供奉仙聖
九龍別院屬於全真道派,有弟子一百二十人,供奉呂祖仙師為主神。院內之主要誕期為呂祖誕及三元誕,而慶典包括春秋二祭及盂蘭法會圓隆大典。
宗教活動
九龍別院設有靈牌位安奉服務,並承接院內外之功德法事,祈福超幽。別院有經生約三十人,全由母壇玉清別館經懺主任指導培訓。每月初一、十五,別院經生皆朝真禮斗,以祈世人平安,增壽延年。
社會活動
九龍別院每年均會參與捐款各項慈善活動,服務社會。
文化活動
九龍別院曾經重印《呂祖全書》及出版《玄音合刊》、《善道篇》、《明心文集》及《青少年之覺醒》等善書,並與母壇玉清別館及智玄精舍組團往北京白雲觀訪問,進行文化交流的活動,為“方方闡教、度盡世人”的目標作出努力。