分類
藍藻藍藻門分為兩綱：色球藻綱和藻殖段綱。色球藻綱藻體為單細胞體或群體；藻殖段綱藻體為絲狀體，有藻殖段。藍藻在地球上大約出現距今35～33億年前，已知藍藻約2000種，中國已有記錄的約900種。
形態特徵
藍藻其光合作用系統中具有葉綠素a和光系統Ⅱ，以水為電子供體，放出O2，而其他光合細菌的電子供體一般為H2、H2S和S，不產生氧氣。
一般說，凡含葉綠素a和藻藍素量較大的，細胞大多呈藍綠色。同樣，也有少數種類含有較多的藻紅素，藻體多呈紅色，如生於紅海中的一種藍藻，名叫紅海束毛藻，由於它含的藻紅素量多，藻體呈紅色，而且繁殖的也快，故使海水也呈紅色，紅海便由此而得名。藍藻雖無葉綠體，但在電鏡下可見細胞質中有很多光合片層，叫類囊體，各種光合色素均附於其上，是含有色素的膜性結構，大大增加了細胞內的膜面積，該結構的主要功能是：進行光合作用。
藍藻藍藻中央在光鏡下較周圍原生質層明亮，為遺傳物質DNA所在部位，相當於細菌的核區，稱為中心質或中央體。“中心質”常不位於中央，與周圍胞質無明確界限。藍藻DNA幾乎裸露，複製可連續進行。DNA平均含量比高等動物細胞還多。
藍藻細胞分裂時，細胞中部向內生長出新橫隔壁，將中心質與原生質分為兩半。一般情況下，兩個子細胞在一個公共的膠質鞘包圍下保持在一起，並不斷分裂而形成絲狀、片狀等多細胞群體。除此之外，藍藻還可以通過出芽、斷裂和復分裂等方式增殖。
內壁可繼續向外分泌膠質增加到膠鞘中。有些種類的膠鞘很堅密拌可有層理，有些種類膠鞘很易水化，相鄰細胞的膠鞘可互相溶和。膠鞘中可有棕、紅、灰等非光合作用色素。藍藻的藻體有單細胞體的、群體的和絲狀體的。最簡單的是單細胞體。有些單細胞體由於細胞分裂後子細胞包埋在膠化的母細胞壁內而成為群體，如若反覆分裂，群體中的細胞可以很多，較大的群體可以破裂成數個較小的群體。有些單細胞體由於附著生活，有了基部和頂部的極性分化，絲狀體是由於細胞分裂按同一個分裂面反覆分裂、子細胞相接而形成的。有些絲狀體上的細胞都一樣，有些絲狀體上有異形胞的分化；有的絲狀體有偽枝或真分枝，有的絲狀體的頂部細胞逐漸尖窄成為毛體，這也叫有極性的分化。絲狀體也可以連成群體，包在公共的膠質衣鞘中，這是多細胞個體組成的群體。
分布範圍
分布十分廣泛，遍及世界各地，但大多數（約75%）淡水產，少數海產；有些藍藻可生活在60～85℃的溫泉中；有些種類和菌、苔蘚、蕨類和裸子植物共生；有些還可穿入鈣質岩石或介殼中(如穿鈣藻類)或土壤深層中（如土壤藍藻）。繁殖方法
藍藻的繁殖方式有兩類，一為營養繁殖，包括細胞直接分裂（即裂殖）、群體破裂和絲狀體產生藻殖段等幾種方法，另一種為某些藍藻可產生內生孢子或外生孢子等，以進行無性生殖。孢子無鞭毛。至2018年尚未發現藍藻有真正的有性生殖。主要價值
藍藻據物理學家組織網報導，美國加州大學戴維斯分校的化學家通過基因工程對藍藻進行了改造，使其能生產出丁二醇，這是一種用於製造燃料和塑膠的前化學品，也是生產生物化工原料以替代化石燃料的第一步。相關論文發表在2013年1月7日的美國《國家科學院學報》上。
論文領導作者、加州大學戴維斯分校化學副教授渥美翔太（音譯）說：“大部分化學原材料都是來自石油和天然氣，我們需要其他資源。”美國能源部已經定下目標，到2025年要有1/4的工業化學品由生物過程產生。
