制定歷程
韓國特種部隊5029作戰計畫的基礎為“概念行動計畫5029”，制定於1999年8月韓國金大中政府時期。為了應對朝鮮可能出現的6種劇變，當時，韓、美軍事當局針對朝鮮劇變的對策就已經初現輪廓。計畫中，由美軍死盯朝鮮的核武器，韓軍處理其他問題。
2006年10月，美韓兩國防長就“概念行動計畫5029”指針達成協定後，兩國開始著手該計畫的具體化工作。
盧武鉉執政後，韓、美軍方當局曾推進將“5029概念計畫”提升為“5029作戰計畫”，但韓國青瓦台國家安保會議（NSC）將朝鮮發生劇變時美軍積極介入視為“侵害主權”，該計畫因此而被叫停。因此，盧武鉉執政時期韓、美雙方雖決定將“5029概念計畫”具體化，但並未提升為作戰計畫。
李明博上台後情況發生了變化。2008年8月金正日健康異常的傳聞成為了該計畫提升的重要契機。2009年，韓、美兩國就將“5029概念計畫”提升為作戰計畫達成共識，並經過一年多的努力最終完成了作戰計畫。
主要內容
最初的“5029概念計畫”內容大體由五個方面組成，其中包括大規模殺傷性武器被叛軍奪取；軍隊暴亂或金正日突然死亡引發的內戰；大批難民脫北；發生大規模自然災害；韓國人質危機等。如果金正日失去對政權的控制，朝鮮將存在大規模殺傷性武器被叛軍奪取和轉運至他國的可能性。而根據這份5029計畫，屆時美軍海軍和韓國特種部隊將採取應對措施。
“5029作戰計畫”以“5029概念計畫”為基礎增加了一種構想。其核心內容是，朝鮮國防委員長金正日死亡後朝鮮內部的不穩定情況以及朝鮮大規模殺傷性武器（WMD）被叛軍奪走並流向國外的問題。美軍尤為擔心朝鮮核武器和技術等被叛軍奪取，落入國外恐怖組織的手中，並一直希望掌握處理該問題的作戰主導權。
計畫分工
韓美軍事演習美國在韓國共有28500名駐軍，朝鮮三軍共有120萬現役兵力。5029作戰計畫中作戰將由韓國軍隊主導，但美軍主要負責處理大規模殺傷武器和核武器。駐韓美軍司令夏普2009年10月30日參加韓美安保研究會主辦的國際會議時發表演講時表示：“2012年4月，雖然戰時作戰指揮權移交給韓國軍隊後，(發生全面戰爭時）銷毀朝鮮大規模殺傷性武器的作戰以及海軍陸戰隊的突襲登入作戰仍將由美軍主導，雙方已就此達成協定。” “5029作戰計畫”中其餘五種構想的作戰將由韓國軍隊主導。
朝鮮反應
朝鮮一直對韓美討論“5029作戰計畫”提出強烈抗議。
