藏曆第四繞回木龍年，應元世祖忽必烈之孫科端的邀請攜侄子卓貢帕巴（巴思巴）和恰那一起去涼州（今甘肅武威）會見科端，建立了受施者與施主關係，商定了在西藏委任官員和攤派差役的辦法，並兩次給西藏僧俗官員寫信召安，將西藏置於元朝管轄之下。
雪域三大文殊之薩迦班智達
班智達的稱號來源於印度，意思是學識淵博的大學者。薩迦班智達·貢嘎堅贊是西藏佛教史上第一位被譽為班智達者，由於精通五明、智慧無比，因此被稱為雪域三大文殊化身之一。薩迦班智達·貢噶堅贊，於藏曆第三饒迥木虎年(公元1182年)出生在昆氏家族。據《薩迦世系史》記載，在投胎和出生之時，就充滿了神奇的瑞兆。出生後，即能講說印度梵語。由於天資聰穎，加上師長的培養、自己的努力以及家庭的薰陶，薩迦班智達在成年的時候，就已經精通了大小五明，成為著名的學者。據說薩班的學習過程本身就是一種奇蹟。他不但依照常理，跟隨老師學習經論，而且即使在夢中也同樣得到非凡的教導。有一次，他夢到自稱是印度世親菩薩的人，為他講授《俱舍論》，達一月之久。醒來以後，對於《俱舍論》則完全通達，甚至超過平時所學。還有一次夢到有人將印度陳那論師的經論寶庫之鑰交給他，從此，他對於因明雖然沒有經過刻苦的學習，就能精通。如此神異之學習經歷，極其眾多。
薩迦班智達在依止上師方面也是後學的典範。他在依止上師扎巴堅贊學習的時候，由於是他的叔叔，因此，並沒有按照密法的規矩將上師看作佛陀。當他向上師求上師瑜伽修法的時候，扎巴堅贊說：“你只是把我看作你的叔叔，而沒有視為佛陀，因此，暫時無法傳授上師瑜伽給你。”於是，薩迦班智達得到啟發，將叔叔看作真實的佛陀。後來在扎巴堅贊生病的時候，無微不至地照看。因此薩班常說：“我之所以精通因明、聲明等五明以及般若、俱舍等五部大論、密續，人神共敬，並且元朝皇帝等許多有權勢的人也向我求法，敬重我，都是源自我視師如佛、如法學修所致。”
薩迦班智達不但是一位學識卓越、修證有成的佛教大師，而且對西藏有特殊的貢獻。在十三世紀30年代，元太宗窩闊台執政期間，闊端駐守在涼州（今甘肅武威），有意進攻西藏。後派大將達爾汗台吉帶兵，曾進兵至藏北熱振寺附近。西藏地區各教派的領袖人物，看到這種形勢後，就協商如何應付強大的蒙古軍隊。最後，大家共同推舉薩迦班智達同蒙古談判。大約在公元1244年，薩迦班智達已年屆63歲，帶著10歲的八思巴和6歲的恰那多吉這兩個侄子，從薩迦寺動身前往涼州。 經過千辛萬苦的兩年跋涉，終於在1246年8月抵達涼州。闊端與薩迦班智達見面後，深深被他的智慧以及學識品德所折服，答應不再進攻西藏，並邀請薩班前去蒙古傳授佛法。由此，通過薩班的努力，西藏避免了一場生靈塗炭的浩劫。
雖然闊端王皈依了佛法，對薩班也非常佩服，但曾經懷疑薩迦班智達的修證成就，因此請了無數大師來試探薩班。有一次，闊端王請來一個魔術師，在湖面上變出一座宮殿，中央以大藏經堆成法座，法座四周以綢緞包裹，然後請薩班前來登座講法。如果薩班沒有神通成就，定然跌落湖中。據說薩迦班智達前來一看，就識破幻術，當即運用神通加持宮殿，成為一座真正的寺院，這就是著名的幻化寺（現在改為白塔寺）。
藏曆第四饒迥金豬年(公元1251年)九月八日，涼州發生了強烈地震，弟子比吉拉傑詢問薩班是何原因，薩班回答說：“此乃為大德們前去利他之預兆，我亦將追隨諸大德之後。”從這句話可斷定，薩班已經預感到不久將要離開人世。十一月十四日黎明時分，一代高僧薩迦班智達圓寂於幻化寺，享年70歲。二十五日，弟子們將薩班的遺體進行了火葬處理。
據《安多政教史》記載，火化時，頭蓋骨顯現喜金剛、文殊菩薩、勝樂、佛陀等佛像，膝蓋骨正面顯現了觀音菩薩、度母、不動佛等佛像，手指骨上顯現了彌勒佛像以及藏文“阿”字和“得” 字，兩耳骨上顯現出了尊勝塔像，並出現了許多舍利。
著作
著有《三律儀論》、《正理藏論》、《智者入門》、《薩迦格言》等眾多名著。藏曆第四繞回鐵豬年，手執金剛杵與金鈴交叉置於胸部法輪處，頓時金光四射，吉兆滿天，班智達暫收幻身，圓寂歸天。享年七十歲。火化遺體時，煙霧升天，化為彩虹。送葬者均聞仙樂鳴聲。骨灰化為許多舍利，三福田布滿四方。
