簡介
真菌門 真菌門（Eumycota；Mycobionta）真菌界的一門。通常所稱的真菌即指該門菌。營養體大多為分枝繁茂的發達菌絲體，少數菌絲體不發達，一些低等種類為單細胞。細胞壁的主要組分為甲殼質或纖維素。無性繁殖產生遊動孢子、孢囊孢子和各種分生孢子等。有性生殖是通過性細胞的結合形成各類有性孢子，如卵孢子、接合孢子、子囊孢子和擔孢子等。真菌約10萬種以上，廣布於全世界，與人類關係密切。根據有無能動細胞（遊動孢子或配子）、有無有性孢子以及有性孢子的類型，本門分鞭毛菌亞門、接合菌亞門、子囊菌亞門、擔子菌亞門和半知菌亞門。
形態特徵
真菌門 真菌有真正細胞核、沒有葉綠素，它們一般都能進行有性和無性繁殖，能產生孢子，它們的營養體通常是絲狀的且有分枝的結構，具有幾丁質(chitin)或纖維素的細胞壁(有人已將具纖維素細胞壁的類群獨立成卵菌門)，並且常常是進行吸收營養的生物。真菌不含光合作用的色素，不能進行光合作用製造養料，所以菌類的營養方式是異養(heterotrophy)的。異養方式多樣，凡從活的動物、植物吸收養分的稱為寄生(Parasitism)；從死的動、植物體或其他無生命的有機物中吸取養分的稱為腐生(saprophytism)；從活的有機體吸取養分，同時又提供該活體有利的生活條件，從而彼此間互相受益、互相依賴的稱為共生(symbiosis)。
真菌除少數種類是單細胞外，絕大多數是由纖細、管狀的菌絲(hypha)構成的。菌絲分枝或不分枝。組成一個菌體的全部菌絲稱為菌絲體(mycelium)。菌絲一般直徑在10um以下，最細的不到0．5um，最粗的可超過100um。大多數菌絲都有隔膜(septum)，把菌絲分隔成許多細胞，稱為有隔菌絲(septatehypha)，有的低等真菌的菌絲不具隔膜，稱為無隔菌絲(nonseptatehypha)。菌絲細胞內含有原生質、細胞核、液泡、核糖體、線粒體、內質網，貯藏的營養物質是肝糖、油脂和菌蛋白，而不含澱粉。
菌絲又是吸收養分的結構。腐生真菌可由菌絲直接從基質中吸收養分，或產生假根吸取養分。寄生菌在寄主細胞內寄生，直接和寄主的原生質接觸吸取養分。
真菌的菌絲在正常生活條件下，一般是很疏鬆的，但在環境條件不良或繁殖的時候，菌絲相互緊密交織在一起形成各種不同的菌絲組織體。常見者如引起木材腐爛的擔子菌的菌絲糾結成繩索狀，外形似根，叫做根狀菌素(rhizomorph)。有些真菌的菌絲密集成顏色深、質地堅硬的核狀體，叫做菌核(sclerotium)，小的形如鼠糞，大的比人頭還大，如茯苓。有些種的菌核有組織分化，外層為擬薄壁組織(pseudoparenchyma)，內部為疏絲組織(prosenchyma)。有的菌核無分化現象。菌核是渡過不良環境的休眠體。很多高等真菌在生殖時期形成有一定形狀和結構、能產生孢子的菌絲體，叫做子實體(sporophore)，如蘑菇的子實體傘狀，馬勃的子實體近球
形。容納子實體的菌絲褥座狀結構，叫做子座(stroma)。子座是真菌從營養階段到繁殖階段的一種過渡形式，也有擬薄壁組織和疏絲組織分化，如冬蟲夏草菌從蝙蝠蛾科昆蟲的幼蟲屍體上長出的棒狀物，麥角菌核上萌發生成的紅頭紫柄就是子座。子座形成以後，其上產生許多子囊殼即子實體，子囊殼中產生子囊和子囊孢子。
繁殖方式
真菌的繁殖方式有營養繁殖、無性生殖和有性生殖三種。
真菌門 1.營養繁殖 營養繁殖中常見的如菌絲斷裂，每一條斷裂的菌小段都可發育成一個新的菌絲體。有些單細胞真菌，如裂殖酵母以細胞分裂方式進行繁殖。有的從母細胞上以出芽方式形成芽孢子進行繁殖，如釀酒酵母。有些真菌在不良環境中，其菌絲中間個別細胞膨大，細胞質變濃形成一種休眠細胞，即厚壁孢子。
2.無性生殖 無性生殖產生各種類型的孢子，如孢囊孢子、分生孢子等。孢囊孢子是在孢子囊內形成的不動孢子。分生孢子是由分生孢子梗的頂端或側面產生的一種不動孢子。這些無性孢子在適宜的條件下萌發形成芽管(germtube)，芽管又繼續生長而形成新的菌絲體。
3.有性生殖 有性生殖是很複雜的，方式是多樣的，有同配生殖、異配生殖、接合生殖、卵式生殖；通過有性生殖也產生各種類型的孢子，如子囊孢子、擔孢子等。真菌在產生各種有性孢子之前，一般經過三個不同階段。第一是質配階段，由兩個帶核的原生質相互結合為同一個細胞。第二是核配階段，由質配帶入同一細胞內的兩個細胞核的融合。在低等真菌中，質配後立即進行核配。但在高等真菌中，雙核細胞要持續到相當長的時間才發生細胞核的融合。第三是減數分裂，重新使染色體數目減為單倍體，形成四個單倍體的核，產生四個有性孢子。
