西南師範大學研究生教育始於20世紀50年代。1981年學校被國務院批准為首批碩士、博士授予單位，並培養了中國第一位課程與教學論博士。西南師範大學組建以來，研究生教育在學科建設、導師隊伍和人才培養方面都得到了迅速、全面的發展，於2011年成立研究生院。
學校現有3個國家重點學科（基礎心理學、特種經濟動物飼養、課程與教學論）、2個國家重點（培育）學科（生態學、果樹學）、39個省部（市）級重點學科、19個博士後科研流動站、19個一級學科博士學位授權點，44個一級學科碩士學位授權點，1種專業博士學位，21種專業碩士學位。有1個國家重點實驗室、1個國家重點實驗室培育基地，1個國家工程技術研究中心、7個教育部或農業部重點實驗室、2個國家野外科學觀測試驗站、3個教育部工程研究中心、2個國家創新引智基地、3個教育部創新團隊、23個省（市）級重點實驗室、9個省（市）級工程技術研究中心、1個教育部人文社會科學重點研究基地、11個重慶市人文社會科學重點研究基地。學科涵蓋12個學科門類，55個一級學科。
學校現有研究生指導教師約1100餘人，其中博士生指導教師約300餘人，同時擁有一批著名學者：中國科學院院士1人、中國工程院院士2人、美國生物醫學與工程院院士1人、第六屆國務院學位委員會委員1人、國務院學位委員會第六屆學科評議組成員7人、國家級教學名師3人、“千人計畫”入選者8人、“長江學者”6人、“國家傑出青年基金”獲得者2人、“國家青年拔尖人才支持計畫”入選者1人、國家級教學團隊4個。
學校有各類在校研究生19000餘人，其中博士研究生1400餘人，學術型碩士研究生7900餘人，全日制專業碩士研究生2800餘人，在職攻讀專業學位碩士研究生1800餘人，免費師範畢業生在職攻讀碩士學位研究生4900餘人，留學生600餘人。
學校重視研究生教育國際交流與合作，與美、英、加、法、德、日、澳、俄等近20個國家或地區的高校、科研機構開展了研究生培養、學術交流和科研合作，與國外40多所大學及科研機構建立了長期友好的研究生教育合作關係。
