阿色寺
後來，寺廟逐漸由本地喇嘛索南曲絨、巴允大喇嘛、喇嘛朗珠、特單曲培等諸多善知識接管。在200多年前巴允大喇嘛掌管時期，由於時事動盪，寺廟搬遷到了海拔4500米的聖地智嘎的山谷中---即現在寺廟的所在地。此時寺廟逐漸由薩迦派演變為舊密寧瑪派。在這一時期，召開了大成就者尼瑪扎巴的馬頭明王行法、觀音菩薩行法、八口授教法等許多伏藏法會。
1903年，第八世阿色活佛晉美多吉仁波切舉行了坐床儀式，傳承了大成就者佐欽巴的法脈，並重新修建了大雄寶殿、佛像等，迎請了佐欽寺大堪布土登寧扎光臨阿色寺，為許多新出家的僧伽們受了比丘戒和沙彌戒，還實行了三毗奈耶儀軌，制定了長年舉行夏令安居的計畫。
第八世阿色活佛對密咒有著極深的修持，他為阿色寺的堪布和活佛們傳授了大圓滿甚深密法的灌定、傳承、教言等，開創了每年定期舉行蓮師行法、金剛舞前行正行等的法事活動。在八世阿色活佛閉關期間由堪布更噶甲參、多吉才翁管理寺廟，還有喇嘛朗卡、堪布阿色曲扎等諸多高僧大德為寺院的發展和佛法的弘揚做出了不懈的努力，功德無量。
1956年，第八世阿色活佛圓寂。
1958年，巨大浩劫幾乎摧垮了整個佛教，阿色寺也沒有躲過這場災難。在第八世阿色活佛的不可思議的願力下和護法神智糌的保護下，大雄寶殿、珍貴的法器和第八世阿色活佛的肉身等破損不是很嚴重。後來，主要由第八世阿色活佛的心傳弟子喇嘛朗卡、堪布阿色曲扎的老一輩的喇嘛們發心修復了寺院的佛像、佛塔，重修了八世阿色活佛的閉關房，發展了僧團隊伍，復興了講修事業，並得到了佐欽白瑪格桑法王的支持和幫助，年輕的活佛堪布們有佐欽伍金仁增仁波切、嘉絨朗志仁波切、顯芬尼瑪仁波切、扎西頓珠仁波切、堪布丹曲彭措、喇嘛土曲等以無畏的發心，使阿色寺的弘法利生事業再度如日中天。
2004年，第九世阿色活佛白瑪晉美霞扎隆永多吉仁波切在佐欽五明佛學院修習了12年，擔任了4年的講經堪布職務後，因內外因緣皆得成熟時，登上了前世的法座，並舉行了隆重的坐床慶典儀式。
現在阿色寺有修持三學的僧伽100多位，在第九世阿色活佛的主持下，加之寺管委會副主任、法台大堪布、三大活佛等諸多善知識及漢地有緣居士的護持下，阿色寺的善業與佛教事業正在蒸蒸日上。
