抗戰初期,學校遷往沙縣。民國27年,省福高二年級學生赴農村參加“民訓”工作,薛承健到連江縣農村辦農校,組織農民識字,宣傳抗日。期滿,當地民眾贈其“喚起民眾教育有方”錦旗一面。
民國29年,考取福建省立農學院森林學系。翌年,他參加教育部主辦的全國大學各科系學術論文競賽,榮獲森林系第一名,得獎章一枚。民國33年,薛承健畢業,就任省農林研究所技士。戰時省會永安物價一日數漲,公務員待遇微薄,為承擔弟輩學習費用,他過著節衣縮食的生活。
抗戰勝利,台灣光復。應台灣省林業試驗所所長、植物學家林謂訪之邀,他於民國35年赴台灣從事林業研究,歷任技士、技正,並先後兼任該所纖維木酥系及森林生物系主任,主持木材工藝、製漿方法和森林調查等工作。著有《台灣木材之研究》、《馬尾松木漿製造研究》等,受到林業界同仁推崇。
1951年,經台灣省中國農村復興聯合會甄選,赴美國考察林業技術。一年中,他先後訪問美國許多林業機構,考察其組織和教研活動。美國森林木材業管理研究負責人貝特博士說:“薛先生的主要興趣在決定森林測量方法的正確性,是位統計方面的專家。”回到台灣後,薛承健以其研究成果結合台灣林業實際撰寫《台灣主要林型調查計畫》。此文後在台灣林業界影響極大。
1954年,薛承健獲得美國明尼蘇達州立大學獎學金,再度赴美國深造。翌年,獲該校森林學碩士。1957年又獲森林學博士。嗣後,歷任該校講師、副教授、教授。
因薛承健在林業科學方面造詣精深,美國林業部門曾先後邀他參加林業學會等6個學術團體。隨後,他代表美國林業學會參加世界森林學會會議。
薛承健在擔任美國林務署大湖區林業試驗場顧問期間,設計《森林調查試驗計畫》,經過兩次實地調查試驗,效果良好。論文發表後,其姓名和成就被列入《美國科學名人錄》、《美國中西部名人錄》。
1961年初,薛承健患食道癌,仍抱病上課,經親友多次規勸才住院動手術。出院後仍堅持上班。5月,癌病復發,於6月5日逝世。
薛承健在美國中西部和台灣,曾被同行譽為“林業全才”、“森林統計權威”。他病逝後,美國明尼蘇達州立大學和台灣林業試驗所先後舉行隆重的追悼會。明尼蘇達州的報刊、電台對此曾作報導。美國維琴尼亞理工學院、州立大學森林系教授登里斯·豪爾博士評介說:“他是第一個利用套用系統隨機取樣法來測估統計的有效法。這個概念極受重視,且後來廣泛地套用在森林調查試驗計畫上……”。台灣林業試驗所林謂訪所長稱讚:“薛博士才智超特,其對森林學之鑽研與貢獻尤為膾炙人口,而且譽滿美國,澤及林業。”
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