內容簡介
《調控基因組:發育與演化中的基因調控網路(導讀版)》將基因組學、胚胎學和演化生物學的關鍵概念進行了很好的綜合,很好地揭示了動物發育調控中基因調控序列結構與功能的關係,以及由這些調控序列構成的基因調控網路所初步顯同了基本性質。《調控基因組:發育與演化中的基因調控網路(導讀版)》旨在通過一些無可辯駁的證據,說明發育的動因從根本上講存在於對基因空間表達的順式調控之中,而發育只是由很多調控基因組成的調控系統的輸出結果,這就為身體構造的演化機制提供了新的思路。
作者簡介
作者:(美)戴維林
目錄
前言
第一章 動物發育中的“調控基因組”
基本構架
DNA編碼的調控裝置
基因組、基因與基因組中的“間隔”
調控結構概述
基因調控網路
發育中的調控需求
發育特化中調控信息的解讀與產生
基因表達的空間特異性
從區域特化到終末分化
演化、發育與調控基因組
第二章 順式調控模組。調控邏輯的結構/功能基礎
通用性規則
基因組順式調控單位的基本特徵——模組化
順式調控模組內部的邏輯加工與輸入/輸出關係
順式調控邏輯處理器:實例
靶位點結合率與轉錄輸出
順式調控邏輯編碼的聯合性
順式調控設計
空間輸入信息在順式調控水平的整合
抑制性調控與順式調控設計的多樣性
順式調控設計與發育中空間表達複雜性的產生
由相隔較遠的順式調控元件之間序列特異性相互作用產生的調控
發育與BTA的特異性
序列特異性的,基因內和基因間的染色體環化的調控功能
第三章 發育是一個調控狀態特化的過程
原腸胚之前的發育過程
胚胎髮生的單向性
體軸極性的母源性各向異性與外源因子誘導
空間調控的複雜性與卵裂球間的信號傳遞
區域化
胚胎髮育與其背後的基因調控網路結構的比較研究
1型胚胎較簡單的基因調控網路
更複雜的胚胎髮育形式
成體結構建成中的調控狀態與網路線路
胚後發育過程的步驟
前體域的概念
前體域調控狀態的再分
軀體構型的發育與生物演化
第四章 發育中的基因調控網路:它們是什麼,如何工作以及它們意味著什麼
發育基因調控網路的一般性結構特徵
網路的基本結構
從不同層次看基因調控網路:從支路到流程圖
網路組件的質的多樣性
擴展
胚胎髮育中的基因調控網路
海膽的內中胚層調控網路
爪蟾胚胎中胚層特化中的基因調控網路
果蠅胚胎背腹軸區域特化中的基因調控網路
成體結構建成的網路調控
胰腺8細胞特化的調控網路
線蟲味覺神經元終末分化調控網路中由小RNA介導的細胞命運排除
結論
第五章 基因調控網路:動物演化的因果性與多樣性之根源
基因調控網路的結構與功能對於演化的啟示
基因調控網路的構件與演化變異的性質
基因調控網路的改變可以引起林奈分類系統中不同層次的演化後果
兩側對稱動物基因調控網路的核心單元,預測的與實際的情形
說明與一點提醒
兩側對稱動物神經系統的區域特化
兩側對稱動物的消化道
兩側對稱動物心臟前體域特化過程中可能存在一個共有的調控核心
核心單元的分布
兩側對稱動物軀體構型的種系內演化:hox基因作為可變的網路輸入/輸出開關
hox基因表達的多種功能性後果
幾個例子:區域性抑制與圖式化信息的輸出及軀體結構多樣性的演化
hox基因次級網路與空間演化
後生動物的起源與核心元出現之前的基因網路
按時間解析兩側對稱動物的基因調控網路
結論與回顧:動物發育與演化的原理
參考文獻
圖版出處
索引