蛋白質微陣列

蛋白質微陣列

蛋白質微陣列是將不同的具有生物活性的蛋白質分別置於微量板的不同孔內來進行蛋白質功能篩選的文庫。它實質上是cDNA陣列文庫的繼續。蛋白質微陣列是一種專門設計的多肽支架構成了一個表面固定域和捕獲域,從而形成柔性的蛋白質陣列。

蛋白質微陣列一種專門設計的多肽支架構成了一個表面固定域和捕獲域,從而形成柔性的蛋白質陣列。
“微陣列”是當今生物學領域裡最時髦的名詞。像寡核苷酸和蛋白質這樣的小分子被固定在經微細加工的表面上,以進行高通量的篩選研究。將各種類型的分子固定在這種表面還存在許多困難,然而,隨著技術的進步,現在已經有了越來越多的解決辦法。
因為蛋白質對微擾動有天生的敏感性,所以將其固定在微陣列表面尤為困難。加州理工學院的David Tirrell教授說:“將蛋白質按微陣列方式置放是一個用普通方法無法解決的問題。”構建蛋白質微陣列的最初努力是為了研究賴氨酸或半胱氨酸殘基的固有活性,希望表面上的反應基以共價方式捕捉蛋白質,但這會讓活性位點變得難以獲得,或導致蛋白質變性。因此,許多研究人員借用傳統的親和層析法在表面放置蛋白質,比如將蛋白質與hexahistidine標籤融合在一起,再用固定金屬捕獲。然而,挑戰仍然存在,所用的標籤不僅需要在各種環境中保持相當的穩定,而且還要保持表面化學的高親和力。為了實現這個目標,Tirrell和同事提出用一種新型的柔性多肽支架構成表面的固定域和蛋白質捕捉域。
固定域是由高疏水彈性蛋白擬肽構成,它能緊緊附著在疏水的表面。而且,當與一個非自然的光反應苯基丙氨酸衍生物結合時,這種支架能與適當的衍生表面在紫外光照射下聯接。蛋白質捕獲域由一條單亮氨酸拉鏈捲曲螺鏇構成,當與目標蛋白質結合時,補充螺鏇就會被表達出來。由於粘聯非常緊密以及亮氨酸拉鏈捲曲螺鏇特別的非共價聯合,因此,即使是在細胞液中,目標蛋白質也能有效地被固定支架捕獲。
彈性蛋白擬肽通過一個光合反應胺基酸與表面共價結合。目標蛋白質與亮氨酸拉鏈螺鏇融合,螺鏇間強有力的非共價聯結導致二聚作用,從而有效地固定目標蛋白質。
這種經過專門設計的多肽支架可以更靈活地將蛋白質固定在微陣列上,供科學家們從事蛋白質功能研究。

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