真菌是一群數目龐大的生物類群，約有十萬餘種。分布非常廣泛，從熱帶到寒帶，從大氣到水流，從沙漠、淤泥到冰川地帶的土壤，從動植物活體到它們的屍體均有真菌的蹤跡。
下屬分類
真菌門 我們通常所說的菌類，包括細菌、粘菌、卵菌和真菌等類群。因此，“菌類”一詞不是嚴格意義上的分類學辭彙。細菌屬有原核生物界。粘菌、卵菌和真菌具有真核，它們在林奈兩界系統中屬有植物界真菌門，在Wittaker（1969）五界系統中屬於真菌界（Kingdom Fungi）。按現在分類學觀點，原來放在真菌界中的卵菌和粘菌等已從真菌中分出。在生物八界系統（Cavalier-Smith, 1988－1989）中，卵菌和粘菌分別被歸入假菌界（藻界）（Kingdom Chromista）和原生動物界（Kingdom Protozoa）。真菌界只包括壺菌門（Chytridiomycota）、接合菌門（Zygomycota）、子囊菌門（Ascomycota）和擔子菌門（Basidiomycota）。
菌類種類繁多，數量龐大，分布十分廣泛。子實體大小相差懸殊，它們大部分種類只有藉助顯微鏡才能分辨清楚。由於課堂上對於菌類的分類知識講授甚少，在實習中僅要求初步掌握大型真菌（屬有真菌界）的生物學性狀和分類特徵，並能識別大型真菌的主要類群和部分常見屬種。
大型真菌的主要類群
大型真菌是指子實體大型的子囊菌和擔子菌，泛指廣義上的Mushroom或Macrofungi，即譯為蘑菇或蕈菌。我國目前已知大型真菌3800種以上。其中傘菌類1600種，多孔菌類1300種，腹菌類300種，木耳和銀耳膠質菌類100餘種，子囊菌類400多種。根據實習的具體情況，下面僅對常見大型真菌的科屬特徵作簡要介紹。
子囊菌門
1.子囊菌門（Ascomycota）
1.1麥角菌目（Clavicipitales）
真菌門 麥角菌科（Clavicipitaceae） 子囊殼埋生在子座或菌絲層中；肉質子座或棉絮狀的菌絲層淺色或深色，常為橘黃色；子囊圓筒狀，細長，頂端加厚呈拱頂蓋狀，並具有狹長、線狀孔口；子囊孢子無色，線形，初期無橫隔，後漸形成多數橫隔，最後由各橫隔處斷裂成單細胞小段。如麥角菌屬（Clavices）和蟲草屬（Cordyceps）。
1.2肉座菌目（Hypocreales）
肉座菌科（Hypocreaceae） 子囊殼部分或全部埋生在顯著的子座中；子囊孢子8個，但往往每個孢子分裂成2個近圓形的細胞，由此變為16個孢子。如肉棒菌（Podostroma alutaceum）。
1.3炭角菌目（Xylariales）
炭角菌科（Xylariaceae） 子囊殼黑色，埋生於子座內；子囊圓柱形，有柄；子囊孢子8個，單胞，暗色；具側絲和緣絲。如炭角菌屬（Xylaria）、輪層炭殼屬（Daldinia）。
1.4 柔膜菌目（Helotiales）
（1）地舌菌科（Geoglossaceae） 子囊果有柄，舌狀、棒狀、勺狀或頭狀，顏色不一；子實層覆蓋於子囊果的上表面；子囊無蓋；生於林中地上、腐枝葉上及其他潮濕的有機質基物上。如地勺菌（Spathularia flavida）。
（2）錘舌菌科（Leotiaceae） 子囊果杯狀或盤狀，顏色鮮艷至深暗，有時具柄；子囊孢子無色至暗色，卵圓形至長線形，單胞至多胞。如地錘菌屬（Cudonia）、綠杯菌屬（Chlorociboria）。
1.5盤菌目（Pezizales）
（1）盤菌科（Pezizaceae） 子囊果盤狀或杯狀，常較大，無柄至有柄，鮮艷至暗色，肉質，薄而脆；子囊頂端遇碘變藍色。如盤菌屬（Peziza）、沙生地孔菌（Geopora arenicola）、紅毛盤菌（Scutellinia scutellata）。
（2）羊肚菌科（Morchellaceae） 子囊果大而具柄，多具有海綿狀（菌蓋表面有顯著的網狀棱紋）或鍾狀菌蓋，極少數杯狀或碗狀；子實層覆蓋於菌蓋的上表面；淺黃色到褐色。如羊肚菌屬（Morchella）、鍾菌屬（Verpa）。
