進行RNAi實驗時,您是不是會碰到以下問題:
1、 目的細胞暫時不易得到,比如說原代培養的細胞,稀有難得的細胞株或者目的細胞暫時還沒有到位;
2、 目的細胞轉染效率低(轉染效率在60%以下一般都認為轉染效率偏低);
3、 目的細胞需要誘導才能表達靶基因;
4、 目前尚無靶基因的抗體。
當這些問題擺在我們面前,而實驗又必須繼續進行的時候……
可靠的解決方案——RNAi外源篩靶
技術路線:1、製備至少叄個靶點RNAi質粒;
2、構建靶基因重組真核表達質粒:靶基因與報告基因融合。因為siRNA是在核酸水平起效,所以,一般我們只克隆靶基因cds區片段。
3、將各RNAi質粒分別與靶基因真核表達質粒瞬時共轉染入工具細胞。
(1)通過螢光顯微鏡檢測實驗組相對於陰性對照組(陰性對照siRNA+靶基因真核表達質粒)報告基因的表達水平下降程度;
(2)用報告基因抗體進行WesternBlot檢測,來間接反映靶基因siRNA的抑制效率。
1. Takeshi Kawauchi, Kaori Chihama, Yo-ichi Nabeshima and Mikio Hoshino. Cdk5 phosphorylates and stabilizes p27kip1 contributing to actin organization and cortical neuronal migration. Nature Cell Biology, volume 8, number 1, January 2006:17-31.
2. Irena Crnkovic-Mertens, Julia Semzow, Felix Hoppe-Seyler, Karin Butz. Isoform-specific silencing of the Livin gene by RNA interference defines Livinβas key mediator of apoptosis inhibition in HeLa cells. J Mol Med (2006) 84: 232–240.