一、普通耐熱DNA聚合酶
1.Taq DNA 聚合酶
由一種水生棲熱菌yT1株分離提取出，是發現的耐熱DNA聚合酶中活性最高的一種，達200,000單位/mg。具有5'-3'外切酶活性，但不具有3'-5'外切酶活性，因而在合成中對某些單核苷酸錯配沒有校正功能。
TaqDNA聚合酶還要具有非模板依賴性活性，可將PCR雙鏈產物的每一條鏈3'加入單核苷酸尾，故可使PCR產物具有3'突出的單A核苷酸尾；另一方面，在僅有dTTP存在時，它可將平端的質粒的3'端加入單T核苷酸尾，產生3'端突出的單T核苷酸尾。套用這一特性，可實現PCR產物的T-A克隆法。
2.Tth DNA 聚合酶
從Thermus thermophilus HB8中提取而得，改酶在高溫和MnCl2條件下，能有效地逆轉錄RNA；當加入Mg2+後，該酶的聚合活性大大增加，從而使cDNA合成與擴增可用一種酶催化。
二、高保真DNA聚合酶
1.pfu DNA 聚合酶
是從Pyrococcus furiosis中精製而成的高保真耐高溫DNA聚合酶，它不具有5'-3'外切酶活性，但具有3'-5'外切酶活性，可校正PCR擴增過程中產生的錯誤，使產物的鹼基錯配率極低。PCR產物為平端，無3'端突出的單A核苷酸。
2.Vent DNA 聚合酶
改酶是從Litoralis棲熱球菌中分離出的，不具有5'-3'外切酶活性，但具有3'-5'外切酶活性，可以去除錯配的鹼基，具有校對功能。
三、DNA序列測定中套用的耐熱DNA聚合酶
1.Promega公司測序級TaqDNA聚合酶
是在TaqDNA聚合酶的基礎上對它進行修飾，去除5'-3'外切酶活性，保證測序記過的高度準確性，可產生強度均一的測序條帶，背景清晰。
2.Bca Best DNA 聚合酶
從Bacillus Caldotenax YT-G菌株中提純，並使其5'-3'外切酶活性缺失的DNA聚合酶。它的伸長性能優越；可抑制DNA二級結構形成，可以得到均一的DNA測序帶。
3.Sac DNA 聚合酶
從酸熱浴流化裂片菌中分離，無3'-5'外切酶活性，可用於DNA測序，但測序反應中ddNTP/dNTP的比率要高。