（3）馬鞍菌科（Helvellaceae） 子囊果大而具柄，形態各異，盤狀、馬鞍狀到腦狀；子實層覆蓋於上表面。如馬鞍菌屬（Helvella）、鹿花菌屬（Gyromitra）。
擔子菌門
2 、擔子菌門（Basidiomycota）
2.1傘菌目（Agaricales）
蠟傘 （1）蠟傘科（Hygrophoraceae） 擔子果肉質，易爛；菌柄中生，菌蓋有蠟樣物質；菌褶直生到延生，厚，蠟質，稀疏，邊緣銳；擔子長度達擔孢子長度的5倍以上；孢子多光滑，橢圓形或長形。生地上。如蠟傘屬（Hygrophorus）和濕傘屬（Hygrocybe）。
（2）側耳科（Pleurotaceae） 擔子果肉質，易爛，或質韌，濕潤時常能恢復原狀；菌柄偏生、側生至近中生，或無柄，與菌蓋組織相連；菌褶延生或由基部輻射而出；孢子無色，罕為淡銹色。生木材上。如側耳屬（Pleurotus）、香菇屬（Lentinus）、扇菇屬（Panellus）。
（3）裂褶菌科（Scizophyllaceae） 菌蓋韌，革質，乾後潮濕時能恢復原狀；菌柄側生或無；菌褶從基部輻射而出，沿邊緣縱向分裂並反卷；孢子無色，圓柱形，光滑；孢子堆白色。生木材上。如裂褶菌（Schizophyllum commune）。
（4）鵝膏科（Amanitaceae） 菌柄中生，與菌蓋易分離；有菌托和菌環，或只有菌托；菌褶離生；孢子光滑，無色，成堆時白色至淡色。生地上。如鵝膏屬（Amanita）。
（5）光柄菇科（Pluteaceae） 菌柄中生，與菌蓋易分離；有菌托或無；菌褶離生或部分離生；孢子光滑，成堆時粉紅色至葡萄酒紅色或紅肉桂色。生地上、腐木或爛草上。如光柄菇屬（Pluteus）和小包腳菇屬（Volvariella）。
（6）白蘑科（Tricholomataceae） 菌蓋肉質或近膜質；菌柄中生至側生，或無柄，與菌蓋組織連生；菌褶彎生、直生或延生；孢子無色或近無色，成堆時白色、淺黃色或葡萄酒紅色，具紋飾或光滑，無芽孔。這個科是一個非常大的科，常見屬也很多，如口蘑屬（Tricholoma）、蜜環菌屬（Armillariella）、杯傘屬（Clitocybe）、金錢菌屬（Collybia）、香蘑屬（Lepista）、小菇屬（Mycena）、蠟蘑屬（Laccaria）、離褶傘屬（Lyophyllum）、小皮傘屬（Marasmius）等。
（7）蘑菇科（Agaricaceae） 菌柄中生，與菌蓋組織易分離，有典型的菌環；菌蓋肉質，蓋面通常粉狀至鱗片狀；菌褶離生至部分離生或直生；孢子無色、黃色或紫褐色，多數光滑，少數具疣、點或刺，芽孔有或無；孢子堆顏色多樣，純白色、乳白色、淡黃色、粉紅色、紫色至黑色等，往往脫水後變色。生地上。如蘑菇屬（Agaricus）、環柄菇屬（Lepiota）、白環菇屬（Leucoagaricus）。
鬼傘 （8）鬼傘科（Coprinaceae） 菌柄中生；菌蓋肉質至膜質，往往甚脆，蓋面表皮層由棒狀細胞或胞囊狀細胞組成；孢子暗色，球形、橢圓形或檸檬形等，光滑或有疣、刺、網紋，芽孔明顯；孢子堆黑色、暗褐色或暗紫色，罕有葡萄酒紫色或磚紅色。生地上、糞上或植物殘體上。如鬼傘屬（Coprinus）、小脆柄菇屬（Psathyrella）、花褶傘屬（Panaeolus）。
（9）糞銹傘科（Bolbitiaceae） 菌柄中生，與菌蓋組織相連或稍分離；菌蓋半膜質至肉質，表皮層為柵狀角質層或由長的平伏菌絲組成；菌褶離生至近離生；孢子光滑，罕有粗面或疣狀，芽孔清楚或不明顯；孢子堆銹褐色至污褐色。生地上、腐木上或糞上。如田頭菇屬（Agrocybe）和糞銹傘屬（Bolbitius）。
（10）球蓋菇科（Strophariaceae） 菌柄與菌蓋組織相連，有或無菌幕；菌蓋上皮層由平伏菌絲組成，常膠化；菌褶直生、彎生或稍延生；孢子蜜黃色至栗褐色，在KOH液中變為暗黃褐色，一頭截形，有芽孔；孢子堆丁香紫色、丁香紫黑色、深肉桂色、深銹褐色或暗銹褐色。生地上、腐木或糞等基物上。如球蓋菇屬（Stropharia）、鱗傘屬（Pholiota）、庫恩菇屬（Kuehneromyces）。
