生平
正德間，馬昊調到四川，擔任僉事。這時，省內有方四、曹甫等股農民起義軍十分活躍，總制四川、陝西、湖廣、河南四省軍務洪鐘和四川巡撫林俊剿辦不力，全省形勢日益嚴峻。馬昊雖是進士出身的文官，但自幼生長在寧夏邊衛地方，既知書又尚武，他“長身驍捷，善騎射，知兵”，於是也受命參加鎮壓農民軍的戰鬥。他分析到官兵打敗仗的主要原因是“將不知兵，其何以戰？”因此決定選擇健卒一千人，編為若干分隊，各隊設隊長，分領訓練，使之成為一支特別能戰鬥的攻堅力量。就在這時，農民軍曹甫一股圍攻江津縣，馬昊立即率領由他臨時訓練的這一支精兵隨同巡撫林俊馳援江城。這支隊伍一改以往官兵貪生怕死，人眾而無戰鬥力的狀況，一舉大敗農民軍，“俘斬及焚死者二千餘人”，使曹甫股眾從此一蹶不振。第二年，農民軍另一股方四部，又突然襲占江津，並乘勝攻破綦江，圍攻川東重鎮重慶，造成全川告急，朝野震驚。在緊要關頭，馬昊僅率百騎，連夜舉火奔襲敵營，農民軍以為天兵降臨，在這突如其來的打擊下，不戰自潰。天亮以後，農民軍設伏妄圖報復官兵，虛張左方，伏兵其右，誘昊入套。而馬昊則將計就計，表面上以“正兵當左，身率百騎搗其伏，伏潰，趨左，左亦潰”，又一次徹底打敗了方四股眾。方四隻身逃命，後被官方搜獲處死，四川全省告安靜。馬昊在鎮壓四川農民起義軍的戰鬥中立了大功，被朝廷獎賞並提升為副使。
正德七年（1512年）總制洪鐘、巡撫林俊先後調離四川，農民軍餘黨廖麻子又乘機收攏殘部再度起事，連陷銅梁（今四川銅梁西北）、榮昌（今四川榮昌），川省再度告急，新任巡撫高崇熙膽小怕事，主張招撫以粉飾太平，競答應了廖麻子的要求，讓出開縣縣城的臨江市碼頭一帶地方，時間為三年。為了讓農民軍放心，還派一副使張敏前往同駐彈壓，實際上是充當人質。馬昊堅決反對這一極端錯誤的做法，認為臨江市地據川省襟喉，西扼重慶、敘川（今四川宜賓東北長江北岸），東連兩湖，戰略地位十分重要，如果用以“資賊”，將後患無窮。但巡撫貪生怕死，只顧保全個人官位，並不考慮守土之責，對於馬的反對置之不理。馬昊無奈，只能在自己的職權範圍內，加緊練兵，嚴密布防，以備不測。第二年，得到喘息機會並恢復了原氣的農民軍，果然殺張敏再舉反旗，全川局勢告急。朝廷處分了高崇熙，同時升馬昊為右僉都御史，接任四川巡撫，並任命彭澤為總督軍務大臣，與昊一起承擔川省剿辦事宜。實際上馬昊已早有準備，立即率領他親手訓練的精兵五千人馬，先在中江（今四川中江）重創農民軍，解除了成都的危局。廖麻子本人僅率殘部敗逃劍州（今四川劍閣），被游擊閻勛追斬於陣。然而農民軍餘部又推舉喻思俸為新首領，表面上向總兵官陳珣投降，暗中卻偷度長江，乘北岸官軍不備，襲殺都指揮姚震，紛紛逃入川東深山密林之中，以川陝兩省交界的廣大山區為根據地，頻頻襲擾寧羌（今陝西寧強）、大安（今陝西寧強西北陽平關）、略陽（今陝西陽縣）、廣元（今四川廣元）等縣，總兵官陳珣疲於奔命，部眾因不滿而譁變，剿辦無功，被撤職治罪。明廷嚴令總督彭澤，巡撫馬昊親自指揮督戰。馬昊有膽有略，身先士卒，指揮有方，不久便摸清了農民軍的活動規律和作戰特點，很快就在西鄉大山中捕獲了喻思俸，並乘軍威一舉殲滅了活動於內江（今四川內江）一帶的另一部農民軍駱松祥股眾。至此，四川全省亂局平定，馬昊因功進副都御史。
正德十年（1515年），四川西邊番人磨讓六少等部亂松藩，馬昊團結未叛番眾，很快平息了動亂，還在三舍堡至風洞關五十里交通要道線上修築牆柵，保障往來商旅和饋運暢運，因而再次受到朝廷的賜敕褒獎。
十二年（1517年），烏蒙（今雲南昭通）、芒部二府接壤的筠連（今四川筠縣）、珙縣（今四川珙縣）等處的千里山區，蠻人首領僰圍人子、普法惡等部，在流民謝文禮、謝文義兄弟煸動下倡亂，官軍都指揮杜琮圍剿失利。馬昊親率指揮曹昱部進山圍剿。他相度山形、地勢，絕敵水源，一戰而收全功，論功再進右都御使，陰子錦衣世戶。
此後，馬昊便沾沾自喜，自恃“有才氣、能應變，揮霍自喜，所向輒有功”，而產生驕傲自大的官場習氣，一心追求名位利祿而“銳意立功名”。貪功的心理導致了他不注意團結和不尊重少數民族，終於造成“茂州群蠻懼見侵，遂糾生苗圍城堡”。在處理突發事件中，他又急於求勝而失去往日的理智，結果連連戰敗，損兵折將，參將芮錫出師不利，指揮龐升戰死，副總兵張傑、副使吳澧大敗於松潘，死亡官兵三千餘人。他怕影響自己仕途，既匿不上報實情，又不設定防務，反而不顧少數民族的反對，在當地冒然實行“改土歸流”，並誘殺土人首領，剝奪土民田產，終於又醞成了“自黎雅以西，天全六番皆相繼亂”的嚴重後果。在南京給事中孫懋、巡按御史盧雍、黎龍等先後參劾下，朝廷於十四年（1519年），將馬昊押送京師問罪，但行至河南境，他自稱有病，請求回家治養。武宗皇帝看在他過去功勞的份上，以寬大為懷，準其要求，遂中途返回故里。兩年後世宗皇帝繼位，追究馬昊前過，又被重新逮捕問罪，但仍寬大處理，只是“尋削籍歸”。回寧夏後，他曾為培養家鄉弟子，在衛學中授課講學，也為續修寧夏新志做了一些工作，默默終老於家中。
人物評價
史書曾有評論，認為馬昊是一個文職官員，“軍旅非其所長，適用取敗”，有失公允。
