來源
1、來自對兔子的行為觀察。據說兔子在進入發情期的時候會相互聞舔性器官，或者直接在同性身上發泄。東漢王充更是在《論衡·奇怪》中記載“兔舐毫而孕，及其生子，從口而出也。”可見兔子的性行為是十分怪異的。也許因為男性間的性行為方式與兔子差不多，男妓才被戲稱為兔兒爺。
2、來源於《木蘭辭》“雄兔腳撲朔，雌兔眼迷離；雙兔傍地走，安能辨我是雄雌！”，兔子溫柔可愛，意表不分性別的戀愛。
3、眾所周知，孌童之風古已有之，至明清一時較為盛行。而與此同時，北京地帶開始流行拜“兔爺”。兔兒爺的起源約在明末。明人紀坤的《花王閣剩稿》：“京中秋節多以泥摶兔形，衣冠踞坐如人狀，兒女祀而拜之。” 另外，兔爺本指月宮嫦娥之玉兔，其泥塑造型的面部卻胭脂紅唇絕類窈窕女子，與清朝時期的“相公”打扮類似（相公，本義是上層社會中的年輕男子，但在清朝也用它來稱扮演女人的男演員，後來則成為男伶而同時是同性戀對象的一種稱呼。）在天津，男娼往往被稱作“兔二爺”而兔二爺正是兔爺在天津的稱呼。
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《子不語》：清代初年，有一位年輕的巡按御史，被派到福建去。當地一位名叫胡天保的人，很喜歡這位巡按御史的美貌，每次巡按御史升堂，一定偷偷窺視他。巡按御史巡至別的地方，胡天保也跟著去，後來他甚至還會在廁所偷窺巡按御史的臀部。巡按御史問他，他剛開始不肯說，後來被刑求之後才說：“實見大人美貌，心不能忘。明知天上桂豈為凡鳥所集，然神魂飄蕩，不覺無禮至此。”巡按御史大怒，將他殺死。
過了一個月，胡天保託夢給鄉親，說：“我以非禮之心，乾犯貴人，死固當然。畢竟是一片愛心，一時痴想，與尋常害人者不同，冥間官吏俱笑我、揶揄我，無怒我者。今陰官封我為兔兒神，專司人間男悅男之事，可為我立廟招香火。”
習俗
福建本有聘男子為契弟的風俗，鄉裡間人聽到這段託夢之語，爭相集資建廟。後來，只要有男求男而不可得者，都去求禱兔爺。
