Primer Premier是一款由加拿大的Premier公司開發的專業用於PCR或測序引物以及雜交探針的設計,評估的軟體,其主要界面是分為序列編輯視窗(Genetank),引物設計視窗(Primer Design),酶切分析視窗(Restriction Sites)和紋基分析視窗(Motif)。
Primer Premier軟體的主要功能分四種,即引物設計、限制性內切酶位點分析、DNA 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三種為其主要功能。此外,該軟體還有一些特殊功能,其中最重要的是設計簡併引物,另外還有序列"朗讀"、DNA 與蛋白序列的互換、語音提示鍵盤輸入等等。
Primer Premier軟體還可以針對模板DNA 的來源以相應的遺傳密碼規則轉換DNA 和胺基酸序列。軟體共給出八種生物亞結構的不同遺傳密碼規則供用戶選擇,有纖毛蟲大核(Ciliate Macronuclear)、無脊椎動物線粒體(Invertebrate Mitochondrion)、支原體(Mycoplasma)、植物線粒體(Plant Mitochondrion)、原生動物線粒體(Protozoan Mitochondrion)、一般標準(Standard)、脊椎動物線粒體(Vertebrate Mito-chondrion)和酵母線粒體(Yeast Mitochondrion)。
Primer Premier軟體有優秀的引物自動搜尋功能,同時可進行部分指標的分析,而且容易使用,已被引物設計行業人士認為是一款相當不錯的軟體。