信息輸入
從脊髓腰骶部第一層和第五層發出的脊髓丘腦束（STT）細胞投射到腹側基底核叢（VB）的腹側後外側核（VPL）區。脊髓頸部區域STT細胞最密集的，並且從背角部投射到腹側後外側核（VPL）。 對VB的大部分投射通路是對側的，只有少數投射通路是同側的。
腹側基底核叢（VB）的興奮性信息來自內側丘系（ML）和皮質丘腦（CT）谷氨酸能突觸。 ML是感覺傳入輸入，CT是來自第六層的初級感覺皮層。
腦幹中釋放活性的乙醯膽鹼（ACh）的區域也向腹側基底核叢（VB）傳入信息中。
有兩種傷害性神經元向腹側基底核叢（VB）輸入信息：傷害性特異性（NS）神經元和廣動力閾神經元（WDR）。
信息輸出
腹側基底核叢主要從初級軀體感覺皮質輸出信息。
腹側基底核叢調質
菸鹼型乙醯膽鹼受體
菸鹼乙醯膽鹼受體（nAChRs）存在於腹側基底核叢（VB）中， 每個nAChR由不同的亞基組成，包含亞基α4、α5、α7和β2，這使該類受體對不同的刺激產生反應。 當nAChR被激活時，來自皮質丘腦（CT）神經元的谷氨酸能突觸傳遞減少， 當通過激活nAChRs減少皮質丘腦（CT）突觸傳遞時，腹側基底核叢（VB）中激活的nAChRs可以通過內側丘系選擇性地增強到軀體感覺皮質的信息。
GABAb受體
GABAb受體位於腹側基底核叢（VB）中。 如果該受體處於突觸前，被激活時，它會導致抑制神經遞質的釋放，如果該受體位於突觸後，那么當受體被激活時，受體引起抑制性突觸後電位。