（11）絲膜菌科（Cortinariaceae） 菌柄中生，與菌蓋組織相連，菌環有或無；菌蓋表皮層為平伏的菌絲或疏鬆的表生菌絲，或細胞稍膨大，並且脫離；子實層體與菌肉不易分離；孢子常有皺紋至被疣，無芽孔；孢子堆銹褐色至粘土色。生地上或腐木上。如絲膜菌屬（Cortinarius）、羅鱗傘屬（Rozites）、絲蓋傘屬（Inocybe）。
（12）靴耳科（Crepidotaceae） 菌柄有或無，或只有假柄；菌褶三叉分歧，有褶緣囊體，無褶側囊體；孢子光滑或有內埋的刺；孢子堆淺褐色至淺褐黃色。生腐木、植物殘體或地上。如靴耳屬（Crepidotus）。
（13）粉褶菌科（Rhodophyllaceae） 菌柄與菌蓋組織相連，菌蓋表皮層由緊密的平伏菌絲或具囊狀向上的端細胞組成；子實層體褶狀，邊緣薄而銳，少數種有脈紋；孢子角形，有縱條紋或粗糙，無芽孔，成堆時粉紅色，葡萄酒紅色或帶紅的肉桂色。生地上或其他基物上。如粉褶菌屬（Rhodophyllus）。
真菌門 （14）網褶菌科（Paxillaceae） 菌柄中生、偏生、側生或無，與菌蓋組織相連；菌蓋肉質，有細軟毛，往往粘，蓋緣初時內卷；菌褶延生，分叉，在菌柄上交織成網狀；褶間有橫脈。孢子光滑、有刺或疣；孢子堆白色或褐色至淡銹色。生地上或腐木上。如網褶菌屬（Paxillus）。
（15）鉚釘菇科（Gomphidiaceae） 菌柄中生，與菌蓋組織相連；擔子果肉質，幼時有一層膠粘的菌幕，後漸消失，在蓋緣殘留有膜片或絲膜，並在菌柄上殘留有易消失的菌環；菌褶厚，稀，延生，蠟質；孢子暗綠色，大型，近梭狀；孢子堆綠褐色至黑褐色。與針葉樹形成外生菌根。如血紅鉚釘菇（Chroogomphis rutilus）。
（16）牛肝菌科（Boletaceae） 擔子果肉質，易爛，菌蓋厚，菌柄中生；菌肉傷後常變為藍色；子實層體大多數為管狀，少數半褶狀或褶狀。生林地上，與林木形成外生菌根。如牛肝菌屬（Boletus）、疣柄牛肝菌屬（Leccinum）、粘蓋肝菌屬（Suillus）。
（17）紅菇科（Russulaceae） 擔子果肉質，脆，易爛；柄中生；菌蓋和菌柄異質，菌肉和菌髓有泡狀細胞；孢子寬橢圓形至球形，有澱粉質紋飾，成堆時白色或黃色。生地上。本科僅有紅菇屬（Russula）和乳菇屬（Lactarius）。
非褶菌目
2.2 非褶菌目（Aphyllophorales）
（1）雞油菌科（Cantharellaceae） 擔子果肉質或膜質，有柄，漏斗形至喇叭形，或為截頂棒形；子實層體生於擔子果外側，平滑或皺褶；生殖菌絲薄壁，膨大；擔孢子光滑無色或淺色，非澱粉質。生於林中地上。如雞油菌屬（Cantharellus）。
（2）珊瑚菌科（Clavariceae） 擔子果珊瑚狀，直立，不分枝或分枝；菌絲單系或二系；子實層體生於擔子果周圍，光滑或具皺紋，擔子紡錘體狀；孢子無色，光滑，非澱粉質，孢子堆白色或淡黃色。生地上或木材上。如須瑚菌屬（Pterula）、枝瑚菌屬（Ramaria）、杯瑚菌（Clavicorona pyxidata）。
（3）韌革菌科（Stereaceae） 擔子果平展或反卷，扇形、貝殼形、半圓形，很少完全平伏，通常具有子實層、中間層褐較緊密的邊緣帶；子實層體光滑至細皺紋或小瘤，生於擔子果下側；二系菌絲具骨架菌絲，罕三系菌絲；無剛毛，有或無鎖狀聯合；常有囊狀體或膠囊體；孢子無色，光滑，澱粉質或非澱粉質。如韌革菌屬（Stereum）（圖）。
（4）銹革孔菌科（Hymenochaetaceae） 擔子果一年生或多年生，有柄或無柄，有菌蓋或無菌蓋，革質、木栓質或木質，較堅硬，通常為不同程度的褐色；菌肉均質或雙層，黃褐色至深褐色；單系或二系菌絲，無鎖狀聯合，菌絲組織遇KOH液變黑；子實層體光滑、疣狀、齒狀、管狀或褶狀；多數種有剛毛；孢子薄壁或厚壁，無色至淺黃褐色，有的在棉藍試劑中強嗜藍反應，光滑，罕具紋飾，形狀多樣。生木材上或林中地上，引起木材白色腐朽。如針層孔菌（Phellinus）、嗜藍孢孔菌（Fomitiporia）。
（5）革菌科（Thelephoraceae） 擔子果平伏，其子實層體光滑、被疣或齒狀，若擔子果有柄其子實層體為齒狀，菌肉淡色或暗色，遇KOH液變成暗色或帶綠色；有或無鎖狀聯合；孢子球形至橢圓形，具紋飾，有小瘤或小刺，淡褐色至有色，非澱粉質。生地上或木材上。如蓮座革菌（Thelephora vialis）。
