歷史與沿革
1996年，深圳作為全國口岸管理體制改革的試點，將隸屬於深圳市的深圳海上安全監督局，與隸屬於交通部的蛇口海上安全監督局合併，組建交通部深圳水上安全監督局。1999年，根據全國水監體制改革的統一部署，深圳水上安全監督局更名為“中華人民共和國深圳海事局”。
機構設定
內設處室
通航管理處 船員管理處 法規規範處 船舶監督處 危管防污處 規費征稽處 辦公室 財務會計處 科技信息處 人事教育處 綜合計畫處 黨組工作部 紀檢監察處 船舶交通管理中心 審計處 政務中心
分支機構
蛇口海事局
南山海事局
寶安海事局
大鏟海事局
鹽田海事局
大亞灣海事局
職能
一、貫徹和執行國家海洋管理、環境保護、水上交通安全、航海保障、船舶和水上設施檢驗方面的法律、法規和規範；實施有關多邊與雙邊國際條約，結合本轄區實際情況，制訂實施細則，並監督執行。
二、負責轄區內國際航行船舶和國內航行船舶的船舶登記以及船舶法定配備的操作性手冊與文書審核簽發工作；負責轄區內外國籍船舶管理工作和審理外國籍船舶（包括港澳地區船舶）進入本轄區未開放水域或港口的申請，並按規定程式上報審批。
三、按照授權負責制訂船舶檢驗、引航機構與船員管理公司的資質標準和船員、引航員培訓機構資質及其質量體系的審核與監督，以及船舶所有人、經營人實施有關法律、法規、國際公約的指導與管理工作。
四、按照授權負責船員、引航員、磁羅經校正員和海上設施工作人員適任資格、培訓、考試和發證管理工作、船員服務簿發放及管理、海員出入境證件發放及管理、船員專業與特殊培訓管理及其考試發證工作。
五、負責轄區船舶防台、水上搜尋救助工作，負責轄區內水上交通事故、污染事故及水上交通違法案件的調查處理工作。
六、負責轄區內港口國監督、船舶安全檢查、國際航行船舶進出口岸查驗、國內航行船舶進出港簽證、強制引航監督、船舶裝運危險貨物和其他貨物安全監督、靠泊安全監督、防止船舶污染水域監督工作。
七、負責轄區內沿岸國管理、海區（或水域）巡邏、通航環境管理與通航秩序維護、水上水下施工作業審核及監督管理、錨地和重要水域劃定、港區岸線使用審核、航行警（通）告發布等工作。審批轄區水域的沉船、沉物打撈以及礙航物清除。
八、按照授權監督管理或指導規定區域內的船舶及水上設施檢驗工作。
九、按照授權負責規定區域內海上幹線公用航標和主要沿海港口航標的規劃建設和管理工作。
十、按照授權負責規定區域內相關水域的檢測、基本測量、水文觀測及其資料的收集、編印相關航海圖書資料等工作。
十一、按照授權管理、指導或具體負責轄區內的水上安全通信工作。
管轄區域
深圳海事局管轄海域由東、西兩部分組成。
1. 西部水域：
深圳海事局管轄區域下列A、B、C、D各點順序連線與深圳一側海岸、深圳河中心線及香港特別行政區海上界線6、7、8、9、10、11、12號各點順序連線所圍成的海域（香港特別行政區管轄海域除外）。
A：東寶河口（22°44′21″N/113°45′15″E）
B：22°44′08N/113°44′00″E
C：內伶仃西側牛利角燈樁
D：雞翼角燈樁（22°14′34″N/113°49′38″E）
6號點：22°30′36.23″N/113°59′42.20″E
7號點：22°28′20.49″N/113°56′52.10″E
8號點：22°25′43.7″N/113°52′08.8″E
9號點：22°20′00″N/113°52′08.8″E
10號點：E22°16′23.2″N/113°50′50.6″E
11號點：E22°16′03.8″N/113°50′20.4″E
12號點：22°14′21.4″N/113°49′35.0″E
2. 東部水域：
下列東、西界線之間的中國管轄海域。
東界線：下列E、F、G、H、I、J各點順序連線再自J點向正南延伸：
E：22°40′08″N/114°30′32″E
F：22°39′42″N/114°35′00″E
G：22°39′25″N/114°35′31″E
H：22°39′16″N/114°35′41″E
I：22°30′00″N/114°38′18″E
J：22°32′45″N/114°53′00″E（大星山頂角）
西界線：香港特別行政區大鵬灣海域下列1、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21號各點順序連線再從21號點沿經度線向正南延伸。
1號點：22°32′37.2″N/114°13′34.85″E
31號點：22°32′37.2″N/114°14′01.1″E
30號點：22°33′02.6″N/114°14′13.4″E
29號點：22°33′20.6″N/114°14′55.2″E
28號點：22°33′55.8″N/114°16′33.7″E
27號點：22°34′00.0″N/114°18′32.7″E
26號點：22°34′06.0″N/114°19′58.7″E
25號點：22°33′43.2″N/114°26′02.3″E
24號點：22°32′41.9″N/114°27′18.5″E
23號點：22°28′07.4″N/114°27′17.6″E
22號點：22°21′54.5″N/114°30′08.8″E
21號點：22°08′54.5″N/114°30′08.8″E
聯繫方式
地址：廣東省深圳市福田區濱河路2031號海安中心大廈
郵政編碼：518032