生物反應都會形成碳—碳鍵，以二氧化碳為原料，利用陽光供給能量來反應，這就是光合作用。藍藻以這種方式在地球上已經生存了30多億年。用藍藻來生產化學品有很多好處，比如不與人類爭奪糧食，克服了用玉米生產乙醇的缺點。但要用藍藻作為化學原料也面臨一個難題，就是產量太低不易轉化。
研究小組利用網上資料庫發現了幾種酶，恰好能執行他們正在尋找的化學反應。他們將能合成這些酶的DNA（脫氧核糖核酸）引入了藍藻細胞，隨後逐步地構建出了一條“三步驟”的反應路徑，能使藍藻將二氧化碳轉化為2,3丁二醇，這是一種用於製造塗料、溶劑、塑膠和燃料的化學品。
渥美翔太說，由於這些酶在不同生物體內可能有不同的工作方式。在實驗測試之前，無法預測化學路徑的運行情況。經過3個星期的生長後，每升這種藍藻的培養介質能產出2.4克2,3丁二醇——這是迄今將藍藻用於化學生產所達到的最高產量，對商業開發而言也很有潛力。
渥美翔太的實驗室正在與日本化學製造商旭化成公司合作，希望能繼續最佳化系統，進一步提高產量，並對其他產品進行實驗，同時探索該技術的放大途徑。
危害
綠潮
藍藻藍藻等藻類是鰱、鱅的食物，可以通過投放它們來治理藻類，防止藍藻爆發（非經典的生物操縱）。
藍藻大量出現時，附近水體一般呈藍色或綠色，水面被厚厚的藍綠色湖靛所覆蓋，被風吹到岸邊堆積，不但會發出惡臭味，且含毒素的藍藻細胞在水體中漂游，當與某些懸浮物絡合沉澱，或被養殖對象捕食後隨其排泄物沉澱，在魚池池底富集，對無公害水產品生產會帶來巨大的負面影響。
藍藻中的項圈藻可快速產生致死因子，破壞養殖對象的鰓組織，干擾其新陳代謝的正常進行，麻痹神經，使其死亡。藍藻中個別種不但活體帶毒，而且死亡個體分解會產生生物毒素——藍藻毒素（如微囊藻毒素）。藍藻毒素量多時可直接造成養殖對象中毒死亡；或者即使數量少，也可通過食物鏈積累效應危害養殖對象，直至危害人體。
處理
首先，全池潑灑沸石粉10公斤/畝，使之絮凝藍藻；第二，間隔3—4小時後全池潑灑溶藻芽孢桿菌(側孢芽桿菌)，用量為500克/畝。注意使用微生物製劑過程中必須防止蟹池缺氧，天氣悶熱時不應使用，而使用時則應開動增氧機；第三，平衡氮磷比例，通過潑灑無機磷改變氮磷的比例，加快培育綠藻和硅藻等有益藻類快速生長成為優勢藻種來抑制藍藻生長，從而改善藍藻過度繁殖的狀況。原因
受其它藻種的生長制約，藍藻並不可能在常溫條件下大規模暴發，水溫25—35℃時，藍藻的生長速度才會比其他藻類快，故溫度是藍藻暴發的主要因素之一。養殖水體中富營養化，藍藻比較容易生長，所以不經常換水的池塘往往更容易暴發藍藻。有機磷是藍藻生長的必須因素，治理藍藻最直接最根本的辦法就是除去有機磷。藍藻暴發的成因為富營養化。過量的養分主要來自於以下這些源頭：1．化肥流失，化肥是很多富營養化區域的主要養分來源，例如在密西西比河流域，67%的氮流入水體，隨之流入墨西哥灣，波羅的海和太湖中超過50%的氮也來自化肥的流失。
2．生活污水，包括人類的生活廢水和含磷清潔劑。
3．畜禽養殖，畜禽的糞便含有大量營養廢物如氮和磷，這些元素都能導致富營養化。
4．工業污染，包括化肥廠和廢水排放。
5．燃燒礦物燃料，在波羅的海中約30%的氮，在密西西比河中約13%的氮來源於此。