真菌門 （6）多孔菌科（Polyporaceae） 擔子果一年生或多年生，平伏或平展至反卷，肉質、革質、木栓質到木質；菌蓋略圓形、半圓形、扇形、匙型、馬蹄形以及其他形狀，顏色多樣，白色、淡褐色、褐色、單紫色、褐色或紅色；菌肉均質或二層；單系、二系或三系菌絲，有或無鎖狀聯合；子實層體管狀，迷宮狀、齒狀或褶狀；子實層中無剛毛；孢子無色，臘腸形、圓柱形、橢圓形或近球形，光滑或具紋飾。生木材上，稀生於活樹上或地上。如大孔菌屬（Favolus）、層孔菌屬（Fomes）、多孔菌屬（Polyporus）、栓菌屬（Trametes）。
（7）靈芝科（Ganodermataceae） 擔子果一年生或多年生，有菌蓋，表面常有皮殼，半圓形或有柄；菌絲二系或三系，有鎖狀聯合；子實層體管狀；孢子橢圓形至球形，常頂部平截，雙壁，內孢壁褐色，有小刺或其他類型的突起，伸入外孢壁。生於木材上。如樹舌靈芝（Ganoderma applanatum）。
真菌門
木耳目 花耳目 鬼筆目
2.3 木耳目（Auriculariales）
木耳科（Auriculariaceae） 擔子果平伏反卷，膠質；擔子呈柵狀排列或散生在菌絲層上，有時有原擔子，橫向分隔為4個細胞，各生一個長形小梗；孢子生於小梗的頂端，無隔。如木耳屬（Auricularia）。
2.4花耳目（Dacrymycetales）
花耳科（Dacrymycetaceae） 擔子果無柄或有柄，墊狀、瓣狀或匙狀；擔子頂端分叉，每枝上生一個短小的梗；孢子生於小梗的頂端，長方形至橢圓形，初時為單細胞，後漸產生隔膜變為2個或更多個細胞。如花耳屬（Guepinia）。
2.5鬼筆目（Phallales）
（1）鬼筆科（Phallaceae） 孢托在菌托內完全離生，具菌柄，有或沒有一個離生下垂的覆鍾狀菌蓋，菌裙有或無；孢體只生於菌蓋的外面或孢托上部的外表面，橄欖綠色，成熟時粘液狀，有臭味；孢子無色至淡黃色或橄欖綠色，圓柱狀至狹橢圓形，光滑。生地上、腐木上或植物殘體上。如鬼筆屬（Phallus）、蛇頭菌屬（Mutinus）。
（2）籠頭菌科（Clathraceae） 孢托無柄或有柄，由球形網狀或幾個頂部聯合的柱或伸開的臂所組成，基部有菌托；孢體通常產生於孢托的內側，淡橄欖褐色，有臭味；孢子無色、淡橄欖色或淡黃褐色，圓柱狀至狹橢圓形，光滑。生地上或植物殘體上。如柄籠頭菌屬（Simblum）。
軸灰包目 柄灰包目
2.6 軸灰包目Podaxales
真菌門 灰菇包科（Secotiaceae） 擔子果具柄，菌柄延伸穿過孢體成一及頂的中柱，頂端擴展並與包被成為一體；孢體堅實，由永久的菌髓片組成，菌髓片常交織成小腔或迷路狀空隙或腔穴，或稀疏交織、近菌褶狀、或多或少呈輻射狀排列，或分離、齒狀，並垂直懸掛於包被下方，表面布以子實層；囊狀體偶爾存在，無孢絲；孢子球形、近球形、寬卵圓形至倒卵圓形，無色，光滑或具紋飾。生地上。如粉菇包（Endoptychum agaricoides）、沙生蒙塔假菇（Montagnea arenaria）。
2.7 柄灰包目（Tulostomafales）
（1）柄灰包科（Tulostomataceae） 擔子果具柄；包被2層，外包被部分脫落，內包被薄，不規則開裂或通過頂孔開裂；孢體成熟時粉末狀，由孢絲和擔孢子組成；孢子光滑或具紋飾。生地上或沙地上。如柄灰包屬（Tulostoma）（圖）。
（2）釘灰包科（Battarreaceae） 擔子果具柄，柄堅硬，圓柱形，通常長，表面具鱗片，基部具菌托；包被覆鍾狀或扁球形，2層，外包被薄，由外菌幕殘片並混以沙粒所組成，內包被半球形，革質，蒼白至褐色，在與菌柄連線處環裂，待內包被和孢體散失後露出帽狀的頂端，或以在內包被上形成大量小孔而開裂，小孔常或多或少沿內包被的圓周排列；孢體成熟後粉末狀，具孢絲和彈絲；孢子球形至卵圓形，厚壁，表面密被疣突，具一短的小梗。生沙地上。如毛柄釘灰包（Battarrea stevenii）。
馬勃目 硬皮馬勃目 鳥巢菌目
2.8 馬勃目（Lycoperdales）
（1）地星科（Geastraceae） 擔子果外包被星狀開裂，3層，內包被呈球形或扁球形，頂生的孔口可釋放孢子，少數屬、種的內包被易破裂消失；成熟孢體呈粉末狀，擔孢子球形、近球形，具疣狀、刺狀或柱狀突起，孢絲不分枝。生地上，少數生腐木上。如地星屬（Geastrum）。
