主要職責
（一）貫徹執行國家、省有關水利方面的法律、法規和方針、政策，組織擬訂全市水利政策、措施並監督實施。
（二）組織編制全市水利發展戰略、中長期規劃和年度計畫，編制流域（區域）水利綜合規劃、水資源、防洪、水土保持等專業規劃，並組織實施。組織對有關國民經濟和社會發展總體規劃、城市總體規劃及重大建設項目的水資源、水土保持和防洪論證的評價工作。
（三）負責防治水旱災害。組織、協調、監督、指揮全市防汛防旱工作，對重要河道湖泊和重要水利工程實施防汛防旱調度和應急水量調度，編制市防汛防旱應急預案並組織實施。負責鹽城市區防洪工作，指導全市城鎮防洪工作。指導水利突發事件的應急管理工作。
（四）統一管理和保護全市水資源（含礦泉水、地熱水）。組織編制全市水資源中長期供求規劃、水量分配方案並監督實施，組織實施取水許可制度和水資源有償使用制度，指導水利行業供水、排水、污水處理工作。負責全市計畫用水、節約用水工作，擬定節約用水政策，編制節約用水規劃，擬訂行業用水標準並監督實施，指導並推動全市節水型社會建設工作。
（五）編制全市水資源保護規劃，組織水功能區的劃分並監督實施，監測河流、湖泊和地下水的水量、水質，核定水域納污能力，提出限制排污總量意見。指導水生態保護與修復工作，提出飲用水源地設定意見。
（六）負責生活、生產經營和生態環境用水的統籌兼顧和保障，指導再生水等非傳統水資源開發利用工作。負責入河排污口設定審核（批）並參與水環境保護工作，發布水質監測通報、水資源公報。指導水務一體化工作。指導雨洪資源利用的工程建設與管理。
（七）組織、指導水政監察和水行政執法工作，查處重大涉水違法事件，協調、仲裁水事糾紛。負責河道采砂取土管理和監督工作。負責水行政徵收工作。
（八）指導全市水利基本建設工作。編制、審查市大中型水利建設項目建議書、可行性報告，組織實施重點水利建設項目，實施全市水利工程建設行業管理(含水利工程規劃設計、招投標、監理、質量監督、竣工驗收等)及相關資質管理。
（九）指導全市各類水利設施、水域及其岸線的管理與保護，指導流域和區域骨幹河道、湖泊及河口、海岸灘涂的治理與開發，負責市屬水利工程的運行與管理。承擔三峽工程移民管理工作。
（十）指導農村水利工作。組織編制農村水利發展規劃，組織協調農田水利基本建設，指導節水灌溉、鄉鎮供排水、河道疏浚整治、農村飲水安全等工程建設與管理工作，指導農村水利社會化服務體系建設，指導全市水土保持和水土流失綜合防治工作。
（十一）指導全市水利系統財務審計工作。負責有關水利資金的計畫、使用、管理及內部審計監督，參與水利投入機制和籌資政策的研究，指導水利行業國有資產的監督管理工作。
（十二）負責水利科技和外事工作。組織水利科學技術的研究和推廣，貫徹執行水利行業技術質量標準，擬訂水利工程規程、規範實施細則並監督實施，指導水利信息化和全市水利行業對外技術合作與交流工作。
（十三）承辦市政府交辦的其他事項。
內設機構
（一）辦公室（市三峽工程移民管理辦公室）
負責公文處理、綜合協調、政務信息、政務公開、新聞宣傳、建議提案、史志、信訪、督查督辦、文書檔案、機要保密、綜合治理和機關固定資產使用管理等行政管理工作；組織、承辦和協調綜合性會議和重要活動；負責局機關內部規章制度建設；負責局機關並指導全市水利信息化工作;指導全市三峽工程移民管理工作。
（二）政策法規處（行政許可服務處）
負責編制水利法制建設規劃；負責規範性檔案的起草、審核和監督實施；組織指導全市水行政許可和水行政執法、水行政徵收工作；承辦行政複議、行政應訴、行政賠償及普法宣傳教育工作；負責重大水事糾紛的調處；牽頭組織實施市級水行政許可工作。
（三）水資源處（市節水型社會建設辦公室）
組織編制全市水資源中長期供求規劃、水量分配方案、水資源保護規劃和節水規劃等；組織實施取水許可、水資源論證和水資源有償使用制度，承擔市級取水許可有關職能工作；指導水利行業供水、排水、污水處理和再生水等非傳統水資源的開發利用工作；負責計畫用水、節約用水工作，指導並推動全市節水型社會建設工作；按規定劃定水功能區並監督實施；組織監測河流、湖泊和地下水的水量、水質，核定水域納污能力，提出限制排污總量意見；指導水生態保護與修復工作，按規定提出飲用水源地設定建議；負責入河排污口設定的審核（批）工作，參與水環境保護工作；發布全市水資源公報和水質監測通報；指導水務一體化工作；指導雨洪資源利用的工程建設與管理。
