《酶的命名和國際分類編號》

《酶的命名和國際分類編號》

早期,酶的名稱多數是由酶發現者根據酶所催化的底物、反應的類型或酶的來源命名一習慣名稱。如催化澱粉水解的稱為澱粉酶;催化底物分子水解的稱水解酶;按酶來源的如胃蛋白酶…。缺乏系統的規則,不能說明酶促反應的本質,常會出現混亂。1961年國際生物化學和分子生物學學會(IUBMB)根據酶的分類為依據,提出系統命名法,規定每一個酶有一個系統名稱(systematic name),它標明酶的所有底物和反應性質。各底物名稱之間用“:”分開。如草酸氧化酶,因為有草酸和氧兩個底物,套用:隔開,又因是氧化反應,所以其系統命名為:草酸:氧氧化酶;如有水作為底物,則水可以不寫。有時底物名稱太長,為了使用方便,國際酶學學會從每種酶的習慣名稱中,選定一個簡便和實用的作為推薦名稱(recommended name)。可從手冊和資料庫中檢索。

酶

酶的國際系統分類編號(EC number)

酶的染色酶的染色
國際系統分類法按酶促反應類型,將酶分成六個大類:
1、氧化還原酶類(oxidoreductases) 催化底物進行氧化還原反應的酶類。包括電子或氫的轉移以及分子氧參加的反應。常見的有脫氫酶、氧化酶、還原酶和過氧化物酶等。
2、轉移酶類(transferases) 催化底物進行某些基團轉移或交換的酶類,如甲基轉移酶、氨基轉移酶、轉硫酶等。
3、水解酶類(hydrolases)催化底物進行水解反應的酶類。如澱粉酶、糧糖苷酶、蛋白酶等。
4、裂解酶類(lyases)或裂合酶類(synthases) 催化底物通過非水解途徑移去一個基團形成雙鍵或其逆反應的酶類,如脫水酶、脫羧酸酶、醛縮酶等。如果催化底物進行逆反應,使其中一底物失去雙鍵,兩底物間形成新的化學鍵,此時為裂合酶類。
5、異構酶類(isomerases)催化各種同分異構體、幾何異構體光學異構體間相互轉換的酶類。如異構酶、消旋酶等。
6、連線酶類(ligases)或合成酶類(synthetases)催化兩分子底物連線成一個分子化合物的酶類。
上述六大類酶用EC(enzyme commission)加1.2.3.4.5.6編號表示,再按酶所催化的化學鍵和參加反應的基團,將酶大類再進一步分成亞類和亞-亞類,最後為該酶在這亞-亞類中的排序。如α澱粉酶的國際系統分類纊號為:EC3.2.1.1
EC3——Hydrolases 水解酶類
EC3.2——Glycosylases 轉葡糖基酶亞類
EC3.2.l——Glycosidases 糖苷酶亞亞類i.e.enzymes hydmlyzing O-and S-glycosyl compound即能水解O-和S-糖基化合物
EC3.2.1.1 Alpha-amylase, α-澱粉酶
值得注意的是,即使是同一名稱和EC編號,但來自不同的物種或不同的組織和細胞的同一種酸,如來自動物胰臟、麥芽等和枯草桿菌BF7658的α-澱粉酶等,它們的一級結構或反應機制可解不同,它們雖然都能催化淀扮的水解反應,但有不同的活力和最適合反應條件。
可以按照酶在國際分類編號或其推薦名,從酶手冊(Enzyme Handbook)、酶資料庫中檢索到該酶的結構、特性、活力測定和Km值等有用信息。著名的手冊和資料庫有:

手冊

1、Schomburg,M.Salzmann and D.Stephan:Enzyme Handbook 10 Volumes
2、美國Worthington Biochemical Corporation:Enzyme Manual
(http://www.worthington-biochem.com/index/manual.htm/)

資料庫

l、德國BRENDA:Enzyme Database(http://www.brenda wnzymes.org)
2、Swissprot:EXPASYENZYME Enzyme nomenclature database (http://www.expasy.org/enzyme/)
3、IntEnz:Integrated relational Enzyme database (http://www.ebi.ac.uk/mtenz)

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