（2）馬勃科（Lycoperdaceae） 擔子果球形至陀螺形，無柄，無中軸，外包被一層，薄，有小刺或小疣，常全部脫落；成熟後孢體粉末狀，內包被頂端開一小口或上部裂成碎片而脫落；孢絲長，分枝或不分枝；孢子球形或橢圓形，具小刺，少數光滑。生地上。如禿馬勃屬（Calvatia）、馬勃屬（Lycoperdon）、脫頂馬勃（Disciseda cervina）、栓皮馬勃（Mycenastrum corium）。
2.9 硬皮馬勃目（Sclerodermatales）
硬皮馬勃科（Sclerodermataceae） 擔子果球形，包被不分成可分離的層，由於磨損而從頂端破裂，偶爾呈不規則星狀；孢體最後呈粉末狀，由孢子團塊並充滿以菌髓片所組成，菌髓片或破碎並變為粉末或形成包裹著孢子團塊小腔的永久性壁；無孢絲，叢捲毛永存；擔孢子通常球形，有色，有小刺或網紋。生地上，罕全部或部分地下生。如硬皮馬勃屬（Scleroderma）。
2.10 鳥巢菌目（Nidularles）
鳥巢菌科（Nidulariaceae） 子實體倒圓錐形、杯形、漏斗形、喇叭形、坩堝形，小；包被1至3層，外側被毛，內外側或平滑或具縱條紋；產孢結構（孢體—小包）可由菌攀索連於包被內側，也可與包被離生；子實層不規則地排列與小包內壁，易消解，擔孢子無色，光滑，形態大小各異，浸泡在膠質物之中。生腐木、地表或糞便、腐殖質上。如黑蛋巢菌屬（Cyathus）。
下屬特徵
根據國際真菌研究所編著的《真菌詞典》第7版(1983)記載，真菌有5950屬，64200種，
中國已知約有8000種。傳統的分類方法，分為四綱，即藻菌綱，子囊菌綱、擔子菌綱和半知菌綱。新的分類分成5個亞門，即鞭毛菌亞門、接合菌亞門、子囊菌亞門、擔子菌亞門和半知菌亞門。
亞門檢索表
1．有能動細胞(遊動孢子)；有性階段的孢子典型地為卵孢子——鞭毛菌亞門Mastigomycotina
1．無能動細胞
2．具有性階段
3．有性階段孢子為接合孢子——接合菌亞門Zygomycotina
3．無接合孢子
4．有性階段孢子為子囊孢子——子囊菌亞門Ascomycotina
4．有性階段孢子為擔孢子——擔子菌亞門Basidiomycotina
2．缺有性階段——半知菌亞門Deuteromyc0tina
子囊菌亞門Ascomycotina
子囊菌亞門是真菌中種類最多的一個亞門，全世界有2720屬，28650種，除少數低等子囊菌為單細胞外，絕大多數有發達的菌絲，菌絲具有橫隔，並且緊密結合成一定的形狀。 子囊菌的無性生殖特別發達，有裂殖、芽殖、或形成各種孢子，如分生孢子、節孢子、厚垣孢子(厚壁孢子)等。有性生殖產生子囊(ascus)，內生子囊孢子(ascospore)，這是子囊菌亞門的最主要特徵，除少數原始種類，子囊裸露不形成子實體外，如酵母菌。絕大多數子囊菌都產生子實體，子囊包於子實體內。子囊菌的子實體又稱子囊果(ascocarp)。子囊果的形態是子囊菌分類的重要依據，常見以下三種類型：
子囊盤(apothecium)子囊果盤狀、杯狀或碗狀，子囊盤中的許多子囊和隔絲(不育菌絲)垂直排列在一起，形成子實層(hymenium)。子實層完全暴露在外面，如盤菌類。
閉囊殼(cleistothecium)子囊果完全閉合成球形，無開口，待其破裂後子囊孢子才能散出。
子囊殼(peritheciMm)子囊果呈瓶狀或囊狀，先端開口，這一類子囊果多埋生於子座內，如麥角、冬蟲夏草菌。
擔子菌亞門Basidiomycotina
擔子菌亞門是一群多種多樣的真菌，全世界有1100屬，16000餘種。都是由多細胞的菌絲體組成的有機體，菌絲均具橫隔膜。在整個發育過程中，產生兩種形式不同的菌絲：一種是由擔孢子萌發形成具有單核的菌絲，這叫做初生菌絲。以後通過單核菌絲的接合，核並不及時結合而保持雙核的狀態，這種菌絲叫次生菌絲。次生菌絲雙核時期相當長，這是擔子菌的特點之一。擔子菌最大特點是形成擔子(basidium)、擔孢子(basidiospore)。在形成擔子和擔孢子的過程中，菌絲頂端細胞壁上生出一個喙狀突起，突起向下彎曲，形成一種特殊的結構，叫鎖狀連合（下圖），在鎖狀連合的過程中，細胞內二核經過一系列的變化由分裂到融合，形成一個二倍體(2n)的核，此核經二次分裂，其中一次為減數分裂，於是產生4個單倍體(n)子核。