學術科研
董萬利研究神經自身免疫病和感染性疾病、腦血管病等，主持國家級、省、市級課題6項。近年來“多發性硬化的自身免疫機制實驗和臨床研究”等獲江蘇省科技進步三等獎1項，省衛生廳科技進步二等獎1項，蘇州市科技進步二等獎1項、三等獎2項及江蘇省新技術引進獎2項，蘇州大學周氏教育科研優秀獎2項，蘇州大學教學成果二等獎1項，優秀論文獎2項，共12項。發表論文150餘篇，其中SCI10篇參編專著8部。已培養畢業研究生28名。
社會兼職
中華醫學會江蘇省神經專業委員會委員，中華醫學會蘇州神經內科專業委員會副主任委員。江蘇省中西醫結合學會疼痛專業委員會副主任委員。中國阿爾茨海默病協會委員，World Stroke Organization of WSO和 New York Academy of Sciences會員。
《中國組織工程研究與臨床康復》執行編委，《神經疾病與精神衛生》、《中國腦血管病雜誌》、《中國血液流變學雜誌》、《中華腦血管病雜誌（電子版）》，《中華醫學實踐雜誌》，《中華中西醫雜誌》和《中華國際系列醫學雜誌》編委。《中華醫學雜誌（英文版）》、《中華神經科雜誌》、《中華臨床醫師雜誌》（電子版）審稿專家。《中華醫學會繼續醫學教育教材》編委會神經病學編委.
