遊戲系統
遊戲的系統相對前兩作有了很大的變化。操作方面：主角能夠同時擁有兩種武器，通過SFC手柄上的X可以切換，死亡時只丟失當前使用的武器；增加了 “定位射擊”的動作，按住R攻擊時可以站在原地固定不動任意向八個方向射擊；L、R同時按住時再按攻擊可以同時使用手上的兩種武器亂射。
武器方面：機關槍（M）和增加子彈速度（R）被取消，加入了爆發彈（C）和GB魂斗羅中出現的新武器：追蹤彈“H”。散彈（S）也出於武器平衡性的考慮降低了攻擊力。火焰（F）變為按住不放即可在一定範圍內持續噴射火焰的火焰噴射器。以前的瞬間無敵被改為街頭“超級魂斗羅”的俯視畫面中出現的可由玩家自由選擇時間發動的炸彈。每條命自帶一個，在遊戲中還可以得到更多，損失一條生命後炸彈數量也重新變成一個。主角在Stage 1還可以乘坐坦克。
遊戲加入了難度選擇系統，只有Normal和Hard難度下才可能與真正的最終Boss交手。
故事情節
公元2636年，不甘心數次失敗的異形終於發動了對地球的大規模侵略戰爭，在異形壓倒性的科技面前，人類一時束手無策，面對敵人的攻擊節節敗退，兩度打敗異形的魂斗羅小隊的傳奇戰士比爾和蘭斯再度臨危受命，前去直接破壞敵人的中樞系統，以協助人類展開反擊。
GB移植
遊戲在1994年以外包的形式被Factor 5移植到GB，由於GB機能所限，無論是畫面還是遊戲流程都有著不小的縮水。
遊戲流程
遊戲共有6個關卡（GB為5個），其中1、3、6為常規橫版捲軸；4為強制橫版捲軸（GB的作品總被取消）；2、5為俯視視角畫面（GB為2、4），值得一提的是這兩個關卡充分運用了SFC主機的迴轉放縮機能， 玩家可以用L和R改變主角所面對的方向。主角從被破壞的城市開始，一步步逼近異形的核心。在最後關卡，玩家可以看到很多前兩作出現的背景和敵人，但在畫面表現上都得到了強化。遊戲難度極高，沒有相當的動作射擊遊戲基礎很難順利通關。
秘籍
SFC
在標題畫面迅速輸入下、右下、右、Start，如聽到主角死亡時的效果音則成功，生命數增加至30
在標題畫面迅速輸入下、左下、左、Start，如果聽到異形的叫聲則成功，可以選關
在標題畫面輸入下、右、右下、X，進入音樂試聽模式
GB
B32R（生命無限）
H2F2（遊戲中任意跳關）
