中華人民共和國成立後,黃國清為籌建武岡縣中醫協會到處奔波,積極作發動工作。
1951年被選為武岡縣中醫協會第一屆執行委員,繼任武岡縣衛生工作者協會秘書和副主任、武岡縣衛生學校教務主任、武岡縣醫學科研究所所長等職。
1956年主編《中醫學徒講義》,1959年主編《武岡縣中醫驗方秘方》第一、二輯,並參與編寫《邵陽專區中醫驗方秘方集》,所著單行本例的成功經驗,在省內外推廣。
1964年撰寫《對<素問・三部九候>之我見》一文,闡述祖授內經、傷寒、針炙等課程,治學嚴謹,講解透澈,為武岡培育了大批基層醫務人員。
1979年授予“名老中醫師”稱號,1985年病逝。