基本概念
腦指數是一種比腦部身體質量比值更為精確的測量方式，因為它考慮到了異速生長的因素。腦指數的關係與公式只適用於哺乳動物，不適用於其他動物。
腦的相對大小的變化
在動物進化史上，腦或神經系統的大小與動物行為的複雜程度是相關的。有人主張用腦的相對大小來衡量腦的進化水平。腦的大小與身體大小的比值可以說明腦的進化水平。下表是用腦指數標明的一些哺乳動物的腦的大小的變化。
| 常見的幾個物種腦的大小的比較 | ||
| 物種 | 腦容積（毫升） | 腦指數 |
| 鼠 | 2.3 | 0.40 |
| 貓 | 25.3 | 1.01 |
| 羅猴 | 106.4 | 2.09 |
| 猩猩 | 440.0 | 2.48 |
| 人 | 1350.0 | 6.30 |
在上表中，腦指數是用腦的實際大小與預期腦的大小的比值來表示的。所謂預期大小是指哺乳動物腦的大小的平均值，它考慮了腦重於體重的關係。哺乳動物腦重與體重的平均比值為1.0，如貓。如果某種動物的體重是貓的體重的兩倍，腦的重量也是貓腦重量的兩倍，那么，它的腦指數（EQ )便是1.0。從表中看到，隨著進化階梯的上升，腦指數是逐漸上升的，人腦的EQ約為猩猩腦的2.54倍，約為鼠腦的15倍。
腦與身體大小的關係
一般而言，動物腦的大小應隨身體變大而增大（呈正相關），體型較大的動物應有比小動物更大的腦部。但這樣的關係不是線性的，小動物的腦部占身體的比例較大型動物為大，即擁有相對較大的腦部，老鼠的腦部身體質量比為1/40（接近人類的比值），而大象雖然智力甚高，其腦部身體質量比卻小的多，只有1/560。導致這種趨勢的原因有很多，其中之一可能是神經元的大小固定，當動物的腦部變大時，神經元的增加導致腦部增加的比例較身體其他部分的增加為少，這種現象引入了「頭部集中化指數」（cephalization factor）；E = CS2，其中E與S分別是身體與腦部的質量，而C是頭部集中化指數。但只考慮身體和腦部的關係是不夠的，應同時考考動物全身的大小。為了彌補這個因素，已想出了一個新的原則，通過描述各種相互不同的哺乳動物的腦部身體質量比並通過曲線擬合以便更好地符合資料。
動物的智力很難確定，但是腦部的大小與身體是有關聯的，更大的大腦能夠有效的完成更加複雜的認知任務。EQ公式，相比較簡單的測量動物的腦重或腦重與體重的比值,能夠更好的區分動物智力水平的高低。
