歷史沿革
本作後有Remake重製版，1993年7月14日與2010年10月21日先後發售SFC版與WII版『スーパーマリオコレクション(Super Mario Collection)』，2003年7月11日發售GBA版『スーパーマリオアドバンス4(Super Mario Advance 4)』，以上作品收錄本作的重製版。
重製版以及美版在系統與其他方面，和日版有差異。
新內容
作為早期的超級馬里奧作品，超馬三代做出了不少創新。比如這次加入了庫巴七子作為BOSS 。而馬里奧的道具也變得多種多樣 ，浣熊裝，錘子裝，狸貓裝等新能力提升也豐富了遊戲性。奇諾比奧的蘑菇房也為後作如何獎勵玩家道具提供了模板。狸貓，浣熊的飛天設定也為玩家擴展了遊戲性，新超級馬里奧兄弟2也讓狸貓裝回歸，滿足了老玩家和懷舊情結。
遊戲分為8個世界
•世界1：草原之國（草原の國，Grass Land）：讓玩家熟悉操縱的基礎關卡，藏有兩枝“傳送之笛”。
•世界2：沙漠之國（砂漠の國，Desert Hill）：有討厭的太陽會攻擊玩家，藏有一枝“傳送之笛”。
•世界3：海洋之國（海の國，Ocean Side）：關卡幾乎都在水底，必須游泳來過關。
•世界4：巨大之國（巨大の國，Big Island）：酷栗寶、諾庫龜甚至“？磚塊”都變成巨大版的。
•世界5：天空之國（空の國，The Sky）：分為陸地和天空兩個部分的關卡。
•世界6：冰雪之國（氷の國，Iced Land）：地形以冰雪構成，玩家很容易因滑落而摔死。
•世界7：水管之國（土管の國，Pipe Maze）：地形幾乎是以大量水管構成，食人花非常多的關卡。
•世界8：黑暗之國（暗黒の國，Castle of Kuppa）：桃子公主所在區域。此關卡充滿了戰車和大炮。
•世界9：跳關地帶（ワープゾーン，Warp Zone）：使用“傳送之笛”後可以來此選關。
•遊戲有3個傳送之笛，分別在1-3，1-4與第二大關大地圖某處。
劇情設定
在Mario和Luigi努力下蘑菇王國變和平了，其實此蘑菇王國只不過是蘑菇世界的入口，裡面有很多國家。大魔王Koopa吃了虧受了懲罰，只好把自己的鹹龜手從Mario居住的蘑菇王國縮回去，這次有了自己的子女小Koopa7兄弟助陣，他們在蘑菇世界到處恣意妄為。
最終把各國自古以來代代相傳的魔法杖盜出，把國王陛下們全都變成了動物。Mario和Luigi只有從小Koopa那裡奪回魔法杖，才能把國王陛下們恢復原貌。“走好。路上小心♥”，Peach公主與Kinopio為2人送行，於是2人向不思議的蘑菇世界深處前進。
遊戲彩蛋
另外一個小彩蛋：傳送之笛的BGM與FC塞爾達傳說的笛聲相同，N64《塞爾達傳說 時之笛》的開場BGM的開頭和該曲相同，與DS《超級馬里奧64DS》的小遊戲”愛不愛我“中連續三次得到”愛我“後的”真的很愛我“的BGM相同。
雙人遊戲
兩位玩家雙人配合時，1P手柄固定為Mario，2P手柄固定為Luigi，交替進行遊戲。前作須等到某一方掛了，另一方才能進行遊戲。本作在前作基礎上，增加過關交替功能。某一方玩家闖過1個關卡，相應關卡面板變成過關面板，這時候另一方玩家就可從地圖上直接穿越這個關卡了，如此這般，兩位玩家一起合力攻打同一個世界地圖。
Game Over遊戲結束時Continue繼續，兩方獨立執行，例如1P正常遊戲，2P敗北續關，則2P在遊戲結束時闖過的關卡面板重啟還原，地圖上經過這些關卡時，需重新挑戰 ，2P去過的蘑菇房面板與黑桃面板也重新還原了， 1P的流程沒變化，突破的關卡仍顯示為過關面板，由於2P的地圖物品在遊戲結束時不丟失，續關時又可繼續使用，而且有1P在當前世界地圖上已開闢好的闖關路線。