6.藍藻使水體缺氧，使動物死亡，分解者分解是又消耗氧氣，造成惡性循環
毒素
藍細菌是藍藻的學名，在部分藍藻內部的特定區域存有藻毒素，藍藻毒素內分為很多種，通過其危害方式可分為肝毒素和神經毒素，它們是已知的會侵襲肝臟和神經的毒素，另一類毒素對皮膚有刺激作用。當藍藻細胞破裂或死亡時，毒素就會被釋放到水中，當暴露在含有藍藻毒素的湖水中，雖然一部分人會生病，但是飲用含有受污染藻類的水卻未必會導致死亡。長期地暴露在含有藍藻肝毒素的水中，即使含量較低，也有可能對人體產生長期的或慢性的不利影響，如果你不斷的攝入含有藍藻的水，魚或者其他水產品，就可能會產生頭痛，發燒，腹瀉，腹痛，反胃或者嘔吐。如果你在受污染的水中游泳，也有可能會產生皮膚發癢或者眼睛、皮膚受到刺激，如果你懷疑直接接觸到了污染水源並且身體發生了不良反應，用乾淨水沖洗身體並立即聯繫醫生，煮沸的水不會去除藍藻中的毒素，因為你不可能憑藉水的外表，氣味或者味道去檢測毒素的存在，只有化學測試才可以，如果條件允許，不要使用受污染水洗衣服和餐具，如果實在沒有其他水源，做家務要用水時必須戴上橡膠手套，使用受污染水洗澡應該避免，因為皮膚直接接觸水會造成皮膚刺激和皮疹）藻毒素具有水溶性和耐熱性。易溶於水，甲醇或丙酮，不揮發，抗PH變化。MC-LR的分子式為C49H74N10O12，分子量為995.2（計算時往往按1000計)。
其在水中的溶解性大於1g/L，化學性質相當穩定。在水中藻毒素自然降解過程是十分緩慢的，當水中的含量為5ug/L時，三天后，僅10%被水體中微粒吸收，7%隨沙沉澱。藻毒素有很高的耐熱性，加熱煮沸都不能將毒素破壞，也不能將其去除；自來水處理工藝的混凝沉澱、過濾、加氯也不能將其去除。有調查試驗研究表明在某湖周圍3個自來水廠的出廠水中檢出低濃度的藻毒素(128～1400ng/L)，結果提示採用常規的飲水消毒處理不能完全消除水體中的藻毒素。
它是一種肝毒素，這種毒素是肝癌的強烈促癌劑。
家畜及野生動物飲用了含藻毒素的水後，會出現腹瀉、乏力、厭食、嘔吐、嗜睡、口眼分泌物增多等症狀，甚至死亡。病理病變有肝臟腫大、充血或壞死，腸炎出血、肺水腫等。
對於人類健康，微囊藻毒素也具有很大危害性。其中MC-LR的半致死劑量（LD50）約為50~100ug/kg。人們在洗澡、游泳及其他水上休閒和運動時，皮膚接觸含藻毒素水體可引起敏感部位(如眼睛)和皮膚過敏；少量喝入可引起急性腸胃炎；長期飲用則可能引發肝癌。流行病學研究顯示，慢性MC染毒引起了巢湖漁民實質性的肝損傷。醫學部門已發現飲水中微量微囊藻毒素與人群中原發性肝癌的發病率有很大相關性。1996年在巴西造成100多名急性肝功能故障，7個月內至少50人死於藻毒素產生的急性效應，引起舉世矚目的關注。淡水水體中的藍藻毒素已成為全球性的環境問題，世界各地經常發生藍藻毒素中毒事件。
UV－B（紫外線B波段，波長275～320nm，又稱為中波紅斑效應紫外線。中等穿透力，日光中含有的中波紫外線大部分被臭氧層所吸收，只有不足2%能到達地球表面，在夏天和午後會特彆強烈。）可以破壞藍細菌的運動性和趨光性，可以影響許多其他的生理和生化過程，這將導致生產力的降低，發芽和分化的破壞。光合色素會被UV－B漂白，光捕獲複合體的結構受到影響，這些都會損壞光合作用。
