分子模擬法集現代計算化學之大成,包括分子力學法、蒙特卡洛法、分子力學法及分子動態法。其中,分子動態法具有其他方法所沒有的特點,即有“動能”項及分子結構的變化作為時間函式。不象一般量子力學、分子力學與蒙特卡洛法僅用勢能項掃描述分子體系。描述的往往是真空狀態、絕對零度的分子結構。由於運動是溫度的函式,該法能夠模擬各種溫度下的各種分子體系。這對於計算有溫度效應與時間效應的玻璃化轉變、結晶過程、輸送過程、膨脹過程馳豫過程以及在外力場中的形變過程是非常重要的。
由於沒有近似(除力場參數是從實驗中得到的之外)而遵從嚴格的物理訂定律,分子模擬法也被稱作“計算機實驗”方法。一方面它可以用來模擬、研究現代物理實驗方法尚難以為計的物理現象與物理過程(如分子在各種表面上的動態行為過程等),從而發展新的理論。另一方面,它可以用來縮短新材料研製的周期,降低開發成本。在螢幕上設計出化學上或拓樸上不同的分子,通過分子模擬預報出新分子各種穩定的聚集結構,進而預報它們應具有的物理化學性質,篩選新材料的設計方案。
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