本作除雙人交替進行遊戲，還能進行雙人同時參與的迷你遊戲，官方說明書稱之為對戰模式(Battle Mode)。內容類似任天堂1983年發售的FC馬里奧兄弟 ，規則有差異，1P與2P需競爭場景里的硬幣入手數量或敵人打倒數量。 敵人有刺殼龜『トゲゾー(Togezô)』、螃蟹同學『カニさん(Kanisan)』、蒼蠅鬥士『ファイターフライ(Fighter Fly)』，陸續從場景上方土管鑽出，場景地形由3層床構成，Mario兄弟在床下面跳躍叩擊，把敵人震翻，後跳到床上面把震翻敵人踢落，反覆使用這個方法消滅敵人。
世界地圖上，當Mario與Luigi重合時，1P與2P手柄哪一方按了A鍵，都會進入迷你遊戲，迷你遊戲有兩種，一種是迎戰敵人，共有5個敵人，打倒敵人數量多的一方勝利，另一種是爭搶硬幣，取得硬幣數量多的一方勝利。 另外，過程中任意一方被敵人丟翻，系統立即判定被敵人丟翻的一方失敗，本場迷你遊戲結束，回到地圖畫面。勝者獲得繼續操作遊戲的權利，敗者如果是按A鍵進入迷你遊戲的一方，則返回原本所在位置。
爭搶硬幣共有3種類型，隨機出現。
日版美版差異
| FC日版 | NES美版 |
| 地圖上選定關卡按A鍵確認時，經過螺旋狀緩和曲線過渡進入黑畫面，然後又經過螺旋狀緩和曲線過渡打開ACT遊戲畫面。 | 地圖上選定關卡按A鍵確認時，經過螺旋狀緩和曲線過渡進入黑畫面，然後由黑畫面直接進入ACT遊戲畫面。 |
| 第1世界城寨里天井反覆衝壓場景，BOSS房間入口位置從最右邊牆壁往左數第4塊建材位置，躲避天井釘板的“安全地帶”從最右邊牆壁往左數第3塊建材位置。 | 最右邊的牆壁向左延長了2塊建材，BOSS房間入口與“安全地帶”，兩者全都設定在處於緊貼牆壁的相鄰位置，難度降低了一些。 |
| 城堡畫面里，有3根柱子，影子在左側，Mario站在畫面左端位置，王座與王座下面台階的表層顏色為水色，王座下面的台階範圍較窄。背景是暗淡的水色。 | 2根柱子，影子在右側，Mario站在畫面中央，台階左側相鄰位置。王座與王座下面台階的表層顏色為橙色，台階範圍較寬。背景是明亮的水色。 |
| 超級、火花、尻尾、狸、蛙、榔頭等強化狀態，受到傷害立即返回小Mario狀態。 | 火花、尻尾、狸、蛙、榔頭等強化狀態，受到傷害僅僅返回超級Mario狀態，導致遊戲難度下降。 |
| 靴Mario狀態受到傷害立即返回小Mario狀態。而且，脫下的靴子變成了赤色。 | 靴Mario狀態受到傷害僅僅脫下靴子了事，保持穿靴前的強化狀態不變，脫下的靴子顏色不會變成赤色。 |
| 第3世界地圖上乘船時使用地圖物品笛子，結果笛子引來的龍捲風把主角與船一起送到了第9世界歪域(Warp Zone)。 | 第3世界地圖上乘船時使用地圖物品笛子，到達第9世界歪域(Warp Zone)時，船沒了， |
| 5-1終點賭博塊左側有牆壁擋路，主角可以通過管道穿越牆壁到達終點，也可以使用P羽翼從牆壁上方飛越，到達終點。 | 5-1終點賭博塊左側沒有牆壁擋路。 |
| 第8世界的戰艦，主角可以選擇走水路，潛水游到終點，終點處船的甲板較高，各種強化狀態的Mario雖然能從水面跳上甲板，但較為吃力，需要嘗試多次，小Mario比較順利。 | 最右端甲板被削掉一層，這樣就很容易從水面跳到甲板上了。 |
| 打倒大魔王Koopa後，Peach公主的台詞是『ありがとう！これでやっときのこのせかいにへいわがもどりました。おしまいっ！』（謝謝！如此這般，蘑菇世界終於回歸和平了。劇終！） | 打倒大魔王Koopa後，Peach公主的台詞是『Thank you. But our Princess is in another castle! ...Just kidding! Ha ha ha! Bye bye.』（謝謝你。但我們的公主在另一座城堡！……開個玩笑！哈哈哈！拜拜。） |
| 結局最後落幕時顯示出『THE END』，不存在2周目。。 | 結局後有2周目，開始的時候，擁有地圖物品P羽翼7枚。 |
