究理論建設的需要，該所編寫了《八十年代傳統文化問題討論論點摘編》，為召開“古籍整理與傳統文化”學術討論會做準備。李修生教授、龍德壽副教授還共同主編了《古籍整理與傳統文化》一書。
為了適應古籍整理學科教學需要，該所還擬編寫一套古籍整理基礎教學叢書，已完稿的有曾貽芬副教授的《中國文獻學史》、周紀彬副教授的《校勘學》等。
該所編有《文史論考》輯刊，作為《北京師範大學學報增刊》，不定期出版。
陳垣研究室成立於1986年。研究室成立後，積極開展研究工作。為紀念陳垣先生誕生一百一十周年，特編輯了紀念冊，冊中收照片二百餘幅，分生平事跡、墨跡著作兩部分；又編成紀念陳垣校長誕辰一百一十周年《學術論文集》，均已出版。
