概念
“糞菌移植”（Fecal microbiota transplantation，FMT），其定義是，將健康人糞便中的功能菌群，移植到患者胃腸道內，重建具有正常功能的腸道菌群，實現腸道及腸道外疾病的治療。在國際合作組對此詞進行統一之前，也被少數人稱為Fecal transplantation、Fecal bacteriotherapy和Intestinal microbiota transplantation，少數情況下被譯為“糞便移植”、“糞菌治療”和“腸菌移植”或“腸微生態移植”。
糞菌移植醫學史
2012年，張發明等在The American Journal of Gastroenterology雜誌從醫學史的角度進一步回顧了糞菌移植的發展史，將用糞菌移植治療人類疾病的歷史文獻記載，從原來西方公認的1958年，改寫成1700以前，還指出了糞菌移植在現代醫學中的發展方向。中國傳統醫學有用人糞治療人疾病的記載。公元300年至400年間，東晉時期，葛洪《肘後備急方》（也稱《肘後方》）記載，用人糞清治療食物中毒、腹瀉、發熱並瀕臨死亡的患者。述“飲糞汁一升，即活”，可見有奇效。《肘後備急方》是中國第一本急症醫學書籍，也是世界上最早記錄青蒿作為瘧疾患者的“救命草”的文獻。用人糞便治療多種消化道急危重症的套用，在明朝幾乎達到極致。李時珍所著《本草綱目》（1596年出版），記載用人糞治病的療方多達二十多種。鑒於糞菌移植的關鍵原理，是移植供者糞便中健康的菌群，所以，發酵糞便的上清液、新鮮糞汁和小兒糞，都可理解為含有糞便菌群。以此邏輯和循證方法，可以判斷，最早用人糞便治療人的疾病文獻記載，可能是《肘後備急方》。也就是說，人糞便移植或者糞菌移植至少有1700年的歷史。這一醫學史的發現，在《美國胃腸病學雜誌》於2012年11月發表後，很快引起美國、歐洲專家重視，並在《新英格蘭醫學雜誌》、《美國胃腸病學雜誌》、《消化內鏡》等雜誌的大量論文引用。
