來歷形成
至元五年 (1268年)《國朝重修鵲山神應王廟》碑記：“漢唐以來，像而祀之舊矣，五季之未，數經殘記。周顯健中安國軍節度使陳思讓為重修之，是時碑刻已有王稱”。清康熙七年(1668年)《內丘縣誌》記：“鵲山廟在鵲山下，漢唐已有之，不詳始建，宋仁宗璽封神應王，元學士王鶚，明諭德謝遷有記，三月初旬，來祀者方千里，歷代詩文不可勝記”。據廟內現藏碑刻記載：在宋仁宗天聖九年 (1031年)修其房廊，“光華四出”；復經宋神宗熙寧二年 (1069年)修繕後，“重檐密廡，森然如翼，巍然可觀”；金明昌元年 (1190年)，內丘縣令趙實率眾監修後畫檐雕梁，所以稱之“其廟自古以來未有似今完備者哉”。逾數十載，又一場劫難火焚，蕩然無存。大蒙古國國朝龍興癸未歲(1223年)，節度副使蘇仲毅然昌率重葺舊基，
建築特點
扁鵲廟群總體呈長方形，占地面積約4萬餘平方米，由扁鵲殿、后土殷、玉皇殿、三霄殿、百子殿、藥王廟、山門、獻殿、回生橋、橋樓、碑樓、三清樓閣、道士院等20多座單體建築組成，總體布局合理，結構緊湊；是北方典型的道教廟群。屋頂類型有歇山頂、懸山頂、硬山頂、廡殿頂、卷棚頂等。
據明萬曆六年 《重修鵲山廟記》碑載：“……是故由周而來，歷二乾載矣，人之駿奔，而俎豆者……”。說明祭祀扁鵲的活動久遠。既然有祭祀活動，那么最起碼要有祭祀的場所，所以祭祀的場所也可能是一座不成型的小廟，也許原廟的建築開始較小，隨著時代的變遷和人們對其崇敬程度的升級，其廟逐漸變大。從中國古代建築發展史來看：西漢以前以高台建築為主，主要建築是宮殿、都城及禮制建築；東漢至南北朝時期，高台建築開始衰落直至消失，木結構建築興起，主要建築出現寺廟等建築。可見原來的小廟只不過是現存建築的雛形，扁鵲殿的成型建築年代在漢或早於漢。為何建築年代如此久遠，可現存的建築竟為元代建築風格呢？該殿千餘年來，風剝雨蝕，飽經滄桑，在歷史上曾毀於兵燹、或人為的破壞等，保存至今實為不易。從中可以看出，歷代人們對扁鵲其人、其廟的追崇、欽佩程度，也充分體現出該殿的名望和價值。最後一次大規模重修是在元朝初年，其殿現存的大木構件也多為元代。 在1997年落架大修清理該殿基礎時，竟發現原基址比現存的基礎要大一圈，四周各外沿1米左右。說明現存大殿是元初在火焚後的廢墟上重建的。可證實在元代前該殿四周確帶房廊，這樣正好和歷代碑文記載相吻合。
整個廟群是以扁鵲殿為起點，增設了具有道教色彩的廟宇，形成了一座雄偉、壯觀的道教廟群。可惜由於種種歷史原因，僅存無幾。
近年來，通過多種集資渠道，對現存的扁鵲殿、后土前殿、后土總司殿、藥王廟、廣生殿、山門、回生橋、玉皇殿等古建築進行了不同程度的修繕，保持原貌，修舊如舊。各種建築和諧相融，與歷代官吏，名人題寫的詩碣、碑文及九龍石柏、扁鵲墓地等人文景觀相映生輝，也折射出自建廟至歷代修廟的滄桑歷史。
全國各地扁鵲廟有之，唯屬內丘扁鵲廟創建年代最早，影響最大。改革開放以來，來此觀光旅遊，朝拜醫祖者絡繹不絕，尤其是每年農曆三月廟會期間，更是人山人海。近年美國友人、日本學者、新加坡道教協會、中華醫學會、北京、濟南、邯鄲、太原、安陽等地的人們都慕名前來，踏赴尋舊訪古之路，瞻仰扁鵲神容、玲聽美麗傳說、飽覽鵲山勝景、追尋神醫足跡、探索有關醫術，……，真可謂：“磊磊山形千古仰，巍巍廟貌四方欽”。
