著作有《小兒藥證直訣》,由其弟子整理而成。
其中著名處方六味地黃丸這一稱謂來自錢仲陽所著的《小兒藥證直訣》，他把八味地黃丸裡面的附子和桂枝這種溫補的藥物去掉了，變成了現在的六味地黃丸，並用它來治療小兒先天不足，發育遲緩等病症。
錢乙，字仲陽。上世錢塘人，與吳越王有屬。 納土，曾祖 隨以北，因家於鄆。父顥， 善針醫，然嗜酒喜游。一旦匿姓名，東遊海上，不復返。乙時三歲。母前亡，父同產姑，嫁醫呂氏，哀其孤，收養為子。稍長讀書，從呂君問醫。呂將歿，乃告以家世。乙號泣，請返跡父。凡五六返，乃得 所在。又積數歲，乃迎以歸。是時乙年三十餘。鄉人驚嘆，感慨為泣下，多賦詩詠其事。後七年，父以壽 終，喪葬如禮。其事呂君，猶事父。呂君歿，無嗣，為之收行葬服，嫁其孤女，歲時祭享，皆與親等。乙 始以《顱囟方》著山東。元豐中，長公主女有疾，召使視之，有功，奏授翰林醫學，賜緋。明年，皇卷。夫當諸臣搜采之日，天下藏書之家，莫不爭獻秘笈。卒未得是書真本，而今乃復見於世，豈非古人精氣有不可磨滅者歟？是書原刻閻名作“孝忠”，“真訣”作“直訣”，今未敢易也。“聚珍本”往往有閻氏方論誤入錢書者，今依朱本，則各得其所矣。其藥味分量間有不同，今各注於本方之末。至《薛氏醫案》本已為薛氏所亂，不足引證雲。