這時頂端細胞膨大成為擔子，擔子上生出4個小梗，於是4個小核分別各移入小梗內，共發育成4個孢子——擔孢子。產生擔孢子的複雜結構的菌絲體叫做擔子果(basidiocarp)，就是擔子菌的子實體。其形態、大小，顏色各不相同，如傘狀、扇狀、球狀、頭狀、筆狀等。 在傳統的分類系統中，把擔子菌亞門當作擔子菌綱處理，其下分2個亞綱，即有隔擔子菌亞綱、和無隔擔子菌亞綱。現代分類學已將擔子菌亞門分為4個綱，即層菌綱(Hymeno—mycetes)，如銀耳、木耳、蘑菇、靈芝等；腹菌綱(Gasteromycetes)，如馬勃、鬼筆等；鏽菌綱(Urediniomycetes)和黑粉菌綱(Ustilaginomycetes)，如玉米黑粉(棒子包)。
層菌綱中最常見的一類是傘菌類，這一類擔子菌具有傘狀或帽狀的子實體，上面展開的部分叫菌蓋(pileus)。菌蓋下面自中央到邊緣有許多呈輻射狀排列的片狀物，稱為菌褶(gills)。用顯微鏡觀察菌褶時，可見棒狀細胞，叫擔子，頂端有四個小梗，每一個小梗上生一個擔孢子。夾在擔子之間有一些不產生擔孢子的菌絲叫側絲，擔子和側絲構成子實層(hymenium)。菌褶的中部是菌絲交織的菌髓，有些傘菌，在菌褶之間還有少數橫列的大型細胞叫隔胞(囊狀體)，隔胞將菌褶撐開，有利於擔孢子的散布。菌蓋的下面是細長的柄，稱菌柄(stipe)。有些傘菌的子實體幼小時，連在菌蓋邊緣和菌柄間有一層膜，叫內菌幕(partialveil)，在菌蓋張開時，內菌幕破裂，遺留在菌柄上的部分構成菌環(annulus)。有些子實體幼小時外面有一層膜包被，叫外菌幕(universalveil)，當菌柄伸長時，包被破裂，殘留在菌柄的基部的一部分而成菌托(volva)。這些結構的特徵是鑑別傘菌的重要依據。很多種傘菌可供食用，少數極毒。
半知菌亞門Deuteromycotina
半知菌亞門的菌類絕大多數都具有隔菌絲，只以分生孢子進行無性繁殖，其有性階段尚未發現，故稱為半知菌。一旦發現有性孢子後，多數屬於子囊菌。半知菌中凡已發現有性階段的種，可以使用兩個名秒，分別用於無性階段和有性階段。
代表植物
酵母菌
形態雖然簡單，但生理卻比較複雜，種類也比較多，套用也是多方面的。在工業上用於釀酒， 銀耳
酵母菌將葡萄糖、果糖、甘露糖等單糖吸入細胞內，在無氧的條件下，經過內酶的作用，把單糖分解為二氧化碳和酒精。此作用即發酵。在醫藥上，因酵母菌富含維生素B、蛋白質和多種酶，菌體可製成酵母片。治療消化不良，並可從酵母菌中提取生產核酸類衍生物、輔酶A、細胞色素C、谷胱甘肽和多種胺基酸的原料。
麥角菌Clavicepspurpurea(Fr．)Tul
屬於麥角菌科。寄生在禾本科麥類植物的子房內，菌核形成時露出子房外，呈紫黑色，質較堅硬，形狀象動物的角故叫麥角。麥角落地過冬，春季寄主開花時，茵核萌發生成紅頭紫柄的子座。每一個菌核可生出20—30個子座，子座頭部近圓形，從縱切面觀，可見沿外層有一層排列整齊的子囊殼，於囊殼瓶狀，孔口略露於外，其內長有許多長圓柱形的子囊，每個子囊含有8枚針形的子囊孢子。孢子散出後，藉助於氣流、雨水或昆蟲傳到麥穗上，萌發成芽管，浸入子房，長出菌絲，菌絲充滿子房而發生出極多分生孢子，同時分泌蜜汁，昆蟲采蜜時，遂將分生孢子帶至其他麥穗上。菌絲體繼續生長，最後不再產生分生孢子，形成緊密堅硬紫黑色的菌核即麥角。
冬蟲夏草菌Cordycepssinensis(Berk．)
是麥角菌科一種寄生於蝸蛹蛾科昆蟲幼蟲體上的子囊菌。這種菌的子囊孢子為多細胞的針狀物，由子囊散出後分裂成小段，每段萌發，產生芽管，侵入昆蟲的幼蟲體內，蔓延發展，破壞蟲體內部的結構，把蟲體變成充滿菌絲的僵蟲，冬季形成菌核，夏季自幼蟲體的頭部長出棍棒狀的子座，子座上端膨大，近表面生有許多子囊殼，殼內生有許多長形的子囊，每個子囊具2—8個子囊孢子，通常只有2個成熟，子囊孢子細長、有多數橫隔，它從子囊殼孔口散射出去，又繼續侵害幼蟲。
銀耳(白木耳)TremellafuciformisBerk
