調控基因組

《調控基因組》是2006年12月由科學出版社出版的圖書,作者是戴維林。

基本信息

內容簡介

調控基因組調控基因組

《調控基因組:發育與演化中的基因調控網路(導讀版)》將基因組學、胚胎學和演化生物學的關鍵概念進行了很好的綜合,很好地揭示了動物發育調控中基因調控序列結構與功能的關係,以及由這些調控序列構成的基因調控網路所初步顯同了基本性質。《調控基因組:發育與演化中的基因調控網路(導讀版)》旨在通過一些無可辯駁的證據,說明發育的動因從根本上講存在於對基因空間表達的順式調控之中,而發育只是由很多調控基因組成的調控系統的輸出結果,這就為身體構造的演化機制提供了新的思路。

作者簡介

作者:(美)戴維林

目錄

前言

第一章 動物發育中的“調控基因組”

基本構架

DNA編碼的調控裝置

基因組、基因與基因組中的“間隔”

調控結構概述

基因調控網路

發育中的調控需求

發育特化中調控信息的解讀與產生

基因表達的空間特異性

從區域特化到終末分化

演化、發育與調控基因組

第二章 順式調控模組。調控邏輯的結構/功能基礎

通用性規則

基因組順式調控單位的基本特徵——模組化

順式調控模組內部的邏輯加工與輸入/輸出關係

順式調控邏輯處理器:實例

靶位點結合率與轉錄輸出

順式調控邏輯編碼的聯合性

順式調控設計

空間輸入信息在順式調控水平的整合

抑制性調控與順式調控設計的多樣性

順式調控設計與發育中空間表達複雜性的產生

由相隔較遠的順式調控元件之間序列特異性相互作用產生的調控

發育與BTA的特異性

序列特異性的,基因內和基因間的染色體環化的調控功能

第三章 發育是一個調控狀態特化的過程

原腸胚之前的發育過程

胚胎髮生的單向性

體軸極性的母源性各向異性與外源因子誘導

空間調控的複雜性與卵裂球間的信號傳遞

區域化

胚胎髮育與其背後的基因調控網路結構的比較研究

1型胚胎較簡單的基因調控網路

更複雜的胚胎髮育形式

成體結構建成中的調控狀態與網路線路

胚後發育過程的步驟

前體域的概念

前體域調控狀態的再分

軀體構型的發育與生物演化

第四章 發育中的基因調控網路:它們是什麼,如何工作以及它們意味著什麼

發育基因調控網路的一般性結構特徵

網路的基本結構

從不同層次看基因調控網路:從支路到流程圖

網路組件的質的多樣性

擴展

胚胎髮育中的基因調控網路

海膽的內中胚層調控網路

爪蟾胚胎中胚層特化中的基因調控網路

果蠅胚胎背腹軸區域特化中的基因調控網路

成體結構建成的網路調控

胰腺8細胞特化的調控網路

線蟲味覺神經元終末分化調控網路中由小RNA介導的細胞命運排除

結論

第五章 基因調控網路:動物演化的因果性與多樣性之根源

基因調控網路的結構與功能對於演化的啟示

基因調控網路的構件與演化變異的性質

基因調控網路的改變可以引起林奈分類系統中不同層次的演化後果

兩側對稱動物基因調控網路的核心單元,預測的與實際的情形

說明與一點提醒

兩側對稱動物神經系統的區域特化

兩側對稱動物的消化道

兩側對稱動物心臟前體域特化過程中可能存在一個共有的調控核心

核心單元的分布

兩側對稱動物軀體構型的種系內演化:hox基因作為可變的網路輸入/輸出開關

hox基因表達的多種功能性後果

幾個例子:區域性抑制與圖式化信息的輸出及軀體結構多樣性的演化

hox基因次級網路與空間演化

後生動物的起源與核心元出現之前的基因網路

按時間解析兩側對稱動物的基因調控網路

結論與回顧:動物發育與演化的原理

參考文獻

圖版出處

索引

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