DNA和蛋白質的主要作用位點、氮代謝中的酶對於UV－B表現出不同的敏感性。UV對固氮酶和谷氨醯氨合成酶的活性產生抑制，但會提高硝酸還原酶的活性（當暴露在認為的UV－B下）。UV－B也會影響基本的光合作用的反應和二氧化碳的吸收。Synechococlus通過快速改變光合系統中酶的形式來抵抗UV。這種分子的可塑性在種群水平上來的抵抗UV－B是非常重要的，這使得光合系統對UV－B的敏感性每天都在改變。然而，光合作用可以被UV－A合藍光所激活。
藍細菌已經發展了對於UV－B的影響的對策。這包括：a、產生象MAAs類的光保護物質b、通過遷移到避光的地帶來逃避UVc、產生猝滅物質如類胡蘿蔔素和超氧化物d、修復機制象光活化和光獨立的DNA修復e、激活抗氧化酶。UV－B在許多藍細菌中誘導了MAAs的產生。在Anabaenasp中顯示只有在290nm的光可以誘導MAAs。除了光保護作用外，MAAs還具有調節滲透壓和抗凍作用。其他的UV－A激活物質也被發現。在藍細菌和藻類中的光保護物質已經建立了資料庫。
南極的藍細菌形成大的蒲狀菌落。UV－B對於Leptolyngbya的菌落具有很強的光化學抑制作用，但是不如對Phormidium的抑制作用大。後者包括了比前者多25倍的MAAs和2倍的類胡蘿蔔素。Rai和同事研究了UV－B和重金屬污染之間的關係對於氮固定的作用，並發現二者具有協同性。
大事件
2007年5月28日起，無錫太湖區域藍藻大面積爆發,引發無錫市自來水嚴重污染，市區純淨水被哄搶,政府雖及時採取措施，但已經對人民的生活產生很大的影響。2010年11月29日，雲南昆明滇池藍藻大量繁殖，在昆明滇池海埂一線的岸邊，湖水如綠油漆一般。 綠浪翻滾的湖水湧向岸邊，帶來一陣陣腥臭氣味。滇池是雲南九大高原湖泊中污染最嚴重的一個，每當氣溫上升，加之富營養化嚴重，均要引起藍藻爆發，造成嚴重污染。
2011年8月21日，受持續高溫影響，安徽巢湖局部湖面藍藻又開始“抬頭”，出現較大面積藍藻集聚。巢湖市高度關注城市集中式飲用水水源地水質狀況，開展藍藻攔截、打撈和自來水深度處理措施。
從2008年開始，南昌市城區範圍內水域面積較大的景觀湖泊青山湖連續6年遭遇藍藻侵襲，尤其是2014年，藍藻已經爆發數十次。2014年10月27日，儘管已經進入深秋，氣溫較低，但青山湖湖面依舊爆發藍藻，數百畝湖面如同被潑灑綠漆，腥臭味隨風襲來，不少人掩鼻而過。據悉，這6年來，南昌市都會投放生石灰、生物再生殺菌劑等以淨化湖水、消殺藍藻，但收效甚微。
2016年7月17日，美國猶他州中毒控制中心接收了100多名中毒者，他們伴有嘔吐、腹瀉、高燒以及皮膚或眼部刺激、過敏等症狀。經研究發現，該現象或與猶他湖中藍藻細胞的爆發式增長有關。
猶他湖中藍藻面積達湖面總面積的90%，儘管面積正在縮小，事實上卻更危險。各級政府對此採取了相應措施。政府人員稱，至2017年還無法證實藍藻爆發與這些症狀之間的直接關係，但該症狀與藍藻細胞中毒的症狀相符。
世界衛生組織和猶他州衛生署條例規定，藍藻細胞數量的中度危險標準為10萬。而7月14日湖水抽樣發現，大部分樣本都超出了這一標準的3倍，其中一份樣本甚至包含了超過70萬的藍藻細胞。藍藻細胞在死亡時會向水中釋放更多的有毒物質，使得水中的毒細胞儘管數量減少，但卻更為致命。