屬於銀耳科。是一種腐生菌。子實體純白色、膠質，半透明，由許多薄而皺褶的菌片組成， 呈菊花狀或雞冠狀。銀耳的擔子，每個縱裂為四個細胞，四個細胞的下半部在橫切面上連成“田”字形，上半部各個細胞形成細長的管，管頂伸出子實體表面，再生小梗，小梗上著生一個擔孢子。分布於福建、四川、貴州、江蘇、浙江等地。生於陰濕山區，櫟屬及其他闊葉樹木上。各地多栽培。銀耳是一種營養豐富的滋養補品，能滋陰、養胃、潤肺、生津、益氣和血、補腦強心。
木耳(黑木耳)Auriculariaauricula
屬於木耳科。子實體葉狀或耳狀，半透明，膠質，有彈性，深褐色至黑色。黑木耳的擔子，每個橫裂分隔成四個細胞，每個細胞生出細長的小梗，小梗上著生擔孢子。分布於全國各地。腐生於柞、械、榆、榕樹等砍伐段木和樹樁上，也有人工栽培。木耳含有麥角甾醇、腦磷脂、卵磷脂、甘露糖等，能補氣益血，潤肺止血。
麴黴菌
屬於叢梗孢科。菌絲有隔，為多細胞。無性生殖發達，由菌絲體上產生大量分生孢子梗，其頂端膨大成球狀，叫做孢囊(visicle)，在孢囊的整個表面生出很多放射狀排列的小梗(sterigma)小梗單層或雙層，小梗頂端長出一串串球形的分生孢子。分生孢子呈綠、黑、褐、黃、橙各種顏色。麴黴菌的種類很多，廣泛分布於空氣、土壤、糧食、中藥材上，是釀造工業的重要菌種，並可生產檸檬酸、葡萄糖酸及其他有機酸。黑麴黴A.nigervanTieghen)和雜色麴黴A.veriscolor(Vuill．)Tiraboschi能引起糧食和中藥材霉變，後者還產生雜色麴黴素(sterigatocystin)，可致肝臟損害。特別是黃麴黴A.flavusLink，常在花生和花生粕上發現，能產生毒性很強的黃麴黴素(afla—toxin)，能引起肝癌。
藥用真菌研究
真菌入藥在中國有悠久的歷史，從中國最早的藥物書《神農本草經》及以後的其他許多本草均有記載，如靈芝、獲菩、蟲草等等，至今仍廣泛的套用。
自然界的真菌種類繁多，中國約有4萬種以上，因此真菌所蘊藏的藥物資源是很豐富的。
隨著醫藥衛生事業不斷的發展。在尋找新藥的過程中，中國內外對真菌抗癌藥物進行了大量的篩選與研究，取得了一些進展。真菌的抗癌作用機理不同於細胞類毒素藥物的直接殺傷作用，而是通過機體免疫功能，增加巨噬細胞的蠶噬能力，產生對癌細胞的抵抗力，從而達到間接抑制腫癌的生長。
根據不完全的統計，已知藥用真菌有42科、306種，其中具有抗癌作用的達100種以上。如從雲芝菌絲體中提取到的蛋白多糖、豬苓中分離得到的豬苓多糖，又如香菇多糖、銀耳酸性異多糖、獲苓多糖和甲基襖苔多糖、裂褶菌多糖、雷丸多糖、蟬花多糖等等，均有抗癌作用。
真菌類多糖除了對抗癌的作用外，在臨床上對治療其他各種疾病也已經積累了很多寶貴的經驗，如竹黃多糖、香菇多糖治療肝炎有一定效果。靈芝多糖對心血管系統的作用能降低整體耗氧量，增強冠動脈血流量。銀耳多糖治療慢性肺原性心臟病和冠心病方面都有一定的作用。亮菌多糖可以加速造血系統DNA的合成。假蜜環菌甲素有治療急性膽道感染的作用。猴頭菌治療慢性胃炎、胃潰瘍和十二指腸潰瘍等症狀都有較好的療效。
國內外利用新的科學技術和方法，對真菌代謝產物的化學和生理活性的研究，亦取得了較好的成果，特別是抗生素的發現和套用，使真菌代謝產物的研究出現了一個飛躍。自1960年發現黃麴黴素(aflatoxin)具有很強的致癌毒性以來，另一類真菌代謝產物——黴菌毒素，已引起普遍的重視。迄今已有300多種具有毒性的代謝產物被分離出來。對其生理活性的研究不僅注意到毒性的強弱，而且還觀察到其他方面的作用。
真菌 隨著科學水平不斷提高，真菌的研究工作不斷深入，從真菌中尋找新的疑難病的藥物和保健藥物是很有希望的
藥用價值
蟲草主產中國西南、西北。分布在海拔3000米以上的高山草甸上。帶子座的菌核(僵蟲)即
藥材冬蟲夏草，含蟲草酸，能補肺益腎，止血化痰。
據統計蟲草屬(cordyceps)有130多種，中國有20多種，其中如蛹草菌C．militaris(L．)Link.、涼山蟲草(C．liangshanensisZang．HuetLiu)、亞香棒菌C．hawkesiiGray．等，它們的帶子座的菌核和冬蟲夏草有相似的療效，從蛹草菌的培養物中可得到蟲草素。蟬花菌C．soboliferaHillBerk．etBr．帶子座菌核能清熱祛風，鎮驚明日。
從新鮮的冬蟲夏草菌中分離得到蟲草菌——蝙蝠蛾擬青黴菌株，經純化，人工發酵培養，加工而成蝙蝠蛾擬青黴新藥，用治慢性氣管炎、慢性腎功能不全、預防心腦血管疾病。