（四）規劃計畫處
指導全市水利規劃工作；組織起草全市水利發展中長期規劃、年度計畫，流域(區域)水利規劃以及邊界水利規劃，並監督實施；負責全市水利投資計畫的綜合平衡和審查報批，擬訂市級水利固定資產投資計畫；負責全市大中型和直屬水利基建項目的建議書、可行性報告的立項申報及計畫下達；負責市屬水利重點工程的初步設計審批；負責水利綜合統計工作。
（五）基本建設處（安全生產監督管理處、市水利工程招標投標辦公室）
指導全市水利基本建設管理工作；負責省屬重點工程項目的初步設計、概算的核轉和審批；組織實施全市重點水利基本建設工程項目並監督管理；負責全市重點水利工程項目法人及招投標活動的監督管理工作；指導全市水利工程質量監督、安全生產監督管理和建設監理工作；承擔水利工程的報建登記、開工審（轉）批有關職能工作；組織審核、申報全市水利建設相關單位的資質及執業人員的資格，負責市水利工程建設項目的稽察工作，組織水利工程建設項目的市級驗收。
（六）財務審計處
指導全市水利系統財務審計工作；負責編制市級水利部門預算並監督執行；負責市級水利資金的使用、核算和監督管理；指導水利行業國有資產的監督管理工作；負責局機關和直屬單位財務管理、內部審計、領導幹部的任期經濟責任審計；負責市承辦的水利重點工程建設資金的管理和會計核算工作。
（七）工程管理處
指導全市各類水利工程設施、水域及其岸線的管理與保護；指導全市重點水利、城市防洪工程的安全運行和管理；承擔市管河道管理範圍內工程建設方案、位置、界限等審批事項的有關職能工作；指導全市河道、湖泊及河口、海岸灘涂的治理和開發。
（八）農村水利處（科技處、市水土保持辦公室）
組織指導全市農村水利工作；組織編制農村水利發展規劃和年度計畫；組織協調農田水利基本建設，指導全市節水灌溉、鄉鎮供排水、河道疏浚整治、農村飲水安全等工程建設與管理工作；組織指導全市水土保持工作，編制水土保持治理規劃，並監督實施；組織水土流失的監測和綜合治理；承擔全市重大建設項目水土保持方案審批的有關工作並監督實施，及水土保持設施的驗收工作；負責編制全市水利科技發展規劃；組織水利科技研究和推廣；負責全市水利行業對外技術合作與交流工作。
（九）組織人事處
負責局機關並指導直屬單位的機構編制、幹部人事、教育培訓、勞動工資、隊伍建設等工作；指導水利行業職工隊伍建設；組織指導水利行業專業技術職務評聘、工人技術等級考核和職工培訓工作；組織指導直屬單位黨群工作；負責離退休幹部工作。
機關黨委負責局機關的黨群工作。
另按有關規定設定紀檢（監察）機構。
人員編制
市水利局機關行政編制為37名，派駐紀檢（監察）機構行政編制為3名。後勤服務人員編制另行核定。
內設機構行政編制為：辦公室4名，政策法規處1名，水資源處4名，規劃計畫處4名，基本建設處4名，財務審計處4名，工程管理處1名，農村水利處4名，組織人事處4名；監察室2名。
領導職數為：局長1名，副局長4名；另核紀檢組長（副處職）1名，總工程師（副處職）1名，水利工委主任（副處職）1名；正副處長（主任）21名，其中正處長（主任）13名（含監察室主任、機關黨委專職副書記、團委書記、婦委會主任各1名），副處長（副主任）8名。
其他事項
（一）水資源保護與水污染防治的職責分工：市水利局對水資源保護負責，市環保局對水環境保護和水污染防治負責。兩部門要進一步加強協調與配合，建立協商機制，定期通報水資源保護與水污染防治有關情況，協商解決有關重大問題。市環保局發布水環境信息，對信息的準確性、及時性負責。市水利局發布水資源信息中涉及對水環境質量的內容，應與市環保局協商一致。
（二）河道采砂管理的職責分工：市水利局對河道采砂影響防洪安全、河勢穩定、堤防安全負責,市國土資源局對保障河道內砂石資源合理開發利用負責，市交通運輸局對河道采砂影響通航安全負責。由市水利局牽頭，會同市國土資源局、市交通運輸局等部門，負責河道采砂監督管理工作，統一編制河道采砂規劃和計畫。河道采砂的水上執法監管，要充分發揮交通運輸部門執法機構的作用。
（三）市水利局履行的組織、協調、監督、指揮全市防汛防旱工作職責，由市防汛防旱指揮部辦公室承擔。
（四）市水利局履行的水行政綜合執法職責，由市水政監察支隊承擔。
（五）市水利局履行的水利工程建設質量監督管理職責，由市水利工程質量監督站承擔。
