圖書信息
作 者： 理察J.辛普森（Richard，J.Simpson），何大澄 著 何大澄 譯 （澳）辛普森 編
叢 書 名：生物實驗室系列
內容簡介
以蛋白質和蛋白質的分析策略為核心，本書的主要內容包括：蛋白質結構的背景知識 ；蛋白質樣品製備和分析的各種實驗方法，從傳統的化學分析，到經典的色譜、質譜技術，直至最新的蛋白質晶片和信息學方法；上述各種技術方法的原理、套用，以及相關的支持性信息和參考資料。
針對蛋白質不同的研究目的（如樣品製備、結構測序或功能研究），每一章儘可能完全地羅列了各種實驗方案，可供不同規模實驗室的研究者選擇套用。在介紹每一個實驗方案時，以“step—by—step”操作指南的形式逐步展開，詳細列出實驗儀器、試劑及操作步驟，並針對常見問題給出經驗性的提示或解決方案。
毫無疑問，對於蛋白質化學、生物化學的研究人員在蛋白質組學這一新興領域尋求最新的技術方法，本書是一部必備的實驗指南。而對於遺傳學、細胞生物學、分子生物學研究人員開展表型和細胞功能研究，以及醫學和生物工程領域開展蛋白質相關研究，本書也是基本的實驗工具書。
目錄
第1章 蛋白質組學導論
1.1 蛋白質組學定義
1.2 為何除基因組學外還要有蛋白質組學？
1.3 蛋白質的鑑定和分析
1.4 差異顯示蛋白質組學（比較蛋白質組學）
1.5 翻譯後修飾
1.6 蛋白質微陣列
1.7 捕獲分子和靶分子
參考文獻
網路資源
第2章 單向聚丙烯醯胺凝膠電泳
2.1 聚丙烯醯胺凝膠電泳的基本原理
2.2 SDS用於變性的聚丙烯醯胺凝膠
2.3 乙酸-尿素 PAGE根據蛋白質的大小和電荷分離蛋白質
2.4 三羥甲基甘氨酸 SDS-PAGE分離小分子多肽
2.5 非變性PAGE（自然凝膠電泳）分離天然蛋白和蛋白複合體
實驗方案
參考文獻
網路資源
第3章 細胞和亞細胞提取物的製備
3.1 通過機械或化學方法破碎組織及細胞
3.2 通過變性和復性從包含體中回收重組蛋白
3.3 富含目的蛋白的亞細胞提取物的製備
實驗方案
參考文獻
選讀文獻
網路資源
第4章 固相化pH梯度雙向凝膠電泳
4.1 雙向凝膠電泳樣品的製備
4.2 第一向：固相pH梯度等電聚焦電泳
4.3 第二向：根據分子量分離蛋白質
4.4 雙向凝膠的染色
4.5 雙向凝膠中蛋白質的轉移
4.6 雙向凝膠圖像的獲取和分析
實驗方案
參考文獻
第5章 反相高效液相色譜
5.1 RP-HPLC基於疏水相互作用分離分子
5.2 RP-HPLC標準色譜條件
5.3 微柱反相色譜——適合蛋白質組學的研究方法
實驗方案
參考文獻
選讀文獻
網路資源
第6章 蛋白質氨基端及羧基端序列分析
6.1 Edman降解法對多肽進行氨基端測序
6.2 限制序列分析速度的幾個環節
6.3 套用HPLC和PAGE製備微量測序樣品
6.4 不能進行測序的蛋白質需去封閉
6.5 磷酸化位點的微量測序分析有助於繪製信號途徑
6.6 固相測序儀是回收磷酸化胺基酸的最好方法
6.7 其他氨基端反應法
6.8 羧基端測序方法存在的問題
6.9 自動化羧基端測序
6.10 高靈敏度高效率的羧基端分析
6.11 氨基端和羧基端序列組合分析
實驗方案
參考文獻
選讀文獻
網路資源
第7章 電泳分離的蛋白質肽譜和序列分析
7.1 製備肽譜的微量方法和大規模方法
7.2 消除蛋白質分子內部的共價交聯以提高肽譜質量
7.3 酶法和化學法裂解多肽鏈
7.4 基於SDS-PAGE的肽譜製備方法（Cleveland法）
7.5 肽譜用於確定蛋白質中的二硫鍵
7.6 套用RP-HPLC製備肽譜
實驗方案
參考文獻
選讀文獻
網路資源
第8章 質譜在蛋白質組學中的套用
8.1 基本原理
8.2 現代離子化方法：離子如何形成
8.3 串聯質譜儀
8.4 串聯質譜儀的質量分析器結構
8.5 質譜與蛋白質分離方法聯用進行蛋白質混合物的分離和分析
8.6 體內及體外標記方法：質譜用於定量和表達蛋白質組學
8.7 利用MS數據鑑定蛋白質的搜尋引擎
8.8 總結
實驗方案
參考文獻
網路資源
第9章 用蛋白質組學方法繪製磷酸化位點圖譜
9.1 完整磷酸化蛋白的檢測和分析
9.2 通過蛋白質的裂解獲得磷酸化蛋白多肽
9.3 用MS或MS/MS來確定磷酸化蛋白的特性
9.4 用MS/MS對磷酸化多肽進行測序
9.5 對磷酸化蛋白特徵進行分析的多維策略
9.6 用於磷酸化多肽序列分析的MS和MS/MS技術的出現
9.7 總結
實驗方案
參考文獻
網路資源
第10章 蛋白質複合體性質的研究
10.1 mRNA的選擇性剪接對蛋白質產物活性的特定影響
10.2 用相互作用組描述生理複合體
10.3 利用酵母雙雜交分析與蛋白質組學方法研究蛋白質間相互作用
10.4 用親和捕獲技術分析蛋白質相互作用
10.5 了解多蛋白質複合體的結構
10.6 FRET分析體內蛋白質相互作用
10.7 通過測定結合常數來分析蛋白質間相互作用
10.8 蛋白質微陣列促進大規模的蛋白質研究
實驗方案
參考文獻
網路資源
第11章 蛋白質組學實驗結果的詮釋：利用生物信息學發現蛋白質的結構、功能及其相互作用
11.1 基因及其同源體的識別
11.2 預測蛋白質的結構和功能
11.3 蛋白質在通路中的定位和蛋白質細胞功能的識別
參考文獻
網路資源
附錄1 參考圖表
附錄2 技術
附錄3 注意事項
附錄4 供應商
索引
