肖景發

肖景發,1998年起在吉林大學攻讀博士學位, 主要進行大氣中重要化學反應的機理研究。

簡 介

職 稱: 副研究員
職 務: 碩士生導師
研究方向: 生物信息學
肖景發博士1998年起在吉林大學攻讀博士學位, 主要進行大氣中重要化學反應的機理研究,在Journal of Physical Chemistry, Journal of Computational Chemistry和Phys. Chem. Chem. Phys等專業雜誌發表論文十餘篇。2003年起在協和醫科大學藥物所從事糖尿病相關靶點的計算機輔助藥物分子設計研究, 其中關於蛋白質酪氨酸磷酸酯酶藥物分子設計已經申請到自然科學基金的資助(抗糖尿病的新型PTP 1B抑制劑的設計、合成及構效分析), 先後在Journal of Molecular Graphics and Modelling、Protein Engineering和Bioorganic & Medicinal Chemistry等專業雜誌發表相關論文數篇。2005年起在猶他大學化學系從事計算分子生物學的研究,主要的研究課題是同源模建分子對接算法發展和套用, 並參加NCF-Information Technology Research項目Computational Science and Engineering Online研究。其中發展的軟體CSE-Online已經得到計算科學領域的工作者廣泛套用。2007起到中國科學院北京基因組研究所, 主要從事生物信息學和計算生物學等方面的研究。
91年考入四川大學生物系生物學專業,
98年考入吉林 大學理論化學國家重點實驗室攻讀博士,
於2003年7月獲得 理學博士學位。
於2003年-2005年在協和醫科大學藥物所 進行博士後研究。
於 2005年-2007年在美國猶他大學化學系進行博士後研究工作。
2007年到中國科學院北京基因組研究所工作。

主要研究領域:

目前的研究工作主要有以下四方面:
(1)重要動植物和微生物的比較基因組學和轉錄組學研究;
(2)小蛋白的結構功能、進化以及調控機制等相關的生物信息學研究;
(3)密碼子進化研究;
(4)利用同源模擬,分子對接, 虛擬篩選, 以及定量構效關係等方法實現計算機輔助藥物分子設計;研究藥物與靶標蛋白之間、蛋白與蛋白之間的相互作用機理。

代表論著:

1.Jingfa xiao, Jun Yu. An organization and evolution of the genetic code, Sci China Ser C-life Sci. 2009, 39, 717 - 726
2.Fengyu Wang, Jingfa Xiao*, Linlin Pan, Ming Yang, Guoqian Zhang, Yun Yu. A Systemic Study of Mini-proteins in Bacterial and Archaea. PLOS one. 2008, 3, e4027.
3.Jingfa Xiao,Jun Yu. A Scenario on the Stepwise Evolution of the Genetic Code. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 5, 143-151, (2007).
4.Jingfa Xiao, Thanh N. Truong. A theoretical study to investigate HHR3/HHR4 selectivity: Receptor modeling and molecular docking of histaminergic ligand. Abstr. Pap. Am. Chem. Soc. 2006, 232, 293-COMP.
5.Jingfa Xiao, ZongruGuo, YanShen Guo, et al, Computational Study of Human Phosphomannose Isomerase: Insights from Homology Modeling and Molecular Dynamics Simulation of Enzyme Bound Substrate. J. Mol. Graph. Model.25, 289, (2006).
6. Jingfa Xiao, ZongruGuo, Yanshen Guo, et al, Inhibitory mode of pyrazolo[1,5-b]pyridazin series derivatives against GSK-3: molecular docking and 3D-QSAR analyses. Protein. Eng. Des. Sel. 19, 47, (2006).
7.Jing-Fa Xiao, Ze-Sheng Li, Miao Sun, et al, Homology modeling and molecular dynamics study of GSK3/shaggy-like kinase. Comp. Bio. Chem. 3, 179, (2004).
8.Jing-Fa Xiao, Ze-Sheng Li, Chia-Chung Sun. Homology modeling and molecular dynamics studies of a novel C3-like ADP-ribosyltransferase. Bioorganic. Med. Chem. 12, 2035, (2